上海地区宏基因组高通量测序项目

时间:2022年08月11日 来源:

全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序,其研究主要包括3个方面:第一种为不参考任何现有序列从头组装测序,是对未知基因组序列的物种进行基因组测序,并综合利用不同测序技术和生物信息学工具对研究物种进行序列拼接和修正,进而获得该物种的基因组序列图谱;第二种为常见的全基因组重测序,是对已知基因组序列的物种进行个体或群体的测序研究,建立一个测序文库进行单个个体或不同个体混合池测序,发现遗传变异标记,进行后续的研究;第三种是在已有参考基因组序列图谱的基础上,对不同品种的具有代表性个体建立多个文库进行全基因组从头组装测序,此方法能够进一步的进行参考基因组的修补和发现短序列比对难以发现的遗传变异。生工生物拥有众多生物信息分析人才,可进行专业的项目分析,为客户提供个性化服务。DNA样品建议用蓝冰运输。上海地区宏基因组高通量测序项目

生工优势:1.生工高通量测序部拥有丰富的样品处理经验,日均处理样品200余例,涵盖污泥、粪便、海底沉泥、水体滤膜、植物组织、动物组织/细胞等样品,省去您处理样品的繁琐过程。2.生物信息分析经验丰富,可以满足客户标准分析到定制分析作图的需求。且生工一直秉持只要生工已经标准化的分析内容(以生工分析报告模板为准),全部无费用。3.生工生物拥有生命科学领域较全的产品及服务体系,可以承接从分子到蛋白各个层级的实验项目。一站式解决问题。上海地区微生物高通量测序原理目前,生工生物已开展10x单细胞转录组测序(scRNA-seq)服务,如果正好您有需要,那就快快来call我们吧!

生工人线粒体基因组测序(多重扩增法),项目介绍:生工生物高通量测序部采用多重扩增技术,对人线粒体基因组进行扩增捕获,并进一步采用Illumina测序平台进行高通量测序。该技术方案可以快速扩增到几乎线粒体全长,并进行高深度测序,下游提供常规比对筛查突变等生物信息分析。客户提供样品类型:1.人来源DNA,浓度大于1ng/ul,总量大于20ng,以Qubit检测结果为准2.运输条件:冰袋运输。交付信息:1.测序原始数据交付实验报告2.测序原始数据3.突变分析结果。

细胞质检时染料染色的原理:台盼蓝染色原理:台盼蓝不能透过活细胞正常完整的细胞膜,故活细胞不被染色。而死细胞的细胞膜透性增高,可使染料进入细胞内而使死细胞染成淡蓝色。AO/PI染色原理:吖啶橙(AO)是一种小分子染料,可以通过完整的细胞膜,嵌入所有细胞(活细胞和死细胞)的细胞核,呈现绿色荧光;碘化丙啶(PI)只能通过不完整的细胞膜,即死细胞的细胞膜,嵌入所有死细胞的细胞核,呈现红色荧光,通过标记出的绿色荧光和红色荧光就可以辨别出活细胞和死细胞,这种特异性染色的方法也可以排除无核细胞、杂质、碎片等的干扰。Life Ion torrentPGM 运行314、316、318芯片,可以承接扩增子测序、靶区域测序、基因组重测序服务。

生工CHIP-Seq,项目介绍:CHIP-SEQ 技术,即染色质免疫共沉淀与高通量测序相结合的技术。它是研究体内蛋白质与DNA 相互作用的有力工具,还可以用来研究转录因子与基因表达的关系。通过高通量测序,可以一次性得到目的蛋白在整个基因组上的结合分布,得到目的蛋白精确的结合位点以及结合基序等信息。ChIP-Seq 的原理:首先通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA 的所属片段,并对其进行纯化与文库构建;然后对富集得到的DNA的片段进行高通量测序,将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA 区段信息。准确、迅速,可以说是KBSeq的代名词了。ITS高通量测序项目

什么是KBSeq全质粒测序?上海地区宏基因组高通量测序项目

真核/原核有参mRNA-Seq,项目介绍:转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的gather,狭义上指所有mRNA的gather。转录组是研究基因表达的主要手段,是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的纽带。转录水平的调控是生物体重要的调控方式,通过转录组测序分析转录水平的调控,是目前运用较多的研究方式。测序使用Illumina Xten平台,测序原始数据经过质控后,mapping至参考基因组序列,对mapping到基因上的reads进行计数,计算基因的表达量后,进行基因表达差异及差异基因GO、KOG(原核生物为COG)、KEGG功能富集分析,KEGG pathway等分析。对于多个样本,可进行重复相关性检查、共表达分析、PCA主成分分析。另外,依据参考基因组,可进行诸如基因覆盖度、测序饱和度等验证性分析;可变剪切分析、SNP/InDel分析、新转录本预测以及联合miRNA数据进行关联分析等分析。另外,还可以进行基因功能互作、蛋白网络互作等分析,深入研究基因功能,进一步揭示基因间互作网络等信息,为研究网络调控机理提供方向。上海地区宏基因组高通量测序项目

生工生物工程(上海)股份有限公司是一家研发、生产化学试剂、生化试剂、生物试剂、耗材、小型仪器及生物工程相关产品(以上经营涉及位险化学品的只有分装业务),销售公司自产产品并提供售后技术服务;从事上述产品的同类商品(危险化学品限许可证规定范围)的进出口、批发、佣金代理(拍实除外)及相关配套服务;提供生物工程技术服务、技术开发、技术咨询。:提供仓储业务。 【依法须经批准的项目。经相关部门批准后方可开展经营活动】的公司,致力于发展为创新务实、诚实可信的企业。生工生物作为医药健康的企业之一,为客户提供良好的生化试剂,实验耗材,实验试剂,研发。生工生物继续坚定不移地走高质量发展道路,既要实现基本面稳定增长,又要聚焦关键领域,实现转型再突破。生工生物始终关注自身,在风云变化的时代,对自身的建设毫不懈怠,高度的专注与执着使生工生物在行业的从容而自信。

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