上海地区SNP高通量测序应用

时间:2022年08月24日 来源:

RNA类高通量测序样品要求:对于需要进行 RNA 抽提的样品,请使用新鲜取样的实验材料,当场分成小块(动物样品厚度需小于0.5 cm,植物样品厚度需小于0.3 cm)后立即用液氮或干冰乙醇速冻,保存于-80°C 冰箱,埋于足量的干冰(根据经验,在秋冬季节,如果打包合适,5 公斤块状干冰可以维持 50 小时,而小块的干冰能更好的包裹样品,但需比块状干冰多加些)中用保温箱寄送。一般组织样品,送样量至少200 mg/样;如果样品属于孢子,送样量至少500 mg/样。生工生物已开展10x单细胞转录组测序(scRNA-seq)服务,如果正好您有需要,那就快快来call我们吧!上海地区SNP高通量测序应用

全转录组测序(Total RNA-Seq),项目介绍:全转录组是指特定细胞在特定状态下所能转录出来的所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA(non-coding RNA)。针对非编码RNA的研究主要集中在具有调控作用的miRNA,lncRNA和circRNA。基于二代测序技术的全转录组测序研究,同时分析同一样本中的mRNA,lncRNA,circRNA和miRNA,并且通过关联分析,使研究内容更加系统化,致力于深入挖掘生命现象背后的转录调控问题。组织样品或者总 RNA, 样品名称清晰,干冰运输。上海地区全质粒测序高通量测序寄送 RNA 样品请置于 1.5 ml 离心管中,管上注明样品名称、浓度以及制备时间,管口使用 Parafilm 封口。

单细胞测序技术的应用:单细胞测序技术可以检测复杂组织中单个细胞不同的生物学特性,这可以极大的帮助我们进一步了解细胞与细胞之间的差异。"这几乎就像通过几颗星星看到了整个宇宙。"哈佛大学分子和细胞生物学教授 Alexander Schier的这句话应用在这里也是很合适了。这幅图正是来自于在2018年4月 Science 杂志发表的三篇[8-10]来自哈佛医学院和哈佛大学的研究人员关于单细胞基因测序文章中的一幅结果图,Alexander Schier教授也是其中一篇文章的作者。这几篇文章使用多种检测技术组合,其中包括对数千个发育中的斑马鱼和青蛙胚胎单细胞测序,在胚胎发育建议初的24小时内追踪单个细胞的发育情况,可以揭示出胚胎细胞何时何地转变为新的细胞状态和类型并向我们展示了组织和整个机体从单细胞发育的完整历程。

土壤样本请置于2 mL离心管里(多准备几管备用),为保护样本管,样本管置于保护用的50 mL离心管或其他类似容器里,并旋紧盖子;如常温采的样品,可以采用蓝冰运输;如果是高温发酵罐或者样品已经冻存-80°C,需要用足量干冰运输; DNA样品请用1.5 mL离心管装好并用封口膜封好,并安置于50 mL离心管内或其他类似容器里,并旋紧盖子;蓝冰运输;RNA样品请用1.5 mL离心管装好并用封口膜封好,并安置于50 mL离心管内或其他类似容器里,并旋紧盖子;用足量干冰运输。 于微生物样品,请客户如实声明所属物种,对于可能致病的微生物,生工保留拒收的权利。

AO/PI染色原理:吖啶橙(AO)是一种小分子染料,可以通过完整的细胞膜,嵌入所有细胞(活细胞和死细胞)的细胞核,呈现绿色荧光;碘化丙啶(PI)只能通过不完整的细胞膜,即死细胞的细胞膜,嵌入所有死细胞的细胞核,呈现红色荧光,通过标记出的绿色荧光和红色荧光就可以辨别出活细胞和死细胞,这种特异性染色的方法也可以排除无核细胞、杂质、碎片等的干扰。荧光细胞计数仪检测结果可以让我们直观的看到:细胞浓度(总细胞,活细胞,死细胞)、细胞存活率(台盼蓝和双荧光AO/PI染色)、细胞平均直径、细胞聚团率、细胞直径分布等结果的展示。10xGenomics Chromium X多通道+高捕获+10x的CellPlex多样本混样技术。上海地区羟甲基化测序高通量测序公司

寄送RNA样品请置于1.5 ml离心管中,管上注明样品名称、浓度以及制备时间,管口使用Parafilm封口。上海地区SNP高通量测序应用

转录组测序,项目介绍:RNA-Seq,是基于新一代测序技术的转录组学研究方法:首先提取生物样品的全部转录的 RNA 并进行 mRNA 富集,然后反转录为 cDNA 后进行新一代高通量测序,在此基础上进行短片段拼接组装,从而获得一个个单独转录本,进而可以对该生物样品当前状态的基因表达状况有全局了解。对不同阶段或部位生物样品的转录组进行 比较分析,则可以在转录层面得到基因表达水平的变化,针对关键基因则可以进行代谢通路(Pathway)的构建。上海地区SNP高通量测序应用

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