苏州细胞荧光定量PCR原理及步骤
聚合酶链式反应的试验污染:PCR反应的很大特点是具有较大扩增能力与极高的灵敏性,但令人脑袋不适的问题是易污染,极其微量的污染即可造成假阳性的产生。污染原因:标本间交叉污染:标本污染主要有收集标本的容器被污染,或标本放置时,由于密封不严溢于容器外,或容器外粘有标本而造成相互间交叉污染;标本核酸模板在提取过程中,由于吸样污染导致标本间污染;有些微生物标本尤其是病毒可随气溶胶或形成气溶胶而扩散,导致彼此间的污染。PCR试剂的污染:主要是由于在PCR试剂配制过程中,由于加样、容器、双蒸水及其它溶液被PCR核酸模板污染。如果基因的基因组DNA序列是已知的,逆转录-聚合酶链反应可以用来绘制基因中外显子和内含子的位置。聚合酶链式反应中要确保反应缓冲液融化完全并彻底混匀。苏州细胞荧光定量PCR原理及步骤
Real-time PCR双荧光标记探针设计原则:具体的其他要求可以具体联系设计公司,拿到合成好的引物,需要先确认引物的性能。可以用这对引物先扩增梯度稀释后的标准品(标准品介绍见后续内容)。由不同梯度标准品的加量和其对应的Ct值,描绘出一条标准曲线。这里要注意根据标准曲线得到的参数是非常重要的。引物性能确认:1.决定系数R2大于0.98,越接近于1,结果越可靠。2.扩增效率一般要求在0.8-1.2,越接近于1,越好。3.检测的灵敏度,必须确认,通常要求35个循环以内,一般可以得到比较好的定量结果,30个循环以内,没有非特异性扩增产生。4.NTC是必须要确认的,通常要求30个循环内没有引物二聚体产生。武汉微量PCR检测技术应用实时荧光定量PCR是一种采用外标准曲线定量的方法。
Real-time PCR链反应的常见问题分析与解决方法:反应缓冲液未完全融化或未充分混匀。确保反应缓冲液融化完全并彻底混匀。引物特异性差。利用BLAST检查引物特异性或重新设计引物。引物量过多。减少反应体系中引物的用量。模板量过多。质粒DNA的用量应<50ng,而基因组DNA则应<200ng。外源DNA污染。确保操作的洁净。阴性对照出现条带:试剂,头,工作台污染。使用全新的试剂和头,对工作台进行清洁。条带大小与理论不符:污染。使用全新的试剂和头,对工作台进行清洁。模板或引物使用错误。更换引物和模板。基因亚型。对研究的基因进行序列分析和BLAST研究。逆转录-聚合酶链反应较广用于表达谱,以确定基因的表达或鉴定RNA转录物的序列。
Real-time PCR的染料法和探针法的选择:进行mRNA表达量的测定,采用染料法是比较经济实惠的;染料法可以通过比较熔解曲线的熔解峰位置得到产物特异性的情况;目的基因和内参基因分管检测,染料法可以选用Realtime染料PCRPreMIX,探针法主要应用于病毒RNA的检测;以及单位点突变(SNP);多基因的合并检测,探针法还可用于同一个反应中同时检测目的基因和内参基因的情况;而染料法则必须分管检测。Real-time PCR:实时荧光定量PCR技术(Real-timequantitativePolymeraseChainReaction简称Real-time PCR)是在定性PCR技术基础上发展起来的核酸定量技术。实时荧光定量在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,使每一个循环变得“可见”,之后通过Ct值和标准曲线对样品中的DNA(orcDNA)的起始浓度进行定量的方法。聚合酶链反应具有定量合成产物的优点。
Real-time PCR原理:所谓实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。DNA结合染料法,应用一种带有荧光的、非特异的DNA结合染料检测PCR过程中积累的扩增产物。检测所有双链DNA扩增产物,包括非特异反应产物,如引物二聚体。可对任何双链DNA进行定量;不需要探针,因此减少了实验设计及运转成本;适合于大量基因的分析;简单易用。实时荧光定量PCR:实时荧光定量PCR(QuantitativeReal-time PCR)是一种在DNA扩增反应中,以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应(PCR)循环后产物总量的方法。通过内参或者外参法对待测样品中的特定DNA序列进行定量分析的方法。Real-time PCR是在PCR扩增过程中,通过荧光信号,对PCR进程进行实时检测。由于在PCR扩增的指数时期,模板的Ct值和该模板的起始拷贝数存在线性关系,所以成为定量的依据。热启动聚合酶链式反应:一种在PCR的初始建立阶段减少非特异性扩增的技术。广州组织Real-time PCR设计公司
在PCR产物中,由于内标与靶模板的长度不同。苏州细胞荧光定量PCR原理及步骤
Real-time PCR实验常用的RNA酶抑制剂:1.焦磷酸二乙酯(DEPC):是一种强烈但不彻底的RNA酶抑制剂。它通过和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环结合使蛋白质变性,从而抑制酶的活性。2.异硫氰酸胍:目前被认为是较有效的RNA酶抑制剂,它在裂解组织的同时也使RNA酶失活。它既可破坏细胞结构使核酸从蛋白中解离出来,又对RNA酶有强烈的变性作用。3.氧钒核糖核苷复合物:由氧化钒离子和核苷形成的复合物,它和RNA酶结合形成过渡态类物质,几乎能完全抑制RNA酶的活性。4.RNA酶的蛋白抑制剂(RNasin):从大鼠肝或人胎盘中提取得来的酸性糖蛋白。RNasin是RNA酶的一种非竞争性抑制剂,可以和多种RNA酶结合,使其失活。5.其它:SDS、尿素、硅藻土等对RNA酶也有一定抑制作用。苏州细胞荧光定量PCR原理及步骤
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