上海地区靶向捕获高通量测序服务

时间:2022年10月17日 来源:

RNA类高通量测序样品要求:对于需要进行 RNA 抽提的样品,请使用新鲜取样的实验材料,当场分成小块(动物样品厚度需小于0.5 cm,植物样品厚度需小于0.3 cm)后立即用液氮或干冰乙醇速冻,保存于-80°C 冰箱,埋于足量的干冰(根据经验,在秋冬季节,如果打包合适,5 公斤块状干冰可以维持 50 小时,而小块的干冰能更好的包裹样品,但需比块状干冰多加些)中用保温箱寄送。一般组织样品,送样量至少200 mg/样;如果样品属于孢子,送样量至少500 mg/样。生工生物接受客户自备文库测序项目。上海地区靶向捕获高通量测序服务

KBSeq全质粒测序跟一代测序相比有什么优点呢?一代测序:1.数据质量,套峰,双峰等情况,需要人工分析校对。2.测序长度,1 kb。3.成本,低。4.样本用量,100 ng。5.精确度,70-90%。6.测序能力,需要测序引物,只能测测序引物间的片段序列。7.通量低,(与读长有关)。8.实验周期,如果片段长度超过5K,测通可能需要15天左右。对于测序长度较长,如果我们用Sanger测序往往需要花费大量的时间,而我们KBSeq全质粒测序则只需要5-7天,就可以测通片段长度小于30kb以下的片段。KBSeq全质粒测序对于样本的量,要求的也比较少,比如质粒我们的样本要求DNA的浓度需≥ 1 ng/μl, 体积需≥5 μl,如果比较珍贵的样本或者是样本比较难提取的,KBSeq就更为适合了。上海地区微生物高通量测序技术RNA样品建议用足量干冰运输。

长链非编码RNA(lncRNA)测序(只限有参考基因组物种),项目介绍:长链非编码RNAs(Long non-coding RNAs,LncRNAs)是一类转录本长度大于200 nt且不编码蛋白质的RNAs(不含rRNA),普遍存在于各种生物体内。哺乳动物基因组序列中4%~9%的序列产生的转录本是LncRNA(相应的蛋白编码RNA比例是1%)。近年来研究表明,LncRNA参与了多种重要的调控过程,如X染色体沉默、基因组印记及染色质修饰等。通过LncRNA测序,可以快速获得与其生物学过程或者疾病相关的LncRNA的表达变化,从而促进LncRNA的深入研究。

生工CHIP-Seq,项目介绍:CHIP-SEQ 技术,即染色质免疫共沉淀与高通量测序相结合的技术。它是研究体内蛋白质与DNA 相互作用的有力工具,还可以用来研究转录因子与基因表达的关系。通过高通量测序,可以一次性得到目的蛋白在整个基因组上的结合分布,得到目的蛋白精确的结合位点以及结合基序等信息。ChIP-Seq 的原理:首先通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA 的所属片段,并对其进行纯化与文库构建;然后对富集得到的DNA的片段进行高通量测序,将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA 区段信息。10xGenomics Chromium X多通道+高捕获+10x的CellPlex多样本混样技术。

转录组测序,项目介绍:RNA-Seq,是基于新一代测序技术的转录组学研究方法:首先提取生物样品的全部转录的 RNA 并进行 mRNA 富集,然后反转录为 cDNA 后进行新一代高通量测序,在此基础上进行短片段拼接组装,从而获得一个个单独转录本,进而可以对该生物样品当前状态的基因表达状况有全局了解。对不同阶段或部位生物样品的转录组进行 比较分析,则可以在转录层面得到基因表达水平的变化,针对关键基因则可以进行代谢通路(Pathway)的构建。ChIP项目至少要求50ng DNA,以Qubit 2.0检测为准。其余具体咨询生工高通量测序部。上海地区基因组高通量测序原理

DNA样品请提供电泳胶图,浓度>20 ng/μl,总量一般1~2 μg。乙醇沉淀DNA或冻干DNA,可冰袋运输,不超过3天。上海地区靶向捕获高通量测序服务

如果你的样品是质粒或者是菌液,那为什么不试试我们的KBSeq呢?准确、迅速,可以说是KBSeq的代名词了,关键是还可以省钱,估计这是很多小伙伴们一定会说,你这个服务单价可比Sanger贵多了,怎么可能会省钱呢?Sanger测序的价格:常规的一代测序基本上要每800 bp就测一个反应,那我们来算一下14000/800=17.5,那基本上就要测18个反应了,按照现在生工官方的价格区间,这个属于反应数在10-49个反应之间的,那每个反应的价格为26元,这样算下来18*26=468元,还要加上引物合成的费用,实验周期的话大概率是要超过15天的。KBSeq全质粒测序的价格:序列长度属于6-15 kb之间,159元,实验的周期大概在5-7天左右。上海地区靶向捕获高通量测序服务

生工生物工程(上海)股份有限公司在同行业领域中,一直处在一个不断锐意进取,不断制造创新的市场高度,多年以来致力于发展富有创新价值理念的产品标准,在上海市等地区的医药健康中始终保持良好的商业口碑,成绩让我们喜悦,但不会让我们止步,残酷的市场磨炼了我们坚强不屈的意志,和谐温馨的工作环境,富有营养的公司土壤滋养着我们不断开拓创新,勇于进取的无限潜力,生工生物工程供应携手大家一起走向共同辉煌的未来,回首过去,我们不会因为取得了一点点成绩而沾沾自喜,相反的是面对竞争越来越激烈的市场氛围,我们更要明确自己的不足,做好迎接新挑战的准备,要不畏困难,激流勇进,以一个更崭新的精神面貌迎接大家,共同走向辉煌回来!

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