羟甲基化测序高通量测序应用

2021年11月1日，在这个平凡而又特殊的日子里，生工生物高通量测序部迎来了一位新成员——10xGenomics Chromium X！不要看我们个头小，我们可是百万级单细胞捕获神器吆。X是如何实现单次运行有这么高的吞吐量呢？多通道+高捕获+10x的CellPlex多样本混样技术。X仪器本身有16个通道（Controller为8通道），每个通道比较多捕获20000个细胞（Controller为10000个细胞）。再结合10x的CellPlex多样本混样技术，每个通道比较多可捕获60,000个细胞，去除双细胞率后，每张芯片比较多可捕获750,000个单细胞。KBSeq全质粒测序对于样本的量，要求的也比较少。羟甲基化测序高通量测序应用

扩增子测序，项目介绍：随着基因编辑技术（尤其是CRISPR-cas9技术）的发展，科研人员使用传统的Sanger测序技术无法快速有效鉴定基因编辑效率。但是，通过对靶基因区域附近设计引物，进行PCR扩增，并对PCR产物进行高通量测序，可以快速高效的获得目标区域的突变频率信息，尤其是对低频突变的检测效果远远优于一代测序，性价比极高。16S全长分类测序，项目介绍：16S全长测序分析主要是对 16S rRNA基因全长进行扩增，基于PacBio 测序平台测序. 相比较二代测序只选择 1-2 个高变区进行测序，三代可以获得全长的 16S 序列，更多变异区信息可以提高物种鉴定的分辨率，还可以提高对于群落组成的鉴定的精度。另外，针对fungus/真核生物，也可以采用类似的办法，扩增ITS/18S全长，进行物种分类测序，提高鉴定精度。上海地区ITS高通量测序寄送RNA样品请置于1.5 ml离心管中，管上注明样品名称、浓度以及制备时间，管口使用Parafilm封口。

高通量测序技术是可以平行对数百万甚至数十亿条序列测序的技术。在基因组测序、转录组测序、宏基因组测序、表观遗传测序、外显子捕获测序、靶区域测序等诸多科研及精细医疗检测领域内有普遍的运用。生工生物工程（上海）股份有限公司自2011年成立高通量测序部以来，逐步引进了Illumina，Life，PacBio等二代/三代测序平台。建立了2000m2高标准实验室（通过了国家ISO认证）以及10PB级运算能力的服务器集群，能满足绝大多数科研客户的研究需要。同时，生工高通量测序团队建设也在不断完善中，目前有50余专职员工，其中高级技术人员以及高级生物信息工程师占比50%以上，5年来，通过生工高通量测序结果发表的文章累计影响因子超过1000分以上。

核酸适配体测序，项目介绍：核酸适配体是一类能够特异性地和靶物质结合的寡核苷酸序列。它可作用于蛋白质、金属离子、小分子化合物、细胞膜表面受体等靶标。其结合能力可与抗体相当甚至更强，同时具有低免疫原性、 稳定性好等特点，并可结合各种药物及载体构建多元复合靶向给药系统用于tumour靶向treat, 在生物医学领域有潜在高价值。生工生物针对核酸适配体特殊结构，结合Illumina MiSeq测序平台，可以快速对核酸适配体文库进行大规模高通量测序，省去克隆测序的麻烦，提高测序深度，快速计算适配体序列频率，方便科研客户快速评估序列富集程度。DNA样品请用1.5 mL离心管装好并用封口膜封好，并安置于50 mL离心管内或其他类似容器里，并旋紧盖子。

全转录组测序（Total RNA-Seq），项目介绍：全转录组是指特定细胞在特定状态下所能转录出来的所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA（non-coding RNA）。针对非编码RNA的研究主要集中在具有调控作用的miRNA，lncRNA和circRNA。基于二代测序技术的全转录组测序研究，同时分析同一样本中的mRNA，lncRNA，circRNA和miRNA，并且通过关联分析，使研究内容更加系统化，致力于深入挖掘生命现象背后的转录调控问题。组织样品或者总 RNA， 样品名称清晰，干冰运输。如果是水体样品，建议采用滤膜过滤后，将滤膜寄送来生工。上海地区单细胞测序高通量测序应用

于微生物样品，请客户如实声明所属物种，对于可能致病的微生物，生工保留拒收的权利。羟甲基化测序高通量测序应用

全基因组测序是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序，其研究主要包括3个方面：第一种为不参考任何现有序列从头组装测序，是对未知基因组序列的物种进行基因组测序，并综合利用不同测序技术和生物信息学工具对研究物种进行序列拼接和修正，进而获得该物种的基因组序列图谱；第二种为常见的全基因组重测序，是对已知基因组序列的物种进行个体或群体的测序研究，建立一个测序文库进行单个个体或不同个体混合池测序，发现遗传变异标记，进行后续的研究；第三种是在已有参考基因组序列图谱的基础上，对不同品种的具有代表性个体建立多个文库进行全基因组从头组装测序，此方法能够进一步的进行参考基因组的修补和发现短序列比对难以发现的遗传变异。生工生物拥有众多生物信息分析人才，可进行专业的项目分析，为客户提供个性化服务。羟甲基化测序高通量测序应用

生工生物工程（上海）股份有限公司是一家有着雄厚实力背景、信誉可靠、励精图治、展望未来、有梦想有目标，有组织有体系的公司，坚持于带领员工在未来的道路上大放光明，携手共画蓝图，在上海市等地区的医药健康行业中积累了大批忠诚的客户粉丝源，也收获了良好的用户口碑，为公司的发展奠定的良好的行业基础，也希望未来公司能成为*****，努力为行业领域的发展奉献出自己的一份力量，我们相信精益求精的工作态度和不断的完善创新理念以及自强不息，斗志昂扬的的企业精神将**生工生物工程供应和您一起携手步入辉煌，共创佳绩，一直以来，公司贯彻执行科学管理、创新发展、诚实守信的方针，员工精诚努力，协同奋取，以品质、服务来赢得市场，我们一直在路上！