上海地区宏全基因组高通量测序

时间:2022年08月16日 来源:

单细胞测序是什么?单细胞测序是基于高通量测序(Next-generationsequencingtechnology,NGS)方法,检测群体中单细胞基因组、单细胞转录组、单细胞表观基因组及单细胞蛋白组,提供细胞间差异的高分辨率视图,从分子水平揭示细胞奥秘。单细胞转录组测序(Single-cellRNA-Sequencing,ScRNA-Seq)指在单细胞水平上对mRNA进行高通量测序和分析的技术。单细胞转录组测序能获得单个细胞内近万个基因的表达信息,为辨别生物组织中各种细胞类型的转录组特征和全方面揭示细胞之间基因表达的异质性提供了有力的工具[3]。说到细胞异质性(Cellheterogeneity),就要说到我们为什么要用单细胞测序技术了。在运输前将所有样品管集中放于大包装中。上海地区宏全基因组高通量测序

怎样通过血球计数板进行质检操作呢?将血球计数板擦拭干净,取干净的盖玻片盖在计数板上;将细胞悬液混匀(或10µl台盼蓝+10µl细胞悬液),吸出10µl悬液至计数板上盖玻片的一侧使细胞核悬液铺满盖玻片和计数板之间;在显微镜下分别对V1/V2/V3/V4四个计数区域进行计数;按细胞计数公式进行计算,计算公式:细胞总数={(V1+V2+V3+V4)/4}*10000*悬液体积*稀释倍数,V1/V2/V3/V4为各个计数区的细胞数目,细胞活率=活细胞数目/总细胞数目*100%。上海地区宏全基因组高通量测序生工生物接受客户自备文库测序项目。

高通量测序技术是可以平行对数百万甚至数十亿条序列测序的技术。在基因组测序、转录组测序、宏基因组测序、表观遗传测序、外显子捕获测序、靶区域测序等诸多科研及精细医疗检测领域内有普遍的运用。生工生物工程(上海)股份有限公司自2011年成立高通量测序部以来,逐步引进了Illumina,Life,PacBio等二代/三代测序平台。建立了2000m2高标准实验室(通过了国家ISO认证)以及10PB级运算能力的服务器集群,能满足绝大多数科研客户的研究需要。同时,生工高通量测序团队建设也在不断完善中,目前有50余专职员工,其中高级技术人员以及高级生物信息工程师占比50%以上,5年来,通过生工高通量测序结果发表的文章累计影响因子超过1000分以上。

什么是KBSeq全质粒测序?它基于第二代测序技术,一次性对大量质粒(比较多可达6000个样本)进行并行测序,利用生物信息学分析,对数据进行序列组装并获得每一个质粒的完整序列信息。所以我们也称它为,可以部分替代一代测序的高通量测序技术。测序长度:对于测序长度较长,如果我们用Sanger测序往往需要花费大量的时间,而我们KBSeq全质粒测序则只需要5-7天,就可以测通片段长度小于30kb以下的片段。样本用量:KBSeq全质粒测序对于样本的量,要求的也比较少,比如质粒我们的样本要求DNA的浓度需≥ 1 ng/μl, 体积需≥5 μl,如果比较珍贵的样本或者是样本比较难提取的,KBSeq就更为适合了。DNA样品请用1.5 mL离心管装好并用封口膜封好,并安置于50 mL离心管内或其他类似容器里,并旋紧盖子。

全转录组测序(Total RNA-Seq),项目介绍:全转录组是指特定细胞在特定状态下所能转录出来的所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA(non-coding RNA)。针对非编码RNA的研究主要集中在具有调控作用的miRNA,lncRNA和circRNA。基于二代测序技术的全转录组测序研究,同时分析同一样本中的mRNA,lncRNA,circRNA和miRNA,并且通过关联分析,使研究内容更加系统化,致力于深入挖掘生命现象背后的转录调控问题。组织样品或者总 RNA, 样品名称清晰,干冰运输。生工一直秉持只要生工已经标准化的分析内容(以生工分析报告模板为准),全部无费用。上海SNP高通量测序公司

KBSeq全质粒测序对于样本的量,要求的也比较少。上海地区宏全基因组高通量测序

简化基因组测序,项目介绍:通过限制性内切酶对基因组DNA进行酶切,并对酶切片段进行高通量测序,这种通过酶切降低基因组的复杂度的测序技术统称为简化基因 组测序技术。利用生物信息学方法,进行SNP单体型图谱绘制,全基因组关联分析(GWAS),连锁分析和QTL定位分析,种群进化,主成分分析等。比较有代表性的方法有GBS-seq和RAD-seq。宏全基因组测序,项目介绍:宏基因组指特定环境样品内全部遗传物质的总和。直接提取环境样品内全部基因组DNA,随后进行大规模高通量测序(shotgun 策 略)。测到数据后,先进行必要的数据质控,而后进行基因组拼接、注释(物种、基因功能),使得我们可以获取环境样品内菌群分布、系统进化、功能代谢等信息。该方法已经得到普遍的运用。上海地区宏全基因组高通量测序

生工生物工程(上海)股份有限公司是一家研发、生产化学试剂、生化试剂、生物试剂、耗材、小型仪器及生物工程相关产品(以上经营涉及位险化学品的只有分装业务),销售公司自产产品并提供售后技术服务;从事上述产品的同类商品(危险化学品限许可证规定范围)的进出口、批发、佣金代理(拍实除外)及相关配套服务;提供生物工程技术服务、技术开发、技术咨询。:提供仓储业务。 【依法须经批准的项目。经相关部门批准后方可开展经营活动】的公司,致力于发展为创新务实、诚实可信的企业。生工生物深耕行业多年,始终以客户的需求为向导,为客户提供高质量的生化试剂,实验耗材,实验试剂,研发。生工生物不断开拓创新,追求出色,以技术为先导,以产品为平台,以应用为重点,以服务为保证,不断为客户创造更高价值,提供更优服务。生工生物创始人王启松,始终关注客户,创新科技,竭诚为客户提供良好的服务。

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