靶向捕获高通量测序产品

时间:2022年10月13日 来源:

对于细胞样品,送样量需达到 5 × 106(5乘10的6次方)数量级。富集后置于 2 ml Ep管中,用 1 ml TRIzol 重悬,注意取样后立即用液氮或干冰乙醇速冻,保存于-80°C 冰箱,埋于足量的干冰中用保温箱寄送。强烈建议细胞样品先做细胞鉴定及支原体/衣原体污染之后,再送出来。对于血液样本,只接收未冻存过的抗凝血新鲜样本。抗凝剂不可使用肝素钠,可用EDTA或ACD抗凝剂,取血后以冰袋保存,切记不能使血液冻结,从取血之时开始计算,须在48小时之内送达生工上海总部高通量测序部。如果不能提供新鲜样本,则请提供从血液中提取的总RNA样本。备样要求详见B、RNA 样品。单细胞测序技术可以检测复杂组织中单个细胞不同的生物学特性.靶向捕获高通量测序产品

对于用RNA组织保存液寄送的样品,请按照RNA组织保存液说明保存和寄送。请注意:1)样品浸入组织保存液之前,对于动物组织样品,须以建议快速度将样品剪切成厚度小于0.5cm的碎块;对于植物样品,须以建议快速度将样品剪切成厚度小于0.3cm的碎块。2)鼠肝、肾和脾等小organ样品和没有蜡质保护层的植物样品可不剪切直接放入保存液中保存,有蜡质保护层的植物样品需要先将蜡表皮破坏。3)确保将样品完全浸泡在保存液中,不让其粘贴在管壁和盖上。上海市多重PCR高通量测序项目生工生物已开展10x单细胞转录组测序(scRNA-seq)服务,如果正好您有需要,那就快快来call我们吧!

生工外显子测序,项目介绍:已知人类基因组上有180000个外显子,占整个基因组约1-2%。这些区域主要负责编码蛋白。绝大多数的单基因遗传突变与复杂疾病突变都发生在外显子区域。相比于全基因组重测 序,全外显子捕获测序有测序深度高、价格便宜的优势,性价比很高。生工生物采用Aglient SureSelect系列外显子捕获系统,可以高效富集人全外显子区域,并结合Illumina XTen测序平台进行深度测序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等变异检测,形成完整的分析报告。

微生物基因组重测序(有参):目前越来越多的微生物基因组被解析出来了。从而使得科研工作者们可以对某些物种微生物进行进行物种进化、种群特征、选择压力等研究。利用高通量测序技术,对有参考基因组微生物进行多个体的基因组重测序,精细分析其与参考基因组的SNP、InDel、SV等变异信息。微生物基因组从头测序(无参):对于不断分离培养微生物的客户来说,要确定一个菌株是否是新菌株或者新菌种,较快捷的办法就是,直接进行基因组测序。利用高通量测序技术,对这些基因组进行高深度测序,然后进行基因组组装,获得基因组的框架图或者精细图甚至是完成图。从而可以快速解析其基因组结构、基因功能、进化关系。截止目前为止,生工生物可是为数不多的同时拥有ChromiumController和ChromiumX平台的公司。

对于微生物样品,请客户如实声明所属物种;对于可能致病的微生物,生工将拒收。以固体培养基培养的样品,需将样品从培养基上刮取下来,用干冰寄送;以液体培养基培养的样品,需离心后弃培养液收集样品,用RNA组织保存液(例如RNA-Be-Locker A)保存,以干冰或冰袋寄送;没有RNA组织保存液的情况下,也可用液氮或干冰乙醇速冻,保存于-80°C 冰箱,埋于足量干冰寄送。***样品送样量需至少达到100 mg/样;细菌样品送样量需至少达到107(10的7次方)数量级,同时,在与样本一同寄送的送样表上,标明属于革兰氏阳性菌(G+)还是革兰氏阴性菌(G-)。寄送 RNA 样品请置于 1.5 ml 离心管中,管上注明样品名称、浓度以及制备时间,管口使用 Parafilm 封口。上海市单细胞测序高通量测序平台

请提供电泳胶图,浓度>20 ng/μl,总量一般1~2 μg。乙醇沉淀DNA或冻干DNA,可冰袋运输,不超过3天。靶向捕获高通量测序产品

样本寄送时,请将填写完整的纸质版《高通量测序送样表》密封于塑料袋内,随样本一起寄出,纸质版的样本信息单用于样本接收人员在收到样本后及时并正确的保存并录入样本,如无纸质版的样本信息单可能会延误项目周期;样本管壁或管盖上标明的样本名称需要与《高通量测序送样表》里样本名称一致,这样可以避免我们收到样本后与您确认样本编号而耽误样本质检、提取实验;如有特殊情况,请在《高通量测序送样表》中注明;样品编号请避免使用中文、罗马数字、“-”以及特殊符号标示,避免分析的时候系统无法识别,导致分析无法完成;我们分析人员建议编号可以采用英文字母与阿拉伯数字结合的形式,字符比较好不要过长,避免绘制部分分析图的时候难以全部展示。靶向捕获高通量测序产品

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