上海粪便菌群检测预测疾病
16SrRNA基因测序以细菌16SrRNA基因测序为主,主要是研究样品中的物种分类、物种丰度系统进化、功能预测以及微生物与环境互作关系等。16SrRNA基因是编码原核生物核糖体小亚基的基因,长度约为1542bp,其分子大小适中,突变率小,是细菌系统分类学研究中常用和有用的标志。16SrRNA基因序列包括9个可变区和10个保守区,保守区序列反映了物种间的亲缘关系,而可变区序列则能体现物种间的差异。16SrDNA是细菌染色体上编码16SrRNA相对应的DNA序列,16srRNA是由16srDNA转录来的,一般扩增检测和分析的对象都是16srDNA。菌群检测是一种能够揭示人体内微生物生态变化的技术。上海粪便菌群检测预测疾病
约50%的类风湿关节炎(RA)患者对甲氨蝶呤改善不产生充分的应答,但缺乏可预测患者应答的预后标志物。ArthritisandRheumatology上发表的一项新研究,对比分析了对甲氨蝶呤改善应答及不应答的RA患者在改善前的肠道菌群差异,发现基于菌群建立的模型可较准确地预测患者对甲氨蝶呤改善的应答。另外,体外共培养肠道菌群与甲氨蝶呤的结果表明,肠道菌群对甲氨蝶呤的代谢或减少可能抑制甲氨蝶呤的改善效果。①纳入26名新发RA患者,16名对甲氨蝶呤改善不应答;②应答患者与不应答患者的粪便菌群多样性、组成及功能存在差异;③不应答患者的菌群多样性更高,厚壁菌门/拟杆菌门比值增加,广古菌门丰度升高,MAPK信号、DNA复制、脂肪酸降解、嘌呤代谢等相关通路明显富集;④在另外21名新发RA患者中,基于菌群的模型可较准确地预测对甲氨蝶呤改善的应答(AUC=);⑤体外共培养患者的粪便菌群与甲氨蝶呤,培养后的甲氨蝶呤水平与患者应答明显相关。浙江自闭症患者菌群检测私人定制肠道菌群检测:对抗神经类疾病新武器。
AnnalsoftheRheumaticDiseases上发表的一项研究,对类风湿关节炎(RA)患者及健康人的肠道菌群进行了宏基因组关联分析,鉴定出了一些与RA相关的菌种及菌群功能,并发现了一些具有人种特异性的RA相关的宏基因组-宿主基因组关联,提示宿主基因组、肠道菌群及RA的发病机制之间存在密切联系。①纳入82名类风湿关节炎(RA)患者及42名健康对照,对肠道菌群进行全基因组深度测序;②RA患者的肠道菌群宏基因组中,普氏菌属中多个菌种的丰度高于健康人;③RA患者的肠道菌群宏基因组中,R6FCZ7(与氧化还原反应相关的基因)的丰度明显低于健康人,而代谢相关通路(脂肪酸生物合成、粘多糖降解等)明显富集;④通过对比宏基因组关联分析(MWAS)与全基因组关联分析(GWAS),鉴定出一些RA相关的宏基因组-宿主基因组之间相关的通路。
肠道菌群失调与自身免疫疾病的发展相关。Nature Communications上发表的一项新研究,发现类风湿关节炎(RA)的发生与肠道屏障功能的受损密切相关,新发病RA患者的血清连蛋白表达增加,而肠道紧密连接蛋白表达降低。在关节炎小鼠模型中,肠道炎症发生早于关节炎的发病,而靶向肠道屏障或连蛋白可起到缓解关节炎的作用。该研究提示,靶向肠道屏障或是改善类风湿关节炎等自身免疫疾病的潜在策略。①对比40名RA患者、41名健康对照、19名cancer患者及21名丙肝患者,发现RA患者的血清连蛋白水平明显升高;②纵向研究结果显示,血清连蛋白水平较高者在1年内发生RA的风险更高;③RA患者(包括新发病患者)肠道上皮细胞中的紧密连接蛋白(包括occludin与claudin-1)表达明显降低;④在胶原诱导的关节炎(CIA)小鼠模型中,肠道炎症及T细胞在肠道中的累积发生于关节炎发病之前;⑤丁酸盐处理降低肠道通透性,或使用药物靶向抑制连蛋白可缓解CIA。上海沃本--专业的肠道菌群检测选择;
某些肠道细菌被认为是AS疾病进展的新因素。研究发现,中国AS患者的类杆菌属(Bacteroides)和普雷沃氏菌属(Prevotella)相对减少,而链球菌属(Streptococcus)和大肠埃希菌属(Escherichia)富集。然而,在波兰东部,总胆固醇水平和低密度脂蛋白胆固醇值高的中年男性肠道中富含普雷沃氏菌属(Prevotella),但是梭菌属(Clostridium)和粪杆菌属(Faecalibacterium)含量较低。例如,一些AS患者的条件致病菌柯林斯氏菌属(Collinsella)增多。同时,有些微生物也可以降低AS斑块的形成。比如,在患者和小鼠模型中均发现,产丁酸盐的细菌罗斯伯里氏菌属(Roseburia)和真杆菌属(Eubacterium)的相对减少与AS病变的发展呈负相关关系。据推测,这些微生物可能会影响宿主的炎症水平。 专业肠道菌群检测请到上海沃本!上海肠道菌群检测组成
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1.特异性地引物设计策略,靶向扩增细菌的16SrRNA基因的V4高可变区。经NGS测序分析之后,能够获得更丰富的肠道菌群信息;2.采用Illumina付费数据库进行生物信息学分析,可部分分类到菌种水平,提供更精细的菌群分类及丰度数据,相对准确地评估菌群分布;3.采样装置中有特殊的样品保存液,样品可常温保存28天;4.拥有自动化的报告生成系统,能够快速产生检测报告,明显缩短检测周期;5.专业的取样装置,取样操作简单。5.报告内容含有有害菌、有益菌的含量分析。上海粪便菌群检测预测疾病
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