温州高通量测序空间转录组测序服务

冰冻切片的空间转录组测序在RNA捕获、文库构建方面，需要将组织切片贴合在带有mRNA结合捕获探针的载玻片上，通过甲醛固定、H&E染色得到组织切片的形态结构。再进行透化处理，使细胞中的mRNA释放，并结合到芯片相邻的捕获探针上。将捕获的mRNA反转录合成cDNA并构建测序文库进行上机测序，从而获取基因表达信息。总体来说，空间转录组的实验流程包括：组织冻存-OCT包埋-冷冻切片-固定染色-组织透化-cDNA合成及建库-上机测序，而需要客户进行样本准备的步骤相对简单：组织冻存与OCT包埋。深度的空间转录组测序数据解读助力生物健康医疗时代。温州高通量测序空间转录组测序服务

10XVisium的实验主要分为两部分：组织学板块和组学板块。组织学板块包括样品的包埋、切片、固定、染色及成像，记录切片的形态学信息；组学板块包括cDNA的合成、扩增、接头连接和测序，记录切片的转录本信息和空间位置信息。具体实验流程如下：A、切片制备和优化：取新鲜组织、冷冻、切片，并进行HE染色成像，优化确定切片是否覆盖靶向区域。B、切片固定和透化：将组织切片放置在含有与RNA结合捕获探针的载玻片上，并进行固定和透化，使细胞中的mRNA得到释放，并结合到相应的捕获探针上，从而获取基因表达信息。C、逆转和文库构建：以捕获的RNA为模板，进行cDNA合成，和测序文库制备。D、高通量上机测序：对制备好的测序文库，进行二代高通量短读长测序。E、数据可视化分析：结合HE结果，确定哪些基因有表达，表达量高低，以及这些基因的空间位置信息温州烈冰空间转录组多组学测序十二年测序经验，累计服务与5000余项重要科研项目。

空间转录组测序的数据质量和玻片有效区域的利用率、贴片的质量和透化时间息息相关。贴片质量不良会影响总的有效spot数等；而透化不合理会导致spot的reads数、基因中位数等参数。而在特异性基因表达方面，我们也可以统计空间转录组群体的特异性基因表达即Markergene，将他们在组织切片以及空转上进行着色。我们也可以对于任意一个已知的基因或者数据库中的一些细胞Marker，然后将其在基因表达在空间转录组的切片以及HE染色上展示自己的基因表达进而了解，群体中的可能的细胞组成关系。

作为2019年的明星技术之一，10x Genomics单细胞测序凭借其高通量、低成本、易操作、稳定性高等优势一直保持着高热度，目前利用该平台发表的文章已达500多篇。空间转录组技术优势：实现基因表达数据与空间定位信息的结合，解析多种类型组织切片样本中基因表达谱；无需组织解离，保留组织结构及细胞微环境，鉴定异质性组织中细胞类型，避免相关偏好性；可用于挖掘新的组织生物标记物；可与现行实验室组织分析方法轻松对接，短时间内即可完成切片及文库制备流程。测序的革新让科学研究从个体基因差异逐渐转为个体细胞的基因差异。

已发表的关于空间转录组技术有Slide-seq,LCM-seq,seqFISH,MERFISH,Liversinglecellzonation,Geo-seqandTomo-seq。这些方法或是在细胞数量上限制较大，或是存在有效测序深度不足等问题。10xGenomics公司提供的Visium空间基因表达解决方案是目前一个高通量空间转录组的商业化解决方案。该解决方案可以轻松地将空间转录组学技术应用到组织切片和染色的标准方法中，从而研究空间分辨率下整个转录组mRNA的表达情况，同时在同一组织切片中获得组织学相关信息。烈冰生物全转录组测序通过双文库构建，实现多种RNA的一网打尽。南京空间转录组测序服务公司

截至2021年10月，烈冰助力发表空间转录组测序文章近20篇。温州高通量测序空间转录组测序服务

我国经济进入“新常态”，总体上推动单细胞测序，生物大数据云分析平台，空间转录组测序，单细胞多组学测序从粗放式增长向注重质量、效率方向转变。民间资本的进入也一定程度刺激我国单细胞测序，生物大数据云分析平台，空间转录组测序，单细胞多组学测序市场活力。社会对健康类产业的关注度越来越高，迫切需要对单细胞测序，生物大数据云分析平台，空间转录组测序，单细胞多组学测序的规模和结构进行核算。以单细胞测序，生物大数据云分析平台，空间转录组测序，单细胞多组学测序为例，主打运动健康APP停留在工具层面，缺少完整的消费场景闭环，较强的工具属性停留在实现用户基础的功能需求，并未涉及足够高的用户使用价值实现，同时缺乏数字化运营的效能也是运动健康APP发展的明显桎梏，经营模式有待进一步探索。服务型项目新市场加入通常耗资巨大，单一的资本进入往往会形成极大的资本压力，因此一些重大的服务型项目往往都会通过数家有实力的资本进行组合资本。在项目的加入上可以进行分摊，每一家集团的资本压力都会得到较大的减轻，这种具有组合资本优势的服务型项目也是很多资本重点关注的资本项目。温州高通量测序空间转录组测序服务

上海烈冰生物医药科技有限公司位于江月路999号奇亚特中心22幢。公司自成立以来，以质量为发展，让匠心弥散在每个细节，公司旗下单细胞测序，生物大数据云分析平台，空间转录组测序，单细胞多组学测序深受客户的喜爱。公司秉持诚信为本的经营理念，在医药健康深耕多年，以技术为先导，以自主产品为重点，发挥人才优势，打造医药健康良好品牌。在社会各界的鼎力支持下，持续创新，不断铸造高质量服务体验，为客户成功提供坚实有力的支持。