上海lncRNA高通量测序平台

时间:2022年09月28日 来源:

RNA样品:1.请务必提供每个样品具体的浓度、体积、制备时间以及物种来源。比较好附上电泳胶图或者 Agilent Bioanalyzer 仪器检测数据等;2.对于普通转录组样品,请提供浓度≥100 ng/µl、总量≥2 µg 的总 RNA 样品,样品请去蛋白并进行 DNase处理;一般情况下,普通转录组测序需要 RNA 样品的 OD260/OD280为 2.0~2.2,Agilent Bioanalyzer 2100 器检测获得的总RNA 28S:18S≥1,RIN≥8;对于全长转录组测序样品(ISO-seq),请提供浓度大于200 ng/ul,总量大于5 μg的总RNA样品。样品请去蛋白并进行 DNase 处理;全长转录组测序需要 RNA 样品的 OD260/OD280 为 2.0~2.2,2.3Agilent Bioanalyzer 2100 器检测获得的总RNA 28S:18S≥1,RIN≥8.5;生工生物已开展10x单细胞转录组测序(scRNA-seq)服务,如果正好您有需要,那就快快来call我们吧!上海lncRNA高通量测序平台

生工人线粒体基因组测序(多重扩增法),项目介绍:生工生物高通量测序部采用多重扩增技术,对人线粒体基因组进行扩增捕获,并进一步采用Illumina测序平台进行高通量测序。该技术方案可以快速扩增到几乎线粒体全长,并进行高深度测序,下游提供常规比对筛查突变等生物信息分析。客户提供样品类型:1.人来源DNA,浓度大于1ng/ul,总量大于20ng,以Qubit检测结果为准2.运输条件:冰袋运输。交付信息:1.测序原始数据交付实验报告2.测序原始数据3.突变分析结果。上海地区多重扩增高通量测序公司DNA样品建议用蓝冰运输。

生工高通量测序样品要求,RNA样品:请提供浓度≥750 ng/μl、总量≥2μg的总RNA样品,样品请去蛋白并进行DNase处理;请务必提供每个样品具体的浓度、体积、制备时间以及物种来源。比较好附上QC数据,可以是电泳胶图、分光光度值、Nanodrop仪器检测数据或者Agilent Bioanalyzer仪器检测数据等;一般情况下,转录组测序需要Agilent Bioanalyzer仪器检测获得的总RNA 28S:18S≥1,RIN≥7;小RNA测测序不可采用常规柱式总RNA提取试剂盒,可选择传统总RNA提取法(如乙醇沉淀、异丙醇沉淀等)或者选用专门的小RNA提取试剂盒;寄送RNA样品请置于1.5 ml离心管中,管上注明样品名称、浓度以及制备时间,管口使用Parafilm封口。在运输前将所有样品管固定于50 ml带盖离心管中,再将50 ml管放在封口袋中。使用足量的干冰运输,并且尽量选用较快的邮递方式,以降低运输过程中样品降解的可能性。

使用显微镜进行悬液质检操作时应注意:1.使用血球计数板时,可以提前镜检观察每小格计数室内是否洁净无杂质。若有杂质灰层,则需要多次清洗,直至计数室洁净无瑕;2.质检前将悬液轻微震荡或使用扩口***头吹打混匀;3.台盼蓝染色后需要尽快完成细胞计数,一般建议不要超过10分钟;4.如果方格中细胞数目过多,难以数清,应当对细胞悬液进行稀释以便于计数;5.对于压在方格界线上的细胞应当计数同侧相邻两边上的细胞数,一般可采取“数上线不数下线,数左线不数右线”的原则处理,另两边不计数。Life Ion torrentPGM 运行314、316、318芯片,可以承接扩增子测序、靶区域测序、基因组重测序服务。

核酸适配体测序,项目介绍:核酸适配体是一类能够特异性地和靶物质结合的寡核苷酸序列。它可作用于蛋白质、金属离子、小分子化合物、细胞膜表面受体等靶标。其结合能力可与抗体相当甚至更强,同时具有低免疫原性、 稳定性好等特点,并可结合各种药物及载体构建多元复合靶向给药系统用于tumour靶向treat, 在生物医学领域有潜在高价值。生工生物针对核酸适配体特殊结构,结合Illumina MiSeq测序平台,可以快速对核酸适配体文库进行大规模高通量测序,省去克隆测序的麻烦,提高测序深度,快速计算适配体序列频率,方便科研客户快速评估序列富集程度。PacBio Sequel/RSII 该测序平台读长超长,平均可达10 kb以上。上海高通量测序服务

KBSeq全质粒测序对于样本的量,要求的也比较少。上海lncRNA高通量测序平台

什么是KBSeq全质粒测序?它基于第二代测序技术,一次性对大量质粒(比较多可达6000个样本)进行并行测序,利用生物信息学分析,对数据进行序列组装并获得每一个质粒的完整序列信息。所以我们也称它为,可以部分替代一代测序的高通量测序技术。测序长度:对于测序长度较长,如果我们用Sanger测序往往需要花费大量的时间,而我们KBSeq全质粒测序则只需要5-7天,就可以测通片段长度小于30kb以下的片段。样本用量:KBSeq全质粒测序对于样本的量,要求的也比较少,比如质粒我们的样本要求DNA的浓度需≥ 1 ng/μl, 体积需≥5 μl,如果比较珍贵的样本或者是样本比较难提取的,KBSeq就更为适合了。上海lncRNA高通量测序平台

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