上海地区生工生物 高通量测序项目

时间:2022年10月25日 来源:

使用显微镜进行悬液质检操作时应注意:1.使用血球计数板时,可以提前镜检观察每小格计数室内是否洁净无杂质。若有杂质灰层,则需要多次清洗,直至计数室洁净无瑕;2.质检前将悬液轻微震荡或使用扩口***头吹打混匀;3.台盼蓝染色后需要尽快完成细胞计数,一般建议不要超过10分钟;4.如果方格中细胞数目过多,难以数清,应当对细胞悬液进行稀释以便于计数;5.对于压在方格界线上的细胞应当计数同侧相邻两边上的细胞数,一般可采取“数上线不数下线,数左线不数右线”的原则处理,另两边不计数。小RNA测测序不可采用常规柱式总RNA提取试剂盒。上海地区生工生物 高通量测序项目

生工优势:1.生工高通量测序部拥有丰富的样品处理经验,日均处理样品200余例,涵盖污泥、粪便、海底沉泥、水体滤膜、植物组织、动物组织/细胞等样品,省去您处理样品的繁琐过程。2.生物信息分析经验丰富,可以满足客户标准分析到定制分析作图的需求。且生工一直秉持只要生工已经标准化的分析内容(以生工分析报告模板为准),全部无费用。3.生工生物拥有生命科学领域较全的产品及服务体系,可以承接从分子到蛋白各个层级的实验项目。一站式解决问题。上海地区全质粒测序高通量测序原理请合理安排样品寄送时间,避免样本在周六、周日或法定节假日到达生工生物。

转录组测序,项目介绍:RNA-Seq,是基于新一代测序技术的转录组学研究方法:首先提取生物样品的全部转录的 RNA 并进行 mRNA 富集,然后反转录为 cDNA 后进行新一代高通量测序,在此基础上进行短片段拼接组装,从而获得一个个单独转录本,进而可以对该生物样品当前状态的基因表达状况有全局了解。对不同阶段或部位生物样品的转录组进行 比较分析,则可以在转录层面得到基因表达水平的变化,针对关键基因则可以进行代谢通路(Pathway)的构建。

简化基因组测序,项目介绍:通过限制性内切酶对基因组DNA进行酶切,并对酶切片段进行高通量测序,这种通过酶切降低基因组的复杂度的测序技术统称为简化基因 组测序技术。利用生物信息学方法,进行SNP单体型图谱绘制,全基因组关联分析(GWAS),连锁分析和QTL定位分析,种群进化,主成分分析等。比较有代表性的方法有GBS-seq和RAD-seq。宏全基因组测序,项目介绍:宏基因组指特定环境样品内全部遗传物质的总和。直接提取环境样品内全部基因组DNA,随后进行大规模高通量测序(shotgun 策 略)。测到数据后,先进行必要的数据质控,而后进行基因组拼接、注释(物种、基因功能),使得我们可以获取环境样品内菌群分布、系统进化、功能代谢等信息。该方法已经得到普遍的运用。生工生物已开展10x单细胞转录组测序(scRNA-seq)服务,如果正好您有需要,那就快快来call我们吧!

生工高通量测序样品要求,RNA样品:请提供浓度≥750 ng/μl、总量≥2μg的总RNA样品,样品请去蛋白并进行DNase处理;请务必提供每个样品具体的浓度、体积、制备时间以及物种来源。比较好附上QC数据,可以是电泳胶图、分光光度值、Nanodrop仪器检测数据或者Agilent Bioanalyzer仪器检测数据等;一般情况下,转录组测序需要Agilent Bioanalyzer仪器检测获得的总RNA 28S:18S≥1,RIN≥7;小RNA测测序不可采用常规柱式总RNA提取试剂盒,可选择传统总RNA提取法(如乙醇沉淀、异丙醇沉淀等)或者选用专门的小RNA提取试剂盒;寄送RNA样品请置于1.5 ml离心管中,管上注明样品名称、浓度以及制备时间,管口使用Parafilm封口。在运输前将所有样品管固定于50 ml带盖离心管中,再将50 ml管放在封口袋中。使用足量的干冰运输,并且尽量选用较快的邮递方式,以降低运输过程中样品降解的可能性。近年来,随着高通量测序技术的发展和普及,单细胞测序技术发展十分迅速。全质粒测序高通量测序

在运输前将所有样品管集中放于大包装中。上海地区生工生物 高通量测序项目

台盼蓝染色原理:台盼蓝染色原理:台盼蓝不能透过活细胞正常完整的细胞膜,故活细胞不被染色。而死细胞的细胞膜透性增高,可使染料进入细胞内而使死细胞染成淡蓝色。

通过显微镜使用血球计数板质检得到质检结果:明场(细胞未染色):主要可以观察悬液背景质量(背景干净,无杂质碎片,无细胞团块);台盼蓝场(细胞与台盼蓝染色后):主要可以观察活性(主要为活细胞,未染色蓝色的为活细胞);通过台盼蓝场计算活率:90%>80%;细胞浓度:710cells/µl;等结果来看,血球计数板质检结果的展示可以看出所有指标均符合上机标准,属于高质量单细胞悬液。 上海地区生工生物 高通量测序项目

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