深圳单细胞平台

作为单细胞测序的又一个重要里程碑，BDRhapsody单细胞捕获平台整合了仪器、试剂盒和基础信息学软件，能精确对接illumina测序仪，因此可实现大量大细胞的快速高效标记、测序和分析，获得单细胞水平的基因表达谱和差异情况，并通过对复杂细胞群体进行深入细致分析，绘制大规模单细胞表达图谱。以量化细胞内的群体异质性，并逐个鉴定细胞类型、细胞状态和动态细胞跃迁。除了有望鉴定新的细胞亚型和稀有细胞群体，单细胞技术还能更好地了解转录动态和基因调控关系。烈冰一站式单细胞测序服务：立足科学研究，解码生命本质。深圳单细胞平台

针对单细胞测序的细胞上样数，为什么不建议捕获到的细胞数量越高越好？一味地追求高数量的细胞捕获可能会存在一些问题。例如在上机细胞悬液浓度固定时，如果目标细胞捕获数增加到8000甚至10000，上样细胞悬液体积势必增加，在细胞悬液质量不是很理想（细胞活性5%、结团率均>5%）的情况下，引入的背景信号会增加，分析结果不理想的直接体现包括：cell、non-cell无法有效区分和Fractionreadsincells偏低。当cell和non-cell无法有效区分时，会使得数据出现假阳性和假阴性结果！当目标细胞捕获数很大时，多细胞率会增加，数据分析时，此部分“cell”表现为基因检测数和UMI检测数是正常cell的N倍（N是一个GEM包裹的细胞数），导致所有细胞的统计数据（单个细胞基因检测中位数、单个细胞UMI检测中位数）虚高。此部分“cell”虽然可以通过设置数据分析阈值进行过滤，但是容易会有此类数据的残留和正常高基因检测细胞的人为去除！青岛BD Rhapsody单细胞测序搭配BD FACSMelody流式分选仪，全线搭建BD Rahpsody单细胞测序平台。

什么时候要用到去死细胞的操作呢？跟进烈冰生物多年单细胞测序服务经验来看，当细胞悬液进行质量和活性检测后，考虑对细胞活性在50%-70%的悬液进行去除死细胞的操作。而太低活性的悬液（小于30%），悬液中细胞大量死亡，可能已经丢失了原组织内的细胞比例和状态，失真严重，建议重新收集样本进行新的实验，保证数据的高质量和实验结果的准确性。但需要注意到，去除死细胞的操作会损失一定的细胞数量，因此希望您在提供样本时，尽可能提供足量的细胞，以备实验过程中可能存在的细胞死亡的问题，BDRhapsody单细胞捕获平台对样本起始细胞量的要求较低，一般提供10万个细胞以上均可满足需求，特殊样本可详细咨询烈冰生物。

烈冰生物搭建近10台BDRhapsody平台，目前为全国范围内的高校、医院和研究所等单位的科研学者提供服务，BDRhapsody平台采用U型微孔板，1个板即对应1个样本（不混样的情况下），每个通道一般捕获细胞数在1000-10000个之间，而上限可捕获40000细胞时也能获得较低的双细胞率，此外，单个细胞捕获效率高达80%，可准确鉴别稀有细胞类型，有利于稀有样本或小细胞量类型样本研究；细胞可适性高，对细胞大小（直径超过40um细胞需要制备成细胞核）及类型无限制。细胞捕获周期较短，能够实现自动分离，且实验端捕获细胞过程全程可视化进行，保障每一例珍贵样本实验的成功进行，1天内可完成从细胞悬液到cDNA文库构建的所有的测序准备工作。个性化制定测序项目方面，满足从检测基因到蛋白的多组学测序要求。

烈冰生物单细胞测序服务体系，不仅提供10XGenomics和BDRhapsody两大国际认可的单细胞实验平台，在“附加”产品上，我们提供BDFACSMelody流式细胞仪，满足您对特殊细胞类型的富集需求，自主研发的Panocell单细胞捕获芯片，可兼容BD平台全套原装磁珠、试剂和protocol,为您提供完整的单细胞多组学解决方案。从细胞多样本分析和染色所需的试剂到检测试剂盒，生物信息分析工具，和在线大数据分析系统、精简方案和专业团队技术支持，烈冰生物可为您提供用于单细胞多组学甚至到空间转录组测序的各种工具，助您加速科研探索之旅。烈冰生物全国五大实验中心，多地部署BD Rahpsody平台，助您的样本更快速抵达“战场”。湖北BD单细胞多组学测序

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烈冰生物BDRhapsody平台，采用精简的工作流程助力您的实验成功：1.制备单细胞悬液：可使用碧迪医疗单细胞多样本分析试剂盒和/或BDAb-seq寡核苷酸偶联抗体(Ab-Oligos)将细胞染色2.微孔板预充和处理:使用自动移液器进行液体交换3.单细胞捕获工作流程:(1)细胞上样:上样575微升细胞悬液；系统未采用微流体通道设计，无需担心通道堵寨；通过重力轻轻沉淀细胞，可捕获脆弱细胞，BDRhapsody微孔板包含大于220,000个分区，可在低双细胞率下捕获多达40000个细胞(2)细胞上样扫描：估算捕获的活细胞数量和细胞多态率(3)磁珠上样：微孔的正六边形几何形状和尺寸可防止磁珠多重分配在微孔中(4)磁珠上样和磁珠洗涤扫描：估算包含活细胞和磁珠的微孔数量；测定细胞存留率，评估是否发生细胞损失(5)细胞裂解：使用裂解缓冲液，确保细胞完全裂解(6)磁珠回收：轻松、高效地磁性回收磁珠并采用Scanner扫描磁珠回收情况深圳单细胞平台

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