羟甲基化测序高通量测序产品

生工人、大、小鼠全基因组测序，项目介绍：人或者大、小鼠全部基因组重测序，研究其突变信息（包括SNP/InDel/CNV/SV），并注释突变位点信息。该技术可同时获取编码区及非编码区突变信息，被广泛应用于遗传病、tumour及其它其它疾病研究中。测序平台：HiSeq XTen平台进行PE150测序。生工微生物基因组测序，项目介绍：微生物基因组重测序（有参）目前越来越多的微生物基因组被解析出来了。从而使得科研工作者们可以对某些物种微生物进行进行物种进化、种群特征、选择压力等研究。利用高通量测序技术，对有参考基因组微生物进行多个体的基因组重测序，精细分析其与参考基因组的SNP、InDel、SV等变异信息。生物信息分析经验丰富，可以满足客户标准分析到定制分析作图的需求。羟甲基化测序高通量测序产品

生工高通量测序样品要求，RNA样品：请提供浓度≥750 ng/μl、总量≥2μg的总RNA样品，样品请去蛋白并进行DNase处理;请务必提供每个样品具体的浓度、体积、制备时间以及物种来源。比较好附上QC数据，可以是电泳胶图、分光光度值、Nanodrop仪器检测数据或者Agilent Bioanalyzer仪器检测数据等;一般情况下，转录组测序需要Agilent Bioanalyzer仪器检测获得的总RNA 28S:18S≥1，RIN≥7;小RNA测测序不可采用常规柱式总RNA提取试剂盒，可选择传统总RNA提取法（如乙醇沉淀、异丙醇沉淀等）或者选用专门的小RNA提取试剂盒;寄送RNA样品请置于1.5 ml离心管中，管上注明样品名称、浓度以及制备时间，管口使用Parafilm封口。在运输前将所有样品管固定于50 ml带盖离心管中，再将50 ml管放在封口袋中。使用足量的干冰运输，并且尽量选用较快的邮递方式，以降低运输过程中样品降解的可能性。上海市全质粒测序高通量测序公司准确、迅速，可以说是KBSeq的代名词了。

长链非编码RNA(lncRNA)测序(只限有参考基因组物种)，项目介绍：长链非编码RNAs（Long non-coding RNAs，LncRNAs）是一类转录本长度大于200 nt且不编码蛋白质的RNAs（不含rRNA），普遍存在于各种生物体内。哺乳动物基因组序列中4%~9%的序列产生的转录本是LncRNA（相应的蛋白编码RNA比例是1%）。近年来研究表明，LncRNA参与了多种重要的调控过程，如X染色体沉默、基因组印记及染色质修饰等。通过LncRNA测序，可以快速获得与其生物学过程或者疾病相关的LncRNA的表达变化，从而促进LncRNA的深入研究。

small RNA测序，项目简介：Small RNA是一类重要的体内调节分子，长度在18-30 nt之间，主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是诱导基因沉默，参与基因转录后调控，从而调节细胞生长、分化，以及个体发育、生殖等重要生物学过程。高通量测序技术可以对样本中所有small RNA家族进行测序和表达定量，从而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非编码RNA以及相应靶序列。测序使用Illumina Xten平台，测序原始数据质控后，进行Clean reads 长度分布统计，small RNA注释，已知 miRNA 注释，已知piRNA注释，ncRNA分析，新 miRNA 预测（有参考基因组），差异基因可视化分析，miRNA 家族分析，差异表达 miRNA 聚类分析，miRNA靶基因预测，靶基因GO、KEGG富集分析。在运输前将所有样品管固定于50 ml带盖离心管中，再将50 ml管放在封口袋中。

IlluminaHiSeq2500/4000可以运行PE150/PE250模式，可以承担转录组测序、人基因组重测序、外显子捕获测序、宏基因组测序、微生物分类测序等服务；IlluminaMiSeq运行PE300模式，可以承担细菌基因组重测序/Denovo测序、微生物分类测序、扩增子测序、核酸适配体测序等服务；LifeIontorrentPGM运行314、316、318芯片，可以承接扩增子测序、靶区域测序、基因组重测序服务；PacBioSequel/RSII该测序平台读长超长，平均可达10kb以上，主要承接细菌基因组完成图测序、***基因组精细图测序、全长转录本测序等服务；RNA样品请用1.5 mL离心管装好并用封口膜封好，并安置于50 mL离心管内或其他类似容器里，并旋紧盖子。上海全质粒测序高通量测序NGS

请注意选择无RNA酶的容器盛放样本，尽量避免RNA降解。羟甲基化测序高通量测序产品

生工高通量测序样品要求，环境样品：如果是新鲜土壤/污泥样品，可以以冰袋运输，不超过3天;如果是冻存过的样品（-20°C或者-80°C冰箱保存），为避免反复冻融，建议用足量的干冰（根据经验，在秋冬季节，如果打包合适，3公斤块状干冰可以维持30-40小时）寄送;如果是水体样品，建议采用滤膜过滤后，将滤膜寄送来生工。生工不负责过滤。要求滤膜3张，冰袋运输，不超过3天。其余特殊环境样品，具体咨询生工高通量测序部。

DNA样品：请提供电泳胶图，浓度>20 ng/μl，总量一般1～2 μg。乙醇沉淀DNA或冻干DNA，可冰袋运输，不超过3天。 羟甲基化测序高通量测序产品

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