上海生工高通量测序应用

对于微生物样品，请客户如实声明所属物种；对于可能致病的微生物，生工将拒收。以固体培养基培养的样品，需将样品从培养基上刮取下来，用干冰寄送；以液体培养基培养的样品，需离心后弃培养液收集样品，用RNA组织保存液（例如RNA-Be-Locker A）保存，以干冰或冰袋寄送；没有RNA组织保存液的情况下，也可用液氮或干冰乙醇速冻，保存于-80°C 冰箱，埋于足量干冰寄送。***样品送样量需至少达到100 mg/样；细菌样品送样量需至少达到107（10的7次方）数量级，同时，在与样本一同寄送的送样表上，标明属于革兰氏阳性菌（G+）还是革兰氏阴性菌（G-）。Life Ion torrentPGM 运行314、316、318芯片，可以承接扩增子测序、靶区域测序、基因组重测序服务。上海生工高通量测序应用

通过显微镜使用血球计数板质检得到质检结果：明场（细胞未染色）：主要可以观察悬液背景质量（背景干净，无杂质碎片，无细胞团块）；台盼蓝场（细胞与台盼蓝染色后）：主要可以观察活性（主要为活细胞，未染色蓝色的为活细胞）；通过台盼蓝场计算活率：90%>80%；细胞浓度:710cells/µl;等结果来看，血球计数板质检结果的展示可以看出所有指标均符合上机标准，属于高质量单细胞悬液。以上就是我们本次的单细胞悬液质检指南分享啦。上海市基因组高通量测序测序现在也有学者为了区分传统测序和单细胞测序的区别，将传统方法称为批量测序。

对于细胞样品，送样量需达到 5 × 106（5乘10的6次方）数量级。富集后置于 2 ml Ep管中，用 1 ml TRIzol 重悬，注意取样后立即用液氮或干冰乙醇速冻，保存于-80°C 冰箱，埋于足量的干冰中用保温箱寄送。强烈建议细胞样品先做细胞鉴定及支原体/衣原体污染之后，再送出来。对于血液样本，只接收未冻存过的抗凝血新鲜样本。抗凝剂不可使用肝素钠，可用EDTA或ACD抗凝剂，取血后以冰袋保存，切记不能使血液冻结，从取血之时开始计算，须在48小时之内送达生工上海总部高通量测序部。如果不能提供新鲜样本，则请提供从血液中提取的总RNA样本。备样要求详见B、RNA 样品。

生工高通量测序样品要求，组织/细胞样品：请使用新鲜取样的实验材料，当场分成小块后立即用液氮或干冰乙醇速冻，保存于-80°C冰箱，用足量的干冰（根据经验，在秋冬季节，如果打包合适，3公斤块状干冰可以维持30-40小时）寄送;于微生物样品，请客户如实声明所属物种，对于可能致病的微生物，生工保留拒收的权利;对于需要进行RNA抽提的样品，可以但不建议将组织在液氮中研磨后用TRIzol悬浮后用普通冰袋寄送，具体情况请先取得沟通。KBSeq全质粒测序对于样本的量，要求的也比较少。

全转录组测序（Total RNA-Seq），项目介绍：全转录组是指特定细胞在特定状态下所能转录出来的所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA（non-coding RNA）。针对非编码RNA的研究主要集中在具有调控作用的miRNA，lncRNA和circRNA。基于二代测序技术的全转录组测序研究，同时分析同一样本中的mRNA，lncRNA，circRNA和miRNA，并且通过关联分析，使研究内容更加系统化，致力于深入挖掘生命现象背后的转录调控问题。组织样品或者总 RNA， 样品名称清晰，干冰运输。小RNA测测序不可采用常规柱式总RNA提取试剂盒。上海市宏全基因组高通量测序产品

生工生物接受客户自备文库测序项目。上海生工高通量测序应用

细胞质检时染料染色的原理：台盼蓝染色原理：台盼蓝不能透过活细胞正常完整的细胞膜，故活细胞不被染色。而死细胞的细胞膜透性增高，可使染料进入细胞内而使死细胞染成淡蓝色。AO/PI染色原理：吖啶橙（AO）是一种小分子染料，可以通过完整的细胞膜，嵌入所有细胞（活细胞和死细胞）的细胞核，呈现绿色荧光；碘化丙啶（PI）只能通过不完整的细胞膜，即死细胞的细胞膜，嵌入所有死细胞的细胞核，呈现红色荧光，通过标记出的绿色荧光和红色荧光就可以辨别出活细胞和死细胞，这种特异性染色的方法也可以排除无核细胞、杂质、碎片等的干扰。上海生工高通量测序应用

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