上海市转录组高通量测序平台

微生物基因组重测序（有参）：目前越来越多的微生物基因组被解析出来了。从而使得科研工作者们可以对某些物种微生物进行进行物种进化、种群特征、选择压力等研究。利用高通量测序技术，对有参考基因组微生物进行多个体的基因组重测序，精细分析其与参考基因组的SNP、InDel、SV等变异信息。微生物基因组从头测序（无参）：对于不断分离培养微生物的客户来说，要确定一个菌株是否是新菌株或者新菌种，较快捷的办法就是，直接进行基因组测序。利用高通量测序技术，对这些基因组进行高深度测序，然后进行基因组组装，获得基因组的框架图或者精细图甚至是完成图。从而可以快速解析其基因组结构、基因功能、进化关系。单细胞测序到底是什么？上海市转录组高通量测序平台

生工高通量测序样品要求，环境样品：如果是新鲜土壤/污泥样品，可以以冰袋运输，不超过3天;如果是冻存过的样品（-20°C或者-80°C冰箱保存），为避免反复冻融，建议用足量的干冰（根据经验，在秋冬季节，如果打包合适，3公斤块状干冰可以维持30-40小时）寄送;如果是水体样品，建议采用滤膜过滤后，将滤膜寄送来生工。生工不负责过滤。要求滤膜3张，冰袋运输，不超过3天。其余特殊环境样品，具体咨询生工高通量测序部。

DNA样品：请提供电泳胶图，浓度>20 ng/μl，总量一般1～2 μg。乙醇沉淀DNA或冻干DNA，可冰袋运输，不超过3天。 上海地区生工高通量测序服务单细胞测序技术可以检测复杂组织中单个细胞不同的生物学特性.

悬液制备好后质检结果的判断也是大家需要掌握的必备技能。单细胞悬液质检关卡究竟是怎样运作的呢？单细胞悬液质控要求：•细胞浓度：700-1200cells/µl；•细胞活率>80%（当细胞悬液活率低于70%时建议进行去除死细胞处理）；细胞团及碎片杂质<5%（无细胞粘连，无明显的细胞碎片和细胞团，并保证细胞的完整性）；•细胞状态：细胞直径在7-40um之间（细胞直径过大则建议进行抽核处理）；•不存在逆转录抑制剂和非细胞的核酸分子。

真核/原核无参mRNA-Seq，项目介绍；测序使用Illumina Xten平台，测序原始数据质控后进行拼接，并进一步对拼接所得转录本进行功能注释、CDD、CDS分析，SNP分析，SSR标记开发等分析。在计算基因的表达量后，进行基因表达差异及差异基因GO、KOG（原核生物为COG）、KEGG功能富集分析，KEGG pathway等分析。对于多个样本，可进行重复相关性检查、共表达分析、PCA主成分分析。另外，还可以进行基因功能互作、蛋白网络互作等分析，深入研究基因功能，进一步揭示基因间互作网络等信息，为研究网络调控机理提供方向。 在运输前将所有样品管固定于50 ml带盖离心管中，再将50 ml管放在封口袋中。

高通量测序技术是可以平行对数百万甚至数十亿条序列测序的技术。在基因组测序、转录组测序、宏基因组测序、表观遗传测序、外显子捕获测序、靶区域测序等诸多科研及精细医疗检测领域内有普遍的运用。生工生物工程（上海）股份有限公司自2011年成立高通量测序部以来，逐步引进了Illumina，Life，PacBio等二代/三代测序平台。建立了2000m2高标准实验室（通过了国家ISO认证）以及10PB级运算能力的服务器集群，能满足绝大多数科研客户的研究需要。同时，生工高通量测序团队建设也在不断完善中，目前有50余专职员工，其中高级技术人员以及高级生物信息工程师占比50%以上，5年来，通过生工高通量测序结果发表的文章累计影响因子超过1000分以上。小RNA测测序不可采用常规柱式总RNA提取试剂盒。上海宏基因组高通量测序产品

DNA样品请提供电泳胶图，浓度>20 ng/μl，总量一般1～2 μg。乙醇沉淀DNA或冻干DNA，可冰袋运输，不超过3天。上海市转录组高通量测序平台

我国经济进入“新常态”，总体上推动生化试剂，实验耗材，实验试剂，研发从粗放式增长向注重质量、效率方向转变。民间资本的进入也一定程度刺激我国生化试剂，实验耗材，实验试剂，研发市场活力。社会对健康类产业的关注度越来越高，迫切需要对生化试剂，实验耗材，实验试剂，研发的规模和结构进行核算。监管体系缺失，山东的疫苗事件中，体现出销往24个省市的疫苗各方面监管力度小。制药企业和各大医药机构由不同部门管理，这种分段监管方式存在很大的医药健康漏洞。生产型项目新市场加入通常耗资巨大，单一的资本进入往往会形成极大的资本压力，因此一些重大的生产型项目往往都会通过数家有实力的资本进行组合资本。首先，完善促进生化试剂，实验耗材，实验试剂，研发发展的相关政策，优化产业发展环境。第二，加大对大健康前沿领域支持，技术带领健康科技发展。第三，消灭体制机制障碍，催生更多生化试剂，实验耗材，实验试剂，研发发展模式。第四，大力发展与生化试剂，实验耗材，实验试剂，研发相适应的高等教育事业。上海市转录组高通量测序平台

生工生物工程（上海）股份有限公司是一家研发、生产化学试剂、生化试剂、生物试剂、耗材、小型仪器及生物工程相关产品(以上经营涉及位险化学品的只有分装业务)，销售公司自产产品并提供售后技术服务;从事上述产品的同类商品(危险化学品限许可证规定范围)的进出口、批发、佣金代理(拍实除外)及相关配套服务;提供生物工程技术服务、技术开发、技术咨询。:提供仓储业务。 【依法须经批准的项目。经相关部门批准后方可开展经营活动】的公司，致力于发展为创新务实、诚实可信的企业。生工生物深耕行业多年，始终以客户的需求为向导，为客户提供高质量的生化试剂，实验耗材，实验试剂，研发。生工生物始终以本分踏实的精神和必胜的信念，影响并带动团队取得成功。生工生物始终关注医药健康行业。满足市场需求，提高产品价值，是我们前行的力量。