上海地区16s高通量测序项目

IlluminaHiSeq2500/4000可以运行PE150/PE250模式，可以承担转录组测序、人基因组重测序、外显子捕获测序、宏基因组测序、微生物分类测序等服务；IlluminaMiSeq运行PE300模式，可以承担细菌基因组重测序/Denovo测序、微生物分类测序、扩增子测序、核酸适配体测序等服务；LifeIontorrentPGM运行314、316、318芯片，可以承接扩增子测序、靶区域测序、基因组重测序服务；PacBioSequel/RSII该测序平台读长超长，平均可达10kb以上，主要承接细菌基因组完成图测序、***基因组精细图测序、全长转录本测序等服务；现在也有学者为了区分传统测序和单细胞测序的区别，将传统方法称为批量测序。上海地区16s高通量测序项目

单细胞转录组测序中，制备高质量的单细胞悬液至关重要。而悬液制备好后质检结果的判断也是大家需要掌握的必备技能。单细胞悬液质检关卡究竟是怎样运作的呢？单细胞悬液质控要求：•细胞浓度：700-1200cells/µl；•细胞活率>80%（当细胞悬液活率低于70%时建议进行去除死细胞处理）；细胞团及碎片杂质<5%（无细胞粘连，无明显的细胞碎片和细胞团，并保证细胞的完整性）；•细胞状态：细胞直径在7-40um之间（细胞直径过大则建议进行抽核处理）；•不存在逆转录抑制剂和非细胞的核酸分子。有参转录组高通量测序公司生工一直秉持只要生工已经标准化的分析内容（以生工分析报告模板为准），全部无费用。

生工高通量测序样品要求，RNA样品：请提供浓度≥750 ng/μl、总量≥2μg的总RNA样品，样品请去蛋白并进行DNase处理;请务必提供每个样品具体的浓度、体积、制备时间以及物种来源。比较好附上QC数据，可以是电泳胶图、分光光度值、Nanodrop仪器检测数据或者Agilent Bioanalyzer仪器检测数据等;一般情况下，转录组测序需要Agilent Bioanalyzer仪器检测获得的总RNA 28S:18S≥1，RIN≥7;小RNA测测序不可采用常规柱式总RNA提取试剂盒，可选择传统总RNA提取法（如乙醇沉淀、异丙醇沉淀等）或者选用专门的小RNA提取试剂盒;寄送RNA样品请置于1.5 ml离心管中，管上注明样品名称、浓度以及制备时间，管口使用Parafilm封口。在运输前将所有样品管固定于50 ml带盖离心管中，再将50 ml管放在封口袋中。使用足量的干冰运输，并且尽量选用较快的邮递方式，以降低运输过程中样品降解的可能性。

生工外显子测序，项目介绍：已知人类基因组上有180000个外显子，占整个基因组约1-2%。这些区域主要负责编码蛋白。绝大多数的单基因遗传突变与复杂疾病突变都发生在外显子区域。相比于全基因组重测 序，全外显子捕获测序有测序深度高、价格便宜的优势，性价比很高。生工生物采用Aglient SureSelect系列外显子捕获系统，可以高效富集人全外显子区域，并结合Illumina XTen测序平台进行深度测序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等变异检测，形成完整的分析报告。请合理安排样品寄送时间，避免样本在周六、周日或法定节假日到达生工生物。

怎样通过血球计数板进行质检操作呢？将血球计数板擦拭干净，取干净的盖玻片盖在计数板上；将细胞悬液混匀（或10µl台盼蓝+10µl细胞悬液），吸出10µl悬液至计数板上盖玻片的一侧使细胞核悬液铺满盖玻片和计数板之间；在显微镜下分别对V1/V2/V3/V4四个计数区域进行计数；按细胞计数公式进行计算，计算公式：细胞总数={(V1+V2+V3+V4)/4}*10000*悬液体积*稀释倍数，V1/V2/V3/V4为各个计数区的细胞数目，细胞活率=活细胞数目/总细胞数目*100%。RNA样品建议用足量干冰运输。生工生物 高通量测序产品

什么是KBSeq全质粒测序？上海地区16s高通量测序项目

生工高通量测序样品要求，环境样品：如果是新鲜土壤/污泥样品，可以以冰袋运输，不超过3天;如果是冻存过的样品（-20°C或者-80°C冰箱保存），为避免反复冻融，建议用足量的干冰（根据经验，在秋冬季节，如果打包合适，3公斤块状干冰可以维持30-40小时）寄送;如果是水体样品，建议采用滤膜过滤后，将滤膜寄送来生工。生工不负责过滤。要求滤膜3张，冰袋运输，不超过3天。其余特殊环境样品，具体咨询生工高通量测序部。

DNA样品：请提供电泳胶图，浓度>20 ng/μl，总量一般1～2 μg。乙醇沉淀DNA或冻干DNA，可冰袋运输，不超过3天。 上海地区16s高通量测序项目

生工生物工程（上海）股份有限公司致力于医药健康，是一家生产型公司。生工生物致力于为客户提供良好的生化试剂，实验耗材，实验试剂，研发，一切以用户需求为中心，深受广大客户的欢迎。公司秉持诚信为本的经营理念，在医药健康深耕多年，以技术为先导，以自主产品为重点，发挥人才优势，打造医药健康良好品牌。生工生物立足于全国市场，依托强大的研发实力，融合前沿的技术理念，及时响应客户的需求。