上海18s高通量测序公司

时间:2022年09月01日 来源:

真核/原核无参mRNA-Seq,项目介绍;测序使用Illumina Xten平台,测序原始数据质控后进行拼接,并进一步对拼接所得转录本进行功能注释、CDD、CDS分析,SNP分析,SSR标记开发等分析。在计算基因的表达量后,进行基因表达差异及差异基因GO、KOG(原核生物为COG)、KEGG功能富集分析,KEGG pathway等分析。对于多个样本,可进行重复相关性检查、共表达分析、PCA主成分分析。另外,还可以进行基因功能互作、蛋白网络互作等分析,深入研究基因功能,进一步揭示基因间互作网络等信息,为研究网络调控机理提供方向。 什么是KBSeq全质粒测序?上海18s高通量测序公司

台盼蓝染色原理:台盼蓝染色原理:台盼蓝不能透过活细胞正常完整的细胞膜,故活细胞不被染色。而死细胞的细胞膜透性增高,可使染料进入细胞内而使死细胞染成淡蓝色。

通过显微镜使用血球计数板质检得到质检结果:明场(细胞未染色):主要可以观察悬液背景质量(背景干净,无杂质碎片,无细胞团块);台盼蓝场(细胞与台盼蓝染色后):主要可以观察活性(主要为活细胞,未染色蓝色的为活细胞);通过台盼蓝场计算活率:90%>80%;细胞浓度:710cells/µl;等结果来看,血球计数板质检结果的展示可以看出所有指标均符合上机标准,属于高质量单细胞悬液。 上海市SNP高通量测序项目近年来,随着高通量测序技术的发展和普及,单细胞测序技术发展十分迅速。

通过显微镜使用血球计数板质检能观察到悬液背景质量和细胞数目及活性的评估。让我们再来回顾一下台盼蓝染色原理:台盼蓝染色原理:台盼蓝不能透过活细胞正常完整的细胞膜,故活细胞不被染色。而死细胞的细胞膜透性增高,可使染料进入细胞内而使死细胞染成淡蓝色。怎样通过血球计数板进行质检操作呢?将血球计数板擦拭干净,取干净的盖玻片盖在计数板上;将细胞悬液混匀(或10µl台盼蓝+10µl细胞悬液),吸出10µl悬液至计数板上盖玻片的一侧使细胞核悬液铺满盖玻片和计数板之间;在显微镜下分别对V1/V2/V3/V4四个计数区域进行计数;按细胞计数公式进行计算,计算公式:细胞总数={(V1+V2+V3+V4)/4}*10000*悬液体积*稀释倍数,V1/V2/V3/V4为各个计数区的细胞数目,细胞活率=活细胞数目/总细胞数目*100%。

长链非编码RNA(lncRNA)测序(只限有参考基因组物种),项目介绍:长链非编码RNAs(Long non-coding RNAs,LncRNAs)是一类转录本长度大于200 nt且不编码蛋白质的RNAs(不含rRNA),普遍存在于各种生物体内。哺乳动物基因组序列中4%~9%的序列产生的转录本是LncRNA(相应的蛋白编码RNA比例是1%)。近年来研究表明,LncRNA参与了多种重要的调控过程,如X染色体沉默、基因组印记及染色质修饰等。通过LncRNA测序,可以快速获得与其生物学过程或者疾病相关的LncRNA的表达变化,从而促进LncRNA的深入研究。ChIP项目至少要求50ng DNA,以Qubit 2.0检测为准。其余具体咨询生工高通量测序部。

扩增子测序,项目介绍:随着基因编辑技术(尤其是CRISPR-cas9技术)的发展,科研人员使用传统的Sanger测序技术无法快速有效鉴定基因编辑效率。但是,通过对靶基因区域附近设计引物,进行PCR扩增,并对PCR产物进行高通量测序,可以快速高效的获得目标区域的突变频率信息,尤其是对低频突变的检测效果远远优于一代测序,性价比极高。16S全长分类测序,项目介绍:16S全长测序分析主要是对 16S rRNA基因全长进行扩增,基于PacBio 测序平台测序. 相比较二代测序只选择 1-2 个高变区进行测序,三代可以获得全长的 16S 序列,更多变异区信息可以提高物种鉴定的分辨率,还可以提高对于群落组成的鉴定的精度。另外,针对fungus/真核生物,也可以采用类似的办法,扩增ITS/18S全长,进行物种分类测序,提高鉴定精度。准确、迅速,可以说是KBSeq的代名词了。羟甲基化测序高通量测序测序

生工生物接受客户自备文库测序项目。上海18s高通量测序公司

对于微生物样品,请客户如实声明所属物种;对于可能致病的微生物,生工将拒收。以固体培养基培养的样品,需将样品从培养基上刮取下来,用干冰寄送;以液体培养基培养的样品,需离心后弃培养液收集样品,用RNA组织保存液(例如RNA-Be-Locker A)保存,以干冰或冰袋寄送;没有RNA组织保存液的情况下,也可用液氮或干冰乙醇速冻,保存于-80°C 冰箱,埋于足量干冰寄送。***样品送样量需至少达到100 mg/样;细菌样品送样量需至少达到107(10的7次方)数量级,同时,在与样本一同寄送的送样表上,标明属于革兰氏阳性菌(G+)还是革兰氏阴性菌(G-)。上海18s高通量测序公司

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