江西组织pcr原理

时间:2021年12月30日 来源:

PCR引物设计的原则PCR反应中有两条引物,即5′端引物和3′引物。设计引物时以一条DNA单链为基准(常以信息链为基准),5′端引物与位于待扩增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物与位于待扩增片段3′端的一小段DNA序列互补。(1)引物设计的基本原则引物长度:15-30bp,常用为20bp左右。引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC比较好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列参照。引物内部不应出现互补序列。两个引物之间不应存在互补序列,尤其是避免3′端的互补重叠。引物与非特异扩增区的序列的同源性不要超过70%,引物3′末端连续8个碱基在待扩增区以外不能有完全互补序列,否则易导致非特异性扩增。引物3‘端的碱基,特别是较末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,比较好选择是G和C。引物的5′端可以修饰。如附加限制酶位点,引入突变位点,用生物素、荧光物质、地高辛标记,加入其它短序列,包括起始密码子、终止密码子等。荧光定量pcr的原理和步骤是什么?江西组织pcr原理

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PCR实验技术中的Touch-downPCR介绍:Touch-downPCR又称降落PCR.即选定一个温度范围,如50—35℃,每降1-2℃进行1-2个循环,然后在50度下进行15个循环。Touch-down的原理随着退火温度的降低,特异性逐步降低,但特异性条带在温度较高时已经扩增出来,其浓度远远超过非特异性条带,随着退火温度的降低,特异性条带优先被扩增。选择初始复性温度的原则起始复性温度应该比引物的Tm值高出5-10度,然后每个循环递减1-2度Touch-downPCR的应用范围lowcopyoftargetedDNA;highdegreedegeneracy(orlessspecific)ofthefirstsetofprimers;江西组织pcr原理做pcr检测,需要注意哪些事项?

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细胞长满80%瓶底或皿底,换培养液,第二天提取RNA(倒掉培养液,5-10ml冰PBS洗涤细胞2次空干)加1ml冰TRizoL,用力振荡培养瓶使细胞完全脱落,加样器吹打(吸入1.5ml离心管,旋涡振荡10秒,室温静置5分钟)加氯仿200ul,漩涡混匀器振荡10秒,冰盒上静置10分钟(40C,8000rpm,5分钟,)吸取上层水相0.5-0.7ml移至另一1.5ml离心管中,加异丙醇0.5-0.7ml(充分混匀,冰盒上静置10分钟,40C,12000rpm,15分)弃上清,加75%冰乙醇1ml,颠倒混匀数次(40C,12000rpm,15分)弃上清,沉淀快速风干。但不要完全干燥,加DEPC处理去离子水50-100ul取5ul作RNA电泳,5ul作RNA定量,余-800C冰箱保存

PCR实验技术中的5’RACE-PCR介绍:利用mRNA的3‘末端的poly(A)尾巴作为一个引物结合位点,以Oligo(dT)30MN作为锁定引物在反转录酶MMLV作用下,反转录合成标准一号链cDNA.利用该反转录酶具有的末端转移酶活性,在反转录达到一号链的5‘末端时自动加上3一5个(dC)残基,退火后(dC)残基与含有SMART寡核苷酸序列Oliogo(dG)通用接头引物配对后,转换为以SMART序列为模板继续延伸而连上通用接头(figure2)。然后用一个含有部分接头序列的通用引物UPM(universalprimer,UPM)作为上游引物,用一个基因特异引物2(GSP2genespecificprimer,GSP)作为下游引物,以SMART一号链cDNA为模板,进行PCR循环,把目的基因5‘末端的cDNA的片段扩增出来。比较终,从2个有相互重叠序列的3'/5‘-RACE产物中获得全长cDNA,或者通过分析RACE产物的3‘和5‘端序列,合成相应引物扩增出全长cDNA.pcr检测主要是检测什么?

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PCR设计引物应遵循以下原则:①引物长度:15-30bp,常用为20bp左右。②引物扩增跨度:以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。③引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC比较好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。④避免引物内部出现二级结构,避免两条引物间互补,特别是3'端的互补,否则会形成引物二聚体,产生非特异的扩增条带。⑤引物3'端的碱基,特别是较末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,以避免因末端碱基不配对而导致PCR失败。⑥引物中有或能加上合适的酶切位点,被扩增的靶序列比较好有适宜的酶切位点,这对酶切分析或分子克隆很有好处。⑦引物的特异性:引物应与核酸序列数据库的其它序列无明显同源性。引物量:每条引物的浓度0.1~1umol或10~100pmol,以比较低引物量产生所需要的结果为好,引物浓度偏高会引起错配和非特异性扩增,且可增加引物之间形成二聚体的机会。如何挑选pcr检测试剂盒?江西组织pcr原理

简述荧光定量pcr的基本原理。江西组织pcr原理

PCR样本可分2种,DNA样本和RNA样本。一,DNA样本:已经提取好的DNA样本,负80度保存,干冰运输;血液样本,需全血,加入抗凝剂,抗凝管4度保存;组织样本,需冻存管或干净灭菌的离心管装,负80度保存,干冰运输;细胞样本,用胰酶消化后的细胞沉淀,负20度或负80度保存。二,RNA样本:提取好的RNA样本,负80度保存,干冰运输;血液样本,全血,加入抗凝剂,4度冰箱保存;组织样本,冻存管或干净灭菌离心管,负80度保存,干冰运输;细胞样本,用胰酶消化后的细胞沉淀,负20度或负80度保存。长时间保存,可加Trizol,其中血液用TrizolLS组织和细胞沉淀用Trizol。江西组织pcr原理

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