天津10X Chromium X单细胞测序服务机构

时间:2022年07月07日 来源:

样本制备后的保存 为了尽可能地减少转录组的变化,在对细胞进行清洗和计数后,单细胞悬液应当保存于冰上,直至用于后续的上机和文库制备步骤。在理想状况下,一旦制备好样本,应当在3min钟内将其用于下游步骤。然而,您还有必要了解各类细胞的不同性质,因为这可能会影响细胞应在冰上保存的时间,以及它们在制备后多久便应当被尽快使用。例如,有些细胞(如PBMC)如果在冰上放置一段时间,它们就开始形成团块。这些团块很难解离,增加了堵塞的风险,而且每个团块被当成单细胞计数,又降低了细胞计数的准确性。此外,有些细胞更加粘稠,形成团块的速度更快。对于这些细胞,必须尽量减少制备和使用之间的时间差。测序的革新让科学研究从个体基因差异逐渐转为个体细胞的基因差异。天津10X Chromium X单细胞测序服务机构

关于单细胞测序实验样本制备,这与流式细胞术用户熟悉的步骤完全一致,也就是通过酶促或机械消化、细胞分选或其他细胞分离技术从整个样本中制备生成活的单细胞悬液。随后是细胞计数和质量控制步骤,以确保您的样本有适当浓度的活细胞,并且不含细胞团块和死细胞碎片。如有必要,您还可以使用抗体对样本进行染色,标记细胞表面蛋白或其他生物分析物,或者通过FACS来富集感兴趣的细胞类型。解离样本时采取的具体步骤将根据您的起始材料和实验目标而定。也许需要额外的制备步骤,具体取决于组织质量、样本丰度、细胞大小,以及是否需要提取出细胞核进行染色质可接近性分析。无论具体的考虑因素如何,所有样本类型都遵循同一个基本原则,那就是生成高质量的单细胞悬液。长沙二代测序单细胞测序服务公司烈冰专精单细胞多组学测序领域。

从单细胞测序描述性分析转向复杂样本中不同细胞类型的功能解析,越来越需要一种多组学的细胞生物学视角。通过单细胞多组学——即对不同组学的数据集进行分析和整合——科学家能够从同一个单细胞来源中检测多种细胞特征。这些特征包括全转录组基因表达、细胞表面蛋白表达、免疫组库序列(包括T细胞和B细胞受体)以及用于了解表观基因组调控的开放染色质区域。随着单个实验可提供更多信息丰富的数据,研究人员的获益更多,包括保留珍贵样本、提高生产力、减少因批次效应引起的错误,并节省更多的高科技资源(从资助基金到人员时间)。

科研的魅力之处,在于无穷尽的探寻生命的本底,通过单细胞测序,我们对组织的分子基础的研究也从初级到深层,并在单细胞层面逐渐达成一致,那么不禁要问一句,组织的空间位置到底重不重要?空间异质性是功能的关键特征,细胞的位置信息更能反应细胞命运调控机制和细胞谱系发生过程。因此时间和空间即像组织的AB面,而不可否认的是,此时空间坐标的记录,像一个还未长大的娃娃,虽未触及分子基础研究的深层,但仍在努力攀登探寻生命本底的下一个高峰。单细胞测序技术遍地开花,烈冰服务让您的医学研究如虎添翼。

单细胞测序是指针对单个细胞进行全转录组测序分析,可精确地描述每一个细胞的状态,在异质性发育过程中具有特殊的应用价值。然而,单细胞测序无法给出固态异质化组织中细胞空间排布信息,对于揭示发育过程、病理微环境都存在很大的局限性。空间转录组测序以点阵形式记录病理切片细胞的空间信息并进行测序,可以精确指示点阵内的全部基因表达情况。空间转录组测序的加入,无疑让单细胞测序如虎添翼,更精确地勾勒了组织水平的异质性。烈冰测序数据分析平台,不依赖已有物种信息,可研究非模式物种,针对不同平台的数据,制定多套流程;广东10X Chromium X单细胞测序

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机体为响应各种应激,其细胞会从一种功能“状态”转变为另一种功能“状态”;当细胞在不同状态之间转变时,往往会经历转录重组,导致一些基因被沉默,一些基因被重新“唤醒”,但纯化这些瞬态细胞进行研究是很困难或不可能的;scRNA-seq拟时序分析可以让我们在不需要纯化的情况下查看这些细胞状态。拟时序分析,即根据不同细胞亚群基因表达量随时间的变化情况,构建细胞谱系发育,但这里的时间并不是真时间,而是一个虚拟的时间,是指的细胞与细胞之间的转化和演替的顺序和轨迹。即使在同一个样本中,也会存在多种不同的细胞形态。因此,不论测定了多少样本,我们都可以采用拟时序分析对样本中的细胞转化和变化进行描述。天津10X Chromium X单细胞测序服务机构

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