上海18s高通量测序NGS

时间:2022年10月11日 来源:

生工其他PCR产物测序,项目介绍:随着基因编辑技术(尤其是CRISPR-cas9技术)的发展,科研人员使用传统的Sanger测序无法快速有效鉴定基因编辑效率。但是,通过对靶基因区域附近设计引物,进行PCR扩增,并对PCR产物进行高通量测序,可以快速高效的获得目标区域的突变频率信息,尤其是对低频突变的检测效果远远优于一代测序,性价比极高。总DNA 或者包装完好的原始样品(如土壤、粪便、 水体和口腔物);样品名称清晰,冷藏运输。如有对照与实验样品的区分,标明正常样品与实验样品,如有分组,详细描述分组分析信息,以及分组比较的分析需求信息。Illumina HiSeq2500/4000 可以运行PE150/PE250模式。上海18s高通量测序NGS

台盼蓝染色原理:台盼蓝染色原理:台盼蓝不能透过活细胞正常完整的细胞膜,故活细胞不被染色。而死细胞的细胞膜透性增高,可使染料进入细胞内而使死细胞染成淡蓝色。

通过显微镜使用血球计数板质检得到质检结果:明场(细胞未染色):主要可以观察悬液背景质量(背景干净,无杂质碎片,无细胞团块);台盼蓝场(细胞与台盼蓝染色后):主要可以观察活性(主要为活细胞,未染色蓝色的为活细胞);通过台盼蓝场计算活率:90%>80%;细胞浓度:710cells/µl;等结果来看,血球计数板质检结果的展示可以看出所有指标均符合上机标准,属于高质量单细胞悬液。 多重PCR高通量测序技术X仪器本身有16个通道(Controller为8通道),每个通道极限多捕获20000个细胞(Controller为10000个细胞) 。

对于细胞样品,送样量需达到 5 × 106(5乘10的6次方)数量级。富集后置于 2 ml Ep管中,用 1 ml TRIzol 重悬,注意取样后立即用液氮或干冰乙醇速冻,保存于-80°C 冰箱,埋于足量的干冰中用保温箱寄送。强烈建议细胞样品先做细胞鉴定及支原体/衣原体污染之后,再送出来。对于血液样本,只接收未冻存过的抗凝血新鲜样本。抗凝剂不可使用肝素钠,可用EDTA或ACD抗凝剂,取血后以冰袋保存,切记不能使血液冻结,从取血之时开始计算,须在48小时之内送达生工上海总部高通量测序部。如果不能提供新鲜样本,则请提供从血液中提取的总RNA样本。备样要求详见B、RNA 样品。

样本寄送时,请将填写完整的纸质版《高通量测序送样表》密封于塑料袋内,随样本一起寄出,纸质版的样本信息单用于样本接收人员在收到样本后及时并正确的保存并录入样本,如无纸质版的样本信息单可能会延误项目周期;样本管壁或管盖上标明的样本名称需要与《高通量测序送样表》里样本名称一致,这样可以避免我们收到样本后与您确认样本编号而耽误样本质检、提取实验;如有特殊情况,请在《高通量测序送样表》中注明;样品编号请避免使用中文、罗马数字、“-”以及特殊符号标示,避免分析的时候系统无法识别,导致分析无法完成;我们分析人员建议编号可以采用英文字母与阿拉伯数字结合的形式,字符比较好不要过长,避免绘制部分分析图的时候难以全部展示。为什么要用单细胞测序技术?

生工外显子测序,项目介绍:已知人类基因组上有180000个外显子,占整个基因组约1-2%。这些区域主要负责编码蛋白。绝大多数的单基因遗传突变与复杂疾病突变都发生在外显子区域。相比于全基因组重测 序,全外显子捕获测序有测序深度高、价格便宜的优势,性价比很高。生工生物采用Aglient SureSelect系列外显子捕获系统,可以高效富集人全外显子区域,并结合Illumina XTen测序平台进行深度测序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等变异检测,形成完整的分析报告。组织材料样品(提取RNA用)建议将标签用胶带贴到管壁,干冰运输。上海地区生工生物 高通量测序产品

目前,生工生物已开展10x单细胞转录组测序(scRNA-seq)服务,如果正好您有需要,那就快快来call我们吧!上海18s高通量测序NGS

真核/原核有参mRNA-Seq,项目介绍:转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的gather,狭义上指所有mRNA的gather。转录组是研究基因表达的主要手段,是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的纽带。转录水平的调控是生物体重要的调控方式,通过转录组测序分析转录水平的调控,是目前运用较多的研究方式。测序使用Illumina Xten平台,测序原始数据经过质控后,mapping至参考基因组序列,对mapping到基因上的reads进行计数,计算基因的表达量后,进行基因表达差异及差异基因GO、KOG(原核生物为COG)、KEGG功能富集分析,KEGG pathway等分析。对于多个样本,可进行重复相关性检查、共表达分析、PCA主成分分析。另外,依据参考基因组,可进行诸如基因覆盖度、测序饱和度等验证性分析;可变剪切分析、SNP/InDel分析、新转录本预测以及联合miRNA数据进行关联分析等分析。另外,还可以进行基因功能互作、蛋白网络互作等分析,深入研究基因功能,进一步揭示基因间互作网络等信息,为研究网络调控机理提供方向。上海18s高通量测序NGS

生工生物工程(上海)股份有限公司在同行业领域中,一直处在一个不断锐意进取,不断制造创新的市场高度,多年以来致力于发展富有创新价值理念的产品标准,在上海市等地区的医药健康中始终保持良好的商业口碑,成绩让我们喜悦,但不会让我们止步,残酷的市场磨炼了我们坚强不屈的意志,和谐温馨的工作环境,富有营养的公司土壤滋养着我们不断开拓创新,勇于进取的无限潜力,生工生物工程供应携手大家一起走向共同辉煌的未来,回首过去,我们不会因为取得了一点点成绩而沾沾自喜,相反的是面对竞争越来越激烈的市场氛围,我们更要明确自己的不足,做好迎接新挑战的准备,要不畏困难,激流勇进,以一个更崭新的精神面貌迎接大家,共同走向辉煌回来!

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