上海市靶向捕获高通量测序应用

生工高通量测序样品要求，RNA样品：请提供浓度≥750 ng/μl、总量≥2μg的总RNA样品，样品请去蛋白并进行DNase处理;请务必提供每个样品具体的浓度、体积、制备时间以及物种来源。比较好附上QC数据，可以是电泳胶图、分光光度值、Nanodrop仪器检测数据或者Agilent Bioanalyzer仪器检测数据等;一般情况下，转录组测序需要Agilent Bioanalyzer仪器检测获得的总RNA 28S:18S≥1，RIN≥7;小RNA测测序不可采用常规柱式总RNA提取试剂盒，可选择传统总RNA提取法（如乙醇沉淀、异丙醇沉淀等）或者选用专门的小RNA提取试剂盒;寄送RNA样品请置于1.5 ml离心管中，管上注明样品名称、浓度以及制备时间，管口使用Parafilm封口。在运输前将所有样品管固定于50 ml带盖离心管中，再将50 ml管放在封口袋中。使用足量的干冰运输，并且尽量选用较快的邮递方式，以降低运输过程中样品降解的可能性。于微生物样品，请客户如实声明所属物种，对于可能致病的微生物，生工保留拒收的权利。上海市靶向捕获高通量测序应用

长链非编码RNA(lncRNA)测序(只限有参考基因组物种)，项目介绍：长链非编码RNAs（Long non-coding RNAs，LncRNAs）是一类转录本长度大于200 nt且不编码蛋白质的RNAs（不含rRNA），普遍存在于各种生物体内。哺乳动物基因组序列中4%~9%的序列产生的转录本是LncRNA（相应的蛋白编码RNA比例是1%）。近年来研究表明，LncRNA参与了多种重要的调控过程，如X染色体沉默、基因组印记及染色质修饰等。通过LncRNA测序，可以快速获得与其生物学过程或者疾病相关的LncRNA的表达变化，从而促进LncRNA的深入研究。上海地区生工生物 高通量测序原理对于需要进行RNA抽提的部分特殊样品，可以将组织在液氮中研磨后用TRIzol悬浮后用普通冰袋寄送。

生工高通量测序部拥有丰富的样品处理经验，日均处理样品200余例，涵盖污泥、粪便、海底沉泥、水体滤膜、植物组织、动物组织/细胞等样品，省去您处理样品的繁琐过程。生物信息分析经验丰富，可以满足客户标准分析到定制分析作图的需求。且生工一直秉持只要生工已经标准化的分析内容（以生工分析报告模板为准），全部free。生工生物拥有生命科学领域较全的产品及服务体系，可以承接从分子到蛋白各个层级的实验项目，一站式解决问题。同时生工生物单细胞团队目前已同时拥有10xGenomicsChromiumController和ChromiumX双平台，可为您提供超高通量和低通量单细胞样本双重。

微生物基因组重测序（有参）：目前越来越多的微生物基因组被解析出来了。从而使得科研工作者们可以对某些物种微生物进行进行物种进化、种群特征、选择压力等研究。利用高通量测序技术，对有参考基因组微生物进行多个体的基因组重测序，精细分析其与参考基因组的SNP、InDel、SV等变异信息。微生物基因组从头测序（无参）：对于不断分离培养微生物的客户来说，要确定一个菌株是否是新菌株或者新菌种，较快捷的办法就是，直接进行基因组测序。利用高通量测序技术，对这些基因组进行高深度测序，然后进行基因组组装，获得基因组的框架图或者精细图甚至是完成图。从而可以快速解析其基因组结构、基因功能、进化关系。DNA样品请用1.5 mL离心管装好并用封口膜封好，并安置于50 mL离心管内或其他类似容器里，并旋紧盖子。

small RNA测序，项目简介：Small RNA是一类重要的体内调节分子，长度在18-30 nt之间，主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是诱导基因沉默，参与基因转录后调控，从而调节细胞生长、分化，以及个体发育、生殖等重要生物学过程。高通量测序技术可以对样本中所有small RNA家族进行测序和表达定量，从而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非编码RNA以及相应靶序列。测序使用Illumina Xten平台，测序原始数据质控后，进行Clean reads 长度分布统计，small RNA注释，已知 miRNA 注释，已知piRNA注释，ncRNA分析，新 miRNA 预测（有参考基因组），差异基因可视化分析，miRNA 家族分析，差异表达 miRNA 聚类分析，miRNA靶基因预测，靶基因GO、KEGG富集分析。单细胞测序技术可以检测复杂组织中单个细胞不同的生物学特性.上海地区高通量测序平台

请寄送样本（尤其是细胞样本）之前鉴定样本所属物种。上海市靶向捕获高通量测序应用

RNA样品：1.请务必提供每个样品具体的浓度、体积、制备时间以及物种来源。比较好附上电泳胶图或者 Agilent Bioanalyzer 仪器检测数据等；2.对于普通转录组样品，请提供浓度≥100 ng/µl、总量≥2 µg 的总 RNA 样品，样品请去蛋白并进行 DNase处理；一般情况下，普通转录组测序需要 RNA 样品的 OD260/OD280为 2.0~2.2，Agilent Bioanalyzer 2100 器检测获得的总RNA 28S:18S≥1，RIN≥8；对于全长转录组测序样品（ISO-seq）,请提供浓度大于200 ng/ul，总量大于5 μg的总RNA样品。样品请去蛋白并进行 DNase 处理；全长转录组测序需要 RNA 样品的 OD260/OD280 为 2.0~2.2，2.3Agilent Bioanalyzer 2100 器检测获得的总RNA 28S:18S≥1，RIN≥8.5；上海市靶向捕获高通量测序应用

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