上海全质粒测序高通量测序服务

时间:2022年08月10日 来源:

真核/原核有参mRNA-Seq,项目介绍:转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的gather,狭义上指所有mRNA的gather。转录组是研究基因表达的主要手段,是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的纽带。转录水平的调控是生物体重要的调控方式,通过转录组测序分析转录水平的调控,是目前运用较多的研究方式。测序使用Illumina Xten平台,测序原始数据经过质控后,mapping至参考基因组序列,对mapping到基因上的reads进行计数,计算基因的表达量后,进行基因表达差异及差异基因GO、KOG(原核生物为COG)、KEGG功能富集分析,KEGG pathway等分析。对于多个样本,可进行重复相关性检查、共表达分析、PCA主成分分析。另外,依据参考基因组,可进行诸如基因覆盖度、测序饱和度等验证性分析;可变剪切分析、SNP/InDel分析、新转录本预测以及联合miRNA数据进行关联分析等分析。另外,还可以进行基因功能互作、蛋白网络互作等分析,深入研究基因功能,进一步揭示基因间互作网络等信息,为研究网络调控机理提供方向。DNA样品请用1.5 mL离心管装好并用封口膜封好,并安置于50 mL离心管内或其他类似容器里,并旋紧盖子。上海全质粒测序高通量测序服务

生工靶向捕获测序,项目介绍:利用序列捕获技术将基因组特定区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。全外显子测序即通过对某一基因组中的所有外显子进行测序从而获得所有外显子区域内的突变信息。由于该技术在临床上的潜力,被《科学》杂志评为2010年科学进展之一。外显子组测序可用于寻找单基因疾病、复杂疾病(如糖尿病、肥胖症等代谢综合症)、甚至是cancer的致病基因或易感基因。生工生物采用Aglient SureSelect系列外显子捕获系统,可以高效富集人全外显子区域,并结合Illumina XTen测序平台进行深度测序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等变异检测,形成完整的分析报告。上海市多重PCR高通量测序KBSeq全质粒测序只能测菌液和质粒,像PCR产物什么的还是送一代测序吧。

RNA类高通量测序样品要求:对于需要进行 RNA 抽提的样品,请使用新鲜取样的实验材料,当场分成小块(动物样品厚度需小于0.5 cm,植物样品厚度需小于0.3 cm)后立即用液氮或干冰乙醇速冻,保存于-80°C 冰箱,埋于足量的干冰(根据经验,在秋冬季节,如果打包合适,5 公斤块状干冰可以维持 50 小时,而小块的干冰能更好的包裹样品,但需比块状干冰多加些)中用保温箱寄送。一般组织样品,送样量至少200 mg/样;如果样品属于孢子,送样量至少500 mg/样。

small RNA测序,项目简介:Small RNA是一类重要的体内调节分子,长度在18-30 nt之间,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是诱导基因沉默,参与基因转录后调控,从而调节细胞生长、分化,以及个体发育、生殖等重要生物学过程。高通量测序技术可以对样本中所有small RNA家族进行测序和表达定量,从而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非编码RNA以及相应靶序列。测序使用Illumina Xten平台,测序原始数据质控后,进行Clean reads 长度分布统计,small RNA注释,已知 miRNA 注释,已知piRNA注释,ncRNA分析,新 miRNA 预测(有参考基因组),差异基因可视化分析,miRNA 家族分析,差异表达 miRNA 聚类分析,miRNA靶基因预测,靶基因GO、KEGG富集分析。在运输前将所有样品管固定于50 ml带盖离心管中,再将50 ml管放在封口袋中。

高通量测序技术是可以平行对数百万甚至数十亿条序列测序的技术。在基因组测序、转录组测序、宏基因组测序、表观遗传测序、外显子捕获测序、靶区域测序等诸多科研及精细医疗检测领域内有普遍的运用。生工生物工程(上海)股份有限公司自2011年成立高通量测序部以来,逐步引进了Illumina,Life,PacBio等二代/三代测序平台。建立了2000m2高标准实验室(通过了国家ISO认证)以及10PB级运算能力的服务器集群,能满足绝大多数科研客户的研究需要。同时,生工高通量测序团队建设也在不断完善中,目前有50余专职员工,其中高级技术人员以及高级生物信息工程师占比50%以上,5年来,通过生工高通量测序结果发表的文章累计影响因子超过1000分以上。ChIP项目至少要求50ng DNA,以Qubit 2.0检测为准。其余具体咨询生工高通量测序部。上海市基因组高通量测序高通量

组织材料样品(提取RNA用)建议将标签用胶带贴到管壁,干冰运输。上海全质粒测序高通量测序服务

如果你的样品是质粒或者是菌液,那为什么不试试我们的KBSeq呢?准确、迅速,可以说是KBSeq的代名词了,关键是还可以省钱,估计这是很多小伙伴们一定会说,你这个服务单价可比Sanger贵多了,怎么可能会省钱呢?Sanger测序的价格:常规的一代测序基本上要每800 bp就测一个反应,那我们来算一下14000/800=17.5,那基本上就要测18个反应了,按照现在生工官方的价格区间,这个属于反应数在10-49个反应之间的,那每个反应的价格为26元,这样算下来18*26=468元,还要加上引物合成的费用,实验周期的话大概率是要超过15天的。KBSeq全质粒测序的价格:序列长度属于6-15 kb之间,159元,实验的周期大概在5-7天左右。上海全质粒测序高通量测序服务

生工生物工程(上海)股份有限公司总部位于香闵路698号,是一家研发、生产化学试剂、生化试剂、生物试剂、耗材、小型仪器及生物工程相关产品(以上经营涉及位险化学品的只有分装业务),销售公司自产产品并提供售后技术服务;从事上述产品的同类商品(危险化学品限许可证规定范围)的进出口、批发、佣金代理(拍实除外)及相关配套服务;提供生物工程技术服务、技术开发、技术咨询。:提供仓储业务。 【依法须经批准的项目。经相关部门批准后方可开展经营活动】的公司。生工生物作为医药健康的企业之一,为客户提供良好的生化试剂,实验耗材,实验试剂,研发。生工生物不断开拓创新,追求出色,以技术为先导,以产品为平台,以应用为重点,以服务为保证,不断为客户创造更高价值,提供更优服务。生工生物始终关注医药健康行业。满足市场需求,提高产品价值,是我们前行的力量。

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