上海微生物高通量测序测序

为什么要用单细胞测序技术？细胞是生物体结构和功能的基本单位，在生物体生长发育的过程中，因细胞类型、外界环境以及内部调节因素的不同，其转录组信息也不尽相同。由于基因组和表观遗传的重编程，以及在细胞分裂和分化过程中出现的误差造成来自同一细胞系或个体的细胞呈现出不同的基因组、转录组和表观基因组[4]。这就是我们上面提到的细胞异质性。细胞异质性是生物组织和生物系统的普遍特征[5]。但是我们常规的二代测序检测的是一个细胞群体的基因组、转录组的信息，如培养的大量细胞、动植物组织甚至是整个生物体。在过去的20多年中，人们对转录组的人数仍然局限在群体水平[6]。这种方法可以为我们提供大量的基因组或转录组数据，却无法揭示细胞的异质性。传统方法得到的是细胞群的平均基因组，而单细胞测序测量的是细胞群中单个细胞的基因组[7]。现在也有学者为了区分传统测序和单细胞测序的区别，将传统方法称为批量测序。DNA样品建议用蓝冰运输。上海微生物高通量测序测序

生工高通量测序样品要求，组织/细胞样品：请使用新鲜取样的实验材料，当场分成小块后立即用液氮或干冰乙醇速冻，保存于-80°C冰箱，用足量的干冰（根据经验，在秋冬季节，如果打包合适，3公斤块状干冰可以维持30-40小时）寄送;于微生物样品，请客户如实声明所属物种，对于可能致病的微生物，生工保留拒收的权利;对于需要进行RNA抽提的样品，可以但不建议将组织在液氮中研磨后用TRIzol悬浮后用普通冰袋寄送，具体情况请先取得沟通。上海市单细胞测序高通量测序NGSX仪器本身有16个通道（Controller为8通道），每个通道极限多捕获20000个细胞（Controller为10000个细胞） 。

生工人、大、小鼠全基因组测序，项目介绍：人或者大、小鼠全部基因组重测序，研究其突变信息（包括SNP/InDel/CNV/SV），并注释突变位点信息。该技术可同时获取编码区及非编码区突变信息，被广泛应用于遗传病、tumour及其它其它疾病研究中。测序平台：HiSeq XTen平台进行PE150测序。生工微生物基因组测序，项目介绍：微生物基因组重测序（有参）目前越来越多的微生物基因组被解析出来了。从而使得科研工作者们可以对某些物种微生物进行进行物种进化、种群特征、选择压力等研究。利用高通量测序技术，对有参考基因组微生物进行多个体的基因组重测序，精细分析其与参考基因组的SNP、InDel、SV等变异信息。

细胞质检时染料染色的原理：台盼蓝染色原理：台盼蓝不能透过活细胞正常完整的细胞膜，故活细胞不被染色。而死细胞的细胞膜透性增高，可使染料进入细胞内而使死细胞染成淡蓝色。AO/PI染色原理：吖啶橙（AO）是一种小分子染料，可以通过完整的细胞膜，嵌入所有细胞（活细胞和死细胞）的细胞核，呈现绿色荧光；碘化丙啶（PI）只能通过不完整的细胞膜，即死细胞的细胞膜，嵌入所有死细胞的细胞核，呈现红色荧光，通过标记出的绿色荧光和红色荧光就可以辨别出活细胞和死细胞，这种特异性染色的方法也可以排除无核细胞、杂质、碎片等的干扰。PacBio Sequel/RSII 该测序平台读长超长，平均可达10 kb以上。

长链非编码RNA(lncRNA)测序(只限有参考基因组物种)，项目介绍：长链非编码RNAs（Long non-coding RNAs，LncRNAs）是一类转录本长度大于200 nt且不编码蛋白质的RNAs（不含rRNA），普遍存在于各种生物体内。哺乳动物基因组序列中4%~9%的序列产生的转录本是LncRNA（相应的蛋白编码RNA比例是1%）。近年来研究表明，LncRNA参与了多种重要的调控过程，如X染色体沉默、基因组印记及染色质修饰等。通过LncRNA测序，可以快速获得与其生物学过程或者疾病相关的LncRNA的表达变化，从而促进LncRNA的深入研究。如果问现在什么技术是测序届的宠儿，那么单细胞测序则是我们不得不提及的技术了。上海市单细胞测序高通量测序NGS

截止目前为止，生工生物可是为数不多的同时拥有ChromiumController和ChromiumX平台的公司。上海微生物高通量测序测序

生工其他PCR产物测序，项目介绍：随着基因编辑技术（尤其是CRISPR-cas9技术）的发展，科研人员使用传统的Sanger测序无法快速有效鉴定基因编辑效率。但是，通过对靶基因区域附近设计引物，进行PCR扩增，并对PCR产物进行高通量测序，可以快速高效的获得目标区域的突变频率信息，尤其是对低频突变的检测效果远远优于一代测序，性价比极高。总DNA 或者包装完好的原始样品（如土壤、粪便、 水体和口腔物）；样品名称清晰，冷藏运输。如有对照与实验样品的区分，标明正常样品与实验样品，如有分组，详细描述分组分析信息，以及分组比较的分析需求信息。上海微生物高通量测序测序

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