上海多重扩增高通量测序测序

时间:2022年08月16日 来源:

真核/原核有参mRNA-Seq,项目介绍:转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的gather,狭义上指所有mRNA的gather。转录组是研究基因表达的主要手段,是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的纽带。转录水平的调控是生物体重要的调控方式,通过转录组测序分析转录水平的调控,是目前运用较多的研究方式。测序使用Illumina Xten平台,测序原始数据经过质控后,mapping至参考基因组序列,对mapping到基因上的reads进行计数,计算基因的表达量后,进行基因表达差异及差异基因GO、KOG(原核生物为COG)、KEGG功能富集分析,KEGG pathway等分析。对于多个样本,可进行重复相关性检查、共表达分析、PCA主成分分析。另外,依据参考基因组,可进行诸如基因覆盖度、测序饱和度等验证性分析;可变剪切分析、SNP/InDel分析、新转录本预测以及联合miRNA数据进行关联分析等分析。另外,还可以进行基因功能互作、蛋白网络互作等分析,深入研究基因功能,进一步揭示基因间互作网络等信息,为研究网络调控机理提供方向。组织材料样品(提取RNA用)建议将标签用胶带贴到管壁,干冰运输。上海多重扩增高通量测序测序

通过显微镜使用血球计数板质检得到质检结果:明场(细胞未染色):主要可以观察悬液背景质量(背景干净,无杂质碎片,无细胞团块);台盼蓝场(细胞与台盼蓝染色后):主要可以观察活性(主要为活细胞,未染色蓝色的为活细胞);通过台盼蓝场计算活率:90%>80%;细胞浓度:710cells/µl;等结果来看,血球计数板质检结果的展示可以看出所有指标均符合上机标准,属于高质量单细胞悬液。以上就是我们本次的单细胞悬液质检指南分享啦。上海市SNP高通量测序寄送RNA样品请置于1.5 ml离心管中,管上注明样品名称、浓度以及制备时间,管口使用Parafilm封口。

2021年11月1日,在这个平凡而又特殊的日子里,生工生物高通量测序部迎来了一位新成员——10xGenomics Chromium X!不要看我们个头小,我们可是百万级单细胞捕获神器吆。X是如何实现单次运行有这么高的吞吐量呢?多通道+高捕获+10x的CellPlex多样本混样技术。X仪器本身有16个通道(Controller为8通道),每个通道比较多捕获20000个细胞(Controller为10000个细胞)。再结合10x的CellPlex多样本混样技术,每个通道比较多可捕获60,000个细胞,去除双细胞率后,每张芯片比较多可捕获750,000个单细胞。

16s/18s/ITS微生物分类测序,项目介绍:环境微生物是自然界中分布建议广、种类建议多、数量比较大的生物类群,其群落结构及多样性和微生物的功能及代谢机理是微生物生态学的研究热点,对于我们研究微生物与环境的关系、环境治理和微生物资源的利用以及人类医疗健康有着重要的理论和现实意义。随着高通量测序技术的发展以及大量序列数据的积累,通用引物扩增结合高通量测序技术,可以快速检索环境内微生物的群落结构。这项运用我们称之为微生物分类测序。如Illumina公司的MiSeq高通量测序平台不仅可实现对多样品的多个可变区同时测序,而且在测序速度和测序通量上都有进一步提升,目前此平台已在微生物多样性群落结构研究方面受到了广大学者的认可。如果是水体样品,建议采用滤膜过滤后,将滤膜寄送来生工。

单细胞测序是什么?单细胞测序是基于高通量测序(Next-generationsequencingtechnology,NGS)方法,检测群体中单细胞基因组、单细胞转录组、单细胞表观基因组及单细胞蛋白组,提供细胞间差异的高分辨率视图,从分子水平揭示细胞奥秘。单细胞转录组测序(Single-cellRNA-Sequencing,ScRNA-Seq)指在单细胞水平上对mRNA进行高通量测序和分析的技术。单细胞转录组测序能获得单个细胞内近万个基因的表达信息,为辨别生物组织中各种细胞类型的转录组特征和全方面揭示细胞之间基因表达的异质性提供了有力的工具[3]。说到细胞异质性(Cellheterogeneity),就要说到我们为什么要用单细胞测序技术了。请提供电泳胶图,浓度>20 ng/μl,总量一般1~2 μg。乙醇沉淀DNA或冻干DNA,可冰袋运输,不超过3天。上海市多重PCR高通量测序产品

为什么要用单细胞测序技术?上海多重扩增高通量测序测序

真核/原核无参mRNA-Seq,项目介绍;测序使用Illumina Xten平台,测序原始数据质控后进行拼接,并进一步对拼接所得转录本进行功能注释、CDD、CDS分析,SNP分析,SSR标记开发等分析。在计算基因的表达量后,进行基因表达差异及差异基因GO、KOG(原核生物为COG)、KEGG功能富集分析,KEGG pathway等分析。对于多个样本,可进行重复相关性检查、共表达分析、PCA主成分分析。另外,还可以进行基因功能互作、蛋白网络互作等分析,深入研究基因功能,进一步揭示基因间互作网络等信息,为研究网络调控机理提供方向。 上海多重扩增高通量测序测序

生工生物工程(上海)股份有限公司总部位于香闵路698号,是一家研发、生产化学试剂、生化试剂、生物试剂、耗材、小型仪器及生物工程相关产品(以上经营涉及位险化学品的只有分装业务),销售公司自产产品并提供售后技术服务;从事上述产品的同类商品(危险化学品限许可证规定范围)的进出口、批发、佣金代理(拍实除外)及相关配套服务;提供生物工程技术服务、技术开发、技术咨询。:提供仓储业务。 【依法须经批准的项目。经相关部门批准后方可开展经营活动】的公司。公司自创立以来,投身于生化试剂,实验耗材,实验试剂,研发,是医药健康的主力军。生工生物始终以本分踏实的精神和必胜的信念,影响并带动团队取得成功。生工生物创始人王启松,始终关注客户,创新科技,竭诚为客户提供良好的服务。

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