上海市靶向捕获高通量测序技术

时间:2022年09月02日 来源:

扩增子测序,项目介绍:随着基因编辑技术(尤其是CRISPR-cas9技术)的发展,科研人员使用传统的Sanger测序技术无法快速有效鉴定基因编辑效率。但是,通过对靶基因区域附近设计引物,进行PCR扩增,并对PCR产物进行高通量测序,可以快速高效的获得目标区域的突变频率信息,尤其是对低频突变的检测效果远远优于一代测序,性价比极高。16S全长分类测序,项目介绍:16S全长测序分析主要是对 16S rRNA基因全长进行扩增,基于PacBio 测序平台测序. 相比较二代测序只选择 1-2 个高变区进行测序,三代可以获得全长的 16S 序列,更多变异区信息可以提高物种鉴定的分辨率,还可以提高对于群落组成的鉴定的精度。另外,针对fungus/真核生物,也可以采用类似的办法,扩增ITS/18S全长,进行物种分类测序,提高鉴定精度。寄送RNA样品请置于1.5 ml离心管中,管上注明样品名称、浓度以及制备时间,管口使用Parafilm封口。上海市靶向捕获高通量测序技术

生工靶向捕获测序,项目介绍:利用序列捕获技术将基因组特定区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。全外显子测序即通过对某一基因组中的所有外显子进行测序从而获得所有外显子区域内的突变信息。由于该技术在临床上的潜力,被《科学》杂志评为2010年科学进展之一。外显子组测序可用于寻找单基因疾病、复杂疾病(如糖尿病、肥胖症等代谢综合症)、甚至是cancer的致病基因或易感基因。生工生物采用Aglient SureSelect系列外显子捕获系统,可以高效富集人全外显子区域,并结合Illumina XTen测序平台进行深度测序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等变异检测,形成完整的分析报告。上海地区转录组高通量测序产品生物信息分析经验丰富,可以满足客户标准分析到定制分析作图的需求。

悬液制备好后质检结果的判断也是大家需要掌握的必备技能。单细胞悬液质检关卡究竟是怎样运作的呢?单细胞悬液质控要求:•细胞浓度:700-1200cells/µl;•细胞活率>80%(当细胞悬液活率低于70%时建议进行去除死细胞处理);细胞团及碎片杂质<5%(无细胞粘连,无明显的细胞碎片和细胞团,并保证细胞的完整性);•细胞状态:细胞直径在7-40um之间(细胞直径过大则建议进行抽核处理);•不存在逆转录抑制剂和非细胞的核酸分子。

生工优势:1.生工高通量测序部拥有丰富的样品处理经验,日均处理样品200余例,涵盖污泥、粪便、海底沉泥、水体滤膜、植物组织、动物组织/细胞等样品,省去您处理样品的繁琐过程。2.生物信息分析经验丰富,可以满足客户标准分析到定制分析作图的需求。且生工一直秉持只要生工已经标准化的分析内容(以生工分析报告模板为准),全部无费用。3.生工生物拥有生命科学领域较全的产品及服务体系,可以承接从分子到蛋白各个层级的实验项目。一站式解决问题。什么是KBSeq全质粒测序?

如果你的样品是质粒或者是菌液,那为什么不试试我们的KBSeq呢?准确、迅速,可以说是KBSeq的代名词了,关键是还可以省钱,估计这是很多小伙伴们一定会说,你这个服务单价可比Sanger贵多了,怎么可能会省钱呢?Sanger测序的价格:常规的一代测序基本上要每800 bp就测一个反应,那我们来算一下14000/800=17.5,那基本上就要测18个反应了,按照现在生工官方的价格区间,这个属于反应数在10-49个反应之间的,那每个反应的价格为26元,这样算下来18*26=468元,还要加上引物合成的费用,实验周期的话大概率是要超过15天的。KBSeq全质粒测序的价格:序列长度属于6-15 kb之间,159元,实验的周期大概在5-7天左右。X仪器本身有16个通道(Controller为8通道),每个通道极限多捕获20000个细胞(Controller为10000个细胞) 。上海市SNP高通量测序公司

生工生物接受客户自备文库测序项目。上海市靶向捕获高通量测序技术

16s/18s/ITS微生物分类测序,项目介绍:环境微生物是自然界中分布建议广、种类建议多、数量比较大的生物类群,其群落结构及多样性和微生物的功能及代谢机理是微生物生态学的研究热点,对于我们研究微生物与环境的关系、环境治理和微生物资源的利用以及人类医疗健康有着重要的理论和现实意义。随着高通量测序技术的发展以及大量序列数据的积累,通用引物扩增结合高通量测序技术,可以快速检索环境内微生物的群落结构。这项运用我们称之为微生物分类测序。如Illumina公司的MiSeq高通量测序平台不仅可实现对多样品的多个可变区同时测序,而且在测序速度和测序通量上都有进一步提升,目前此平台已在微生物多样性群落结构研究方面受到了广大学者的认可。上海市靶向捕获高通量测序技术

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