烈冰单细胞多组学测序

烈冰生物单细胞测序服务，为您提供可视化质控系统，保证每次实验的可靠性：BDRhapsody扫描仪具有直接成像功能，可在工作流程的不同阶段进行质量控制，如细胞捕获率和细胞多态率（双细胞率）。成像仪指标可以确认起始细胞样本的质量，并确认微孔板工作流程中每个步骤的成功完成状态；在细胞裂解前的步骤中评估细胞活性；并对通过测序确定的细胞回收量进行可靠估算。利用这些信息，在进行高成本的下游测序之前，用户可根据需要改变方向并解决实验中遇到的问题。这些指标允许用户对不同工作日间的或者不同研究中心间的工作流程性能进行跟踪。丰富的测序和数据分析经验，烈冰配套全程个性化、定制化地数据分析服务。烈冰单细胞多组学测序

对于稀有样本，或细胞量比较少的稀有组织，样本中每一粒细胞都很珍贵，BDRhapsody单细胞捕获平台对该种类型的样本能实现友好包容，如果在实际实验中，我们发现因为样本类型和制备单细胞悬液方法的不同，容易出现单细胞悬液中死亡细胞的比例较高的情况。也会和您探讨是否考虑去除单细胞悬液中的死细胞和其他污染物的操作，以获得高质量数据是至关重要的。这是因为，死亡的细胞易裂解导致其中的RNA释放出来。这种cell-freeRNA会导致检测的背景噪声，并会影响单细胞数据的质量。因此当样本活性较差时，对细胞悬液中细胞活性检测后，需要进行一般死细胞去除的工作（一般悬液活性小于70%时考虑此操作），以保证较高的上机捕获细胞的质量。苏州BD VDJ单细胞测序服务BD Scanner，是您实验过程的又一双眼睛，实时监测，精细质控。

机体为响应各种应激，其细胞会从一种功能“状态”转变为另一种功能“状态”；当细胞在不同状态之间转变时，往往会经历转录重组，导致一些基因被沉默，一些基因被重新“唤醒”，但纯化这些瞬态细胞进行研究是很困难或不可能的；scRNA-seq拟时序分析可以让我们在不需要纯化的情况下查看这些细胞状态。拟时序分析，即根据不同细胞亚群基因表达量随时间的变化情况，构建细胞谱系发育，但这里的时间并不是真时间，而是一个虚拟的时间，是指的细胞与细胞之间的转化和演替的顺序和轨迹。即使在同一个样本中，也会存在多种不同的细胞形态。因此，不论测定了多少样本，我们都可以采用拟时序分析对样本中的细胞转化和变化进行描述。

您的珍贵样本，还可以放心依赖烈冰生物BDRhapsody单细胞捕获系统，BDRhapsodyTM单细胞捕获系统采用微孔技术，对细胞的捕获没有偏好性，实现高达80%的微孔板捕获率，由于单个微孔板中容纳了22万+个微孔，而现阶段单细胞测序实验技术通常要求单个样本捕获3000-5000，至高达10000个细胞，即可满足科研探索需求，因此这种“泊松分布”的原理类似于上样细胞的无限稀释过程，但22万+微孔的存在，也对大体量细胞数目的科学研究有很好的包容性，细胞通量分为可扩展至100-40000个细胞的捕获（单个微孔板），满足您的多重需求。测序的革新让科学研究从个体基因差异逐渐转为个体细胞的基因差异。

针对单细胞测序数据分析时的reads数、基因表达量及细胞数量判定过程中：以捕获5000个细胞、100G的测序量为标准，每个细胞的reads数大约在50k左右；每个细胞的基因中位数取决于样本的细胞类型，例如成熟的B，T，粒细胞数量较多的组织中，由于该类型细胞表达的基因数普遍较少，导致基因中位数下降。而某些疾病组织、或者体外培养的如干细胞等，他们的基因表达数较高，甚至可以超过1W，这就导致该类样本基因中位数非常高。因此，我们对细胞数量以及基因中位数确认时，需要考察实际组织的细胞组成。BD单细胞测序平台同时兼容单细胞蛋白组测序（Ab-seq）和免疫组库测序等工作。南通BD VDJ单细胞实验平台

烈冰单细胞多组学测序助您探究细胞类型特异性和基因调控网络特征。烈冰单细胞多组学测序

由于高通量测序实验方法相关的测序成本，使得单细胞实验往往非常昂贵，烈冰生物BDRhapsody单细胞测序服务珍视您的每一份样本，在平台搭建前，我们测试评估了BDRhapsody的性能，与BD官方公布的数据结合来看，将人293T和小鼠NIH/3T3细胞的1:1混合物以不同浓度上样到BDRhapsody卡式芯片上。存储的cDNA分子普遍扩增并进行低通量测序（每个细胞月8700个读数）。在测序数据中检测到1109个细胞的上样条件下，每个细胞中，来自每个细胞的平均99.4%的分子经检测为人或小鼠，这表明微孔之间的串扰非常小，在测序数据中检测到1000个或更少细胞的上样密度下，多重态发生率接近零，并且在15000个细胞下小于5%。烈冰单细胞多组学测序

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