上海16s高通量测序应用

生工高通量测序样品要求，环境样品：如果是新鲜土壤/污泥样品，可以以冰袋运输，不超过3天;如果是冻存过的样品（-20°C或者-80°C冰箱保存），为避免反复冻融，建议用足量的干冰（根据经验，在秋冬季节，如果打包合适，3公斤块状干冰可以维持30-40小时）寄送;如果是水体样品，建议采用滤膜过滤后，将滤膜寄送来生工。生工不负责过滤。要求滤膜3张，冰袋运输，不超过3天。其余特殊环境样品，具体咨询生工高通量测序部。

DNA样品：请提供电泳胶图，浓度>20 ng/μl，总量一般1～2 μg。乙醇沉淀DNA或冻干DNA，可冰袋运输，不超过3天。 准确、迅速，可以说是KBSeq的代名词了。上海16s高通量测序应用

悬液制备好后质检结果的判断也是大家需要掌握的必备技能。单细胞悬液质检关卡究竟是怎样运作的呢？单细胞悬液质控要求：•细胞浓度：700-1200cells/µl；•细胞活率>80%（当细胞悬液活率低于70%时建议进行去除死细胞处理）；细胞团及碎片杂质<5%（无细胞粘连，无明显的细胞碎片和细胞团，并保证细胞的完整性）；•细胞状态：细胞直径在7-40um之间（细胞直径过大则建议进行抽核处理）；•不存在逆转录抑制剂和非细胞的核酸分子。微生物高通量测序项目请合理安排样品寄送时间，避免样本在周六、周日或法定节假日到达生工生物。

如果你的样品是质粒或者是菌液，那为什么不试试我们的KBSeq呢？准确、迅速，可以说是KBSeq的代名词了，关键是还可以省钱，估计这是很多小伙伴们一定会说，你这个服务单价可比Sanger贵多了，怎么可能会省钱呢？Sanger测序的价格：常规的一代测序基本上要每800 bp就测一个反应，那我们来算一下14000/800=17.5，那基本上就要测18个反应了，按照现在生工官方的价格区间，这个属于反应数在10-49个反应之间的，那每个反应的价格为26元，这样算下来18*26=468元，还要加上引物合成的费用，实验周期的话大概率是要超过15天的。KBSeq全质粒测序的价格：序列长度属于6-15 kb之间，159元，实验的周期大概在5-7天左右。

使用显微镜进行悬液质检操作时应注意：1.使用血球计数板时，可以提前镜检观察每小格计数室内是否洁净无杂质。若有杂质灰层，则需要多次清洗，直至计数室洁净无瑕；2.质检前将悬液轻微震荡或使用扩口***头吹打混匀；3.台盼蓝染色后需要尽快完成细胞计数，一般建议不要超过10分钟；4.如果方格中细胞数目过多，难以数清，应当对细胞悬液进行稀释以便于计数；5.对于压在方格界线上的细胞应当计数同侧相邻两边上的细胞数，一般可采取“数上线不数下线，数左线不数右线”的原则处理，另两边不计数。如果你的样品是质粒或者是菌液，那为什么不试试我们的KBSeq呢？

什么是KBSeq全质粒测序？它基于第二代测序技术，一次性对大量质粒（比较多可达6000个样本）进行并行测序，利用生物信息学分析，对数据进行序列组装并获得每一个质粒的完整序列信息。所以我们也称它为，可以部分替代一代测序的高通量测序技术。测序长度：对于测序长度较长，如果我们用Sanger测序往往需要花费大量的时间，而我们KBSeq全质粒测序则只需要5-7天，就可以测通片段长度小于30kb以下的片段。样本用量：KBSeq全质粒测序对于样本的量，要求的也比较少，比如质粒我们的样本要求DNA的浓度需≥ 1 ng/μl, 体积需≥5 μl，如果比较珍贵的样本或者是样本比较难提取的，KBSeq就更为适合了。单细胞转录组测序指在单细胞水平上对 mRNA 进行高通量测序和分析的技术。上海转录组高通量测序项目

对于需要进行RNA抽提的部分特殊样品，可以将组织在液氮中研磨后用TRIzol悬浮后用普通冰袋寄送。上海16s高通量测序应用

对于微生物样品，请客户如实声明所属物种；对于可能致病的微生物，生工将拒收。以固体培养基培养的样品，需将样品从培养基上刮取下来，用干冰寄送；以液体培养基培养的样品，需离心后弃培养液收集样品，用RNA组织保存液（例如RNA-Be-Locker A）保存，以干冰或冰袋寄送；没有RNA组织保存液的情况下，也可用液氮或干冰乙醇速冻，保存于-80°C 冰箱，埋于足量干冰寄送。***样品送样量需至少达到100 mg/样；细菌样品送样量需至少达到107（10的7次方）数量级，同时，在与样本一同寄送的送样表上，标明属于革兰氏阳性菌（G+）还是革兰氏阴性菌（G-）。上海16s高通量测序应用

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