上海市微生物高通量测序技术

时间:2022年10月10日 来源:

16s/18s/ITS微生物分类测序,项目介绍:环境微生物是自然界中分布建议广、种类建议多、数量比较大的生物类群,其群落结构及多样性和微生物的功能及代谢机理是微生物生态学的研究热点,对于我们研究微生物与环境的关系、环境治理和微生物资源的利用以及人类医疗健康有着重要的理论和现实意义。随着高通量测序技术的发展以及大量序列数据的积累,通用引物扩增结合高通量测序技术,可以快速检索环境内微生物的群落结构。这项运用我们称之为微生物分类测序。如Illumina公司的MiSeq高通量测序平台不仅可实现对多样品的多个可变区同时测序,而且在测序速度和测序通量上都有进一步提升,目前此平台已在微生物多样性群落结构研究方面受到了广大学者的认可。近年来,随着高通量测序技术的发展和普及,单细胞测序技术发展十分迅速。上海市微生物高通量测序技术

RNA类高通量测序样品要求:对于需要进行 RNA 抽提的样品,请使用新鲜取样的实验材料,当场分成小块(动物样品厚度需小于0.5 cm,植物样品厚度需小于0.3 cm)后立即用液氮或干冰乙醇速冻,保存于-80°C 冰箱,埋于足量的干冰(根据经验,在秋冬季节,如果打包合适,5 公斤块状干冰可以维持 50 小时,而小块的干冰能更好的包裹样品,但需比块状干冰多加些)中用保温箱寄送。一般组织样品,送样量至少200 mg/样;如果样品属于孢子,送样量至少500 mg/样。上海生工高通量测序原理对于需要进行RNA抽提的部分特殊样品,可以将组织在液氮中研磨后用TRIzol悬浮后用普通冰袋寄送。

生工高通量测序样品要求,组织/细胞样品:请使用新鲜取样的实验材料,当场分成小块后立即用液氮或干冰乙醇速冻,保存于-80°C冰箱,用足量的干冰(根据经验,在秋冬季节,如果打包合适,3公斤块状干冰可以维持30-40小时)寄送;于微生物样品,请客户如实声明所属物种,对于可能致病的微生物,生工保留拒收的权利;对于需要进行RNA抽提的样品,可以但不建议将组织在液氮中研磨后用TRIzol悬浮后用普通冰袋寄送,具体情况请先取得沟通。

高通量测序技术是可以平行对数百万甚至数十亿条序列测序的技术。在基因组测序、转录组测序、宏基因组测序、表观遗传测序、外显子捕获测序、靶区域测序等诸多科研及精细医疗检测领域内有普遍的运用。生工生物工程(上海)股份有限公司自2011年成立高通量测序部以来,逐步引进了Illumina,Life,PacBio等二代/三代测序平台。建立了2000m2高标准实验室(通过了国家ISO认证)以及10PB级运算能力的服务器集群,能满足绝大多数科研客户的研究需要。同时,生工高通量测序团队建设也在不断完善中,目前有50余专职员工,其中高级技术人员以及高级生物信息工程师占比50%以上,5年来,通过生工高通量测序结果发表的文章累计影响因子超过1000分以上。于微生物样品,请客户如实声明所属物种,对于可能致病的微生物,生工保留拒收的权利。

样本寄送时,请将填写完整的纸质版《高通量测序送样表》密封于塑料袋内,随样本一起寄出,纸质版的样本信息单用于样本接收人员在收到样本后及时并正确的保存并录入样本,如无纸质版的样本信息单可能会延误项目周期;样本管壁或管盖上标明的样本名称需要与《高通量测序送样表》里样本名称一致,这样可以避免我们收到样本后与您确认样本编号而耽误样本质检、提取实验;如有特殊情况,请在《高通量测序送样表》中注明;样品编号请避免使用中文、罗马数字、“-”以及特殊符号标示,避免分析的时候系统无法识别,导致分析无法完成;我们分析人员建议编号可以采用英文字母与阿拉伯数字结合的形式,字符比较好不要过长,避免绘制部分分析图的时候难以全部展示。PacBio Sequel/RSII 该测序平台读长超长,平均可达10 kb以上。上海市基因组高通量测序应用

KBSeq全质粒测序只能测菌液和质粒,像PCR产物什么的还是送一代测序吧。上海市微生物高通量测序技术

核酸适配体测序,项目介绍:核酸适配体是一类能够特异性地和靶物质结合的寡核苷酸序列。它可作用于蛋白质、金属离子、小分子化合物、细胞膜表面受体等靶标。其结合能力可与抗体相当甚至更强,同时具有低免疫原性、 稳定性好等特点,并可结合各种药物及载体构建多元复合靶向给药系统用于tumour靶向treat, 在生物医学领域有潜在高价值。生工生物针对核酸适配体特殊结构,结合Illumina MiSeq测序平台,可以快速对核酸适配体文库进行大规模高通量测序,省去克隆测序的麻烦,提高测序深度,快速计算适配体序列频率,方便科研客户快速评估序列富集程度。上海市微生物高通量测序技术

生工生物工程(上海)股份有限公司汇集了大量的优秀人才,集企业奇思,创经济奇迹,一群有梦想有朝气的团队不断在前进的道路上开创新天地,绘画新蓝图,在上海市等地区的医药健康中始终保持良好的信誉,信奉着“争取每一个客户不容易,失去每一个用户很简单”的理念,市场是企业的方向,质量是企业的生命,在公司有效方针的领导下,全体上下,团结一致,共同进退,**协力把各方面工作做得更好,努力开创工作的新局面,公司的新高度,未来生工生物工程供应和您一起奔向更美好的未来,即使现在有一点小小的成绩,也不足以骄傲,过去的种种都已成为昨日我们只有总结经验,才能继续上路,让我们一起点燃新的希望,放飞新的梦想!

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