有参转录组高通量测序高通量

时间:2022年08月30日 来源:

扩增子测序,项目介绍:随着基因编辑技术(尤其是CRISPR-cas9技术)的发展,科研人员使用传统的Sanger测序技术无法快速有效鉴定基因编辑效率。但是,通过对靶基因区域附近设计引物,进行PCR扩增,并对PCR产物进行高通量测序,可以快速高效的获得目标区域的突变频率信息,尤其是对低频突变的检测效果远远优于一代测序,性价比极高。16S全长分类测序,项目介绍:16S全长测序分析主要是对 16S rRNA基因全长进行扩增,基于PacBio 测序平台测序. 相比较二代测序只选择 1-2 个高变区进行测序,三代可以获得全长的 16S 序列,更多变异区信息可以提高物种鉴定的分辨率,还可以提高对于群落组成的鉴定的精度。另外,针对fungus/真核生物,也可以采用类似的办法,扩增ITS/18S全长,进行物种分类测序,提高鉴定精度。小RNA测测序不可采用常规柱式总RNA提取试剂盒。有参转录组高通量测序高通量

RNA类高通量测序样品要求:对于需要进行 RNA 抽提的样品,请使用新鲜取样的实验材料,当场分成小块(动物样品厚度需小于0.5 cm,植物样品厚度需小于0.3 cm)后立即用液氮或干冰乙醇速冻,保存于-80°C 冰箱,埋于足量的干冰(根据经验,在秋冬季节,如果打包合适,5 公斤块状干冰可以维持 50 小时,而小块的干冰能更好的包裹样品,但需比块状干冰多加些)中用保温箱寄送。一般组织样品,送样量至少200 mg/样;如果样品属于孢子,送样量至少500 mg/样。ITS高通量测序服务准确、迅速,可以说是KBSeq的代名词了。

通过显微镜使用血球计数板质检能观察到悬液背景质量和细胞数目及活性的评估。让我们再来回顾一下台盼蓝染色原理:台盼蓝染色原理:台盼蓝不能透过活细胞正常完整的细胞膜,故活细胞不被染色。而死细胞的细胞膜透性增高,可使染料进入细胞内而使死细胞染成淡蓝色。怎样通过血球计数板进行质检操作呢?将血球计数板擦拭干净,取干净的盖玻片盖在计数板上;将细胞悬液混匀(或10µl台盼蓝+10µl细胞悬液),吸出10µl悬液至计数板上盖玻片的一侧使细胞核悬液铺满盖玻片和计数板之间;在显微镜下分别对V1/V2/V3/V4四个计数区域进行计数;按细胞计数公式进行计算,计算公式:细胞总数={(V1+V2+V3+V4)/4}*10000*悬液体积*稀释倍数,V1/V2/V3/V4为各个计数区的细胞数目,细胞活率=活细胞数目/总细胞数目*100%。

生工人、大、小鼠全基因组测序,项目介绍:人或者大、小鼠全部基因组重测序,研究其突变信息(包括SNP/InDel/CNV/SV),并注释突变位点信息。该技术可同时获取编码区及非编码区突变信息,被广泛应用于遗传病、tumour及其它其它疾病研究中。测序平台:HiSeq XTen平台进行PE150测序。生工微生物基因组测序,项目介绍:微生物基因组重测序(有参)目前越来越多的微生物基因组被解析出来了。从而使得科研工作者们可以对某些物种微生物进行进行物种进化、种群特征、选择压力等研究。利用高通量测序技术,对有参考基因组微生物进行多个体的基因组重测序,精细分析其与参考基因组的SNP、InDel、SV等变异信息。生工生物已开展10x单细胞转录组测序(scRNA-seq)服务,如果正好您有需要,那就快快来call我们吧!

长链非编码RNA(lncRNA)测序(只限有参考基因组物种),项目介绍:长链非编码RNAs(Long non-coding RNAs,LncRNAs)是一类转录本长度大于200 nt且不编码蛋白质的RNAs(不含rRNA),普遍存在于各种生物体内。哺乳动物基因组序列中4%~9%的序列产生的转录本是LncRNA(相应的蛋白编码RNA比例是1%)。近年来研究表明,LncRNA参与了多种重要的调控过程,如X染色体沉默、基因组印记及染色质修饰等。通过LncRNA测序,可以快速获得与其生物学过程或者疾病相关的LncRNA的表达变化,从而促进LncRNA的深入研究。在运输前将所有样品管固定于50 ml带盖离心管中,再将50 ml管放在封口袋中。上海市多重扩增高通量测序产品

目前,生工生物已开展10x单细胞转录组测序(scRNA-seq)服务,如果正好您有需要,那就快快来call我们吧!有参转录组高通量测序高通量

生工CHIP-Seq,项目介绍:CHIP-SEQ 技术,即染色质免疫共沉淀与高通量测序相结合的技术。它是研究体内蛋白质与DNA 相互作用的有力工具,还可以用来研究转录因子与基因表达的关系。通过高通量测序,可以一次性得到目的蛋白在整个基因组上的结合分布,得到目的蛋白精确的结合位点以及结合基序等信息。ChIP-Seq 的原理:首先通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA 的所属片段,并对其进行纯化与文库构建;然后对富集得到的DNA的片段进行高通量测序,将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA 区段信息。有参转录组高通量测序高通量

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