深圳烈冰生物单细胞多组学平台

时间:2022年09月16日 来源:

烈冰生信团队倾情研发的NovelBrain®生信大数据分析平台,可实现零代码操作、简单方便:单细胞浏览器的操作简单,不需要命令行操作。简单拖拽、设置参数即可运行,即使生信0基础用户也可以运用自如;可视化展示海量结果文件:可视化展示Cluster的基因数,UMI数量、线粒体RNA占比信息;以及不同Cluster对应的细胞数量、基因表达量、RNA表达量、样本细胞分布、线粒体RNA表达量等;3D立体展示,文章动图先人一步:单细胞浏览器针对t-SNE图、UMAP图和pseudotime结果进行三维立体展示,更加直观立体的观察细胞分布和聚类情况。单细胞多组学测序技术提供了全新的视角来分析细胞的分化路径、细胞间的交互调控和细胞亚群的分离现象。深圳烈冰生物单细胞多组学平台

相对于Smart-Seq技术在细胞数量上的问题,10X平台普遍提供的细胞数量都在1000-20000不等的测序细胞量,这个量级的测序细胞量已经可以说能够完全覆盖绝大部分组织的Single Cell群体类型。因此,这两种技术对于基于基因表达进行准确细胞分型上,无论是从细胞数量上来说还是表达检测可靠性来说,都会更实用。同时依托Random Cell Label技术,使得其对于NovaSeq、HiSeq X Ten、Hiseq 4000等设备存在的Index hooping现象,相对于Smart-Seq数据来说,影响几乎可以忽略不计(10X Genomics官方网站曾给出hooping测试结果,显示无影响。西安single cell RNA单细胞多组学数据分析可视化烈冰智造PanoCell单细胞捕获,媲美国际主流的单细胞平台。

单细胞多组学测序主要包含细胞分离、文库构建、高通量测序和生物信息学分析等步骤.因此,单细胞多组学测序技术的发展也为相关算法的开发带来了机遇和挑战。利用多模态计算方法不仅可以更好地进行细胞分群和谱系追踪,还可以推断基因表达调控网络和解析细胞在组织中的空间位置等信息。多组学的联合分析需要解决的计算问题是如何将大量单细胞产生的多种不同的组学数据进行有效地生成、识别、整合与分析,并且降低数据背景噪音和样本间的批次差异.目前,单细胞多组学的生物信息分析方法仍有待发展,面临着诸多问题与挑战。

基因测序是基因检测的方法之一,其又叫基因谱测序,是国际上公认的一种基因检测标准。高通量测序技术是对传统测序一次颠覆性的改变,一次对几十万到几百万条核酸序列进行测定,被称为下一代测序技术(nextgenerationsequencing),足见其划时代的改变,同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能,所以又被称为深度测序(deepsequencing)。基因测序相关产品和技术已由实验室研究逐渐演变到临床应用,可以说,基因测序技术将是下一个改变世界的技术。为了能深入分析和理解细胞状态和命运决定的机制, 将单细胞各组学技术结合在一起的单细胞多组学技术产生。

烈冰科技于2010年诞生之初便立足于高通量测序行业,为科研学者提供专注的测序数据分析服务,先后经历基因芯片时代、基因测序、转录组测序时代...在科技日新月异的洪流中始终独占鳌头。2018年以来,单细胞测序进入发展的快车道,烈冰作为国内首批引进单细胞实验双平台的公司,依托自主研发的NovelBrain®生物大数据分析平台,为用户提供一站式全流程的单细胞测序服务和解决方案。4年的单细胞技术的积累,烈冰已具备大鼠、小鼠、斑马鱼、猴、裸鼹鼠、水稻、拟南芥等10+物种,皮肤、脑、胰腺、脂肪、心脏、花序等50+组织类型,100+细胞类型,1000+靶标基因,10000+样本处理经验。烈冰测序服务已助力300余篇国际主流期刊研究文章发表。南京上海烈冰生物单细胞多组学多组学测序

单细胞测序是高通量测序下的又一重大技术突破。深圳烈冰生物单细胞多组学平台

单细胞测序是指针对单个细胞进行全转录组测序分析,可精确地描述每一个细胞的状态,在异质性发育过程中具有不可忽视的应用价值。然而,单细胞测序无法给出固态异质化组织中细胞空间排布信息,对于揭示发育过程、病理微环境都存在很大的局限性。空间转录组测序以点阵形式记录病理切片细胞的空间信息并进行测序,可以精确指示点阵内的全部基因表达情况。空间转录组测序的加入,无疑让单细胞测序如虎添翼,更精确地勾勒了组织水平的异质性。深圳烈冰生物单细胞多组学平台

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