西藏超微量RNA甲基化

时间:2023年02月16日 来源:

样本要求 1)样品类型:细胞、新鲜组织或RNA 样品。 2)样品量: 细胞:2×107 组织:500 mg-1 g RNA:30 - 300 μg,浓度不低于100 ng/μL 3)RNA 质量要求: OD260/280:1.8~2.1 浓度≥ 100 ng/μl RNA 无明显降解(28S:18S ≥ 1.5 或者RIN ≥ 7) 4)样品保存: 新鲜组织可用RNA保护剂处理或液氮冻存后,-80℃保存。 细胞样品,离心收集细胞沉淀后用PBS洗2遍,直接-80℃保存;RNA 样品可溶于乙醇或RNA-free 的超纯水中,-80℃保存。样品保存 Note:样品保存期间避免反复冻融。 5)样品运输:样品置于1.5 ml Eppendorf管或冻存管中,封口膜封好,装在塑料袋中,干冰运输。采用类似ELISA抑 制竞争免疫的方法,实验样本和RNA甲基化标准品与RNA甲基化抗体共孵育。西藏超微量RNA甲基化

西藏超微量RNA甲基化,甲基化

m7GRNA甲基化是在甲基化转移酶的作用下,使RNA鸟嘌呤(G)的第七位N上加上甲基的一种修饰(N7-methylguanosine,m7G)。研究表明,m7GRNA甲基化修饰存在于各类分子中,包括:mRNA5’帽子结构、mRNA内部、pri-miRNA、转运RNA(tRNA)和核糖体RNA(rRNA)。m7GRNA甲基化修饰能够调节mRNA的转录、miRNA的生物合成和生物学功能、tRNA稳定性、18SrRNA的核内加工及成熟。m7GRNA甲基化修饰作为一类新型RNA甲基化,近两年高影响因子文章不断,是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点。外泌体甲基化差异分析m6A是真核生物mRNA上常见的一种转录后修饰。

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RNAm6A甲基化是RNA较关键的内部修饰之一,是真核生物丰富和调节遗传信息的一种保守的转录后机制。m6A修饰具有多种生物学功能,如调控mRNA翻译、转录以及稳定性等。目前,已在多种植物中发现这种RNA修饰,参与调控不同植物的各方面生物学功能。其中,拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与m6A甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化普遍存在于拟南芥各个发育期,并揭示了RNA甲基化相关酶在特殊发育时期,如开花,叶片形成,种子发育,根部生长等过程中发挥重要作用。

案例1:哺乳动物mRNA内m7G甲基化转录组图谱 期刊:Molecular Cell 影响因子:14.25 由于全部种类的反转录酶均无法将RNA m7G位点逆转录成对应发生碱基突变的cDNA,为了准确的探究RNA内m7G甲基化情况,何川团队利用m7G自带正电荷的特征,开发了新的m7G单碱基深度测序方法。该方法能够将RNA内含m7G位点转化为另一种可产生反转录碱基变异的新位点,并依据碱基变异率估计m7G位点的甲基化水平。此方法随后也被证实可检测18S rRNA中的1639位内含m7G位点以及可揭示人类细胞tRNA中的22个46位内含m7G位点。并观测到其在mRNA分布、富集的共有序列及其它统计特征与m7G-MeRIP-seq数据基本保持一致。该文章不仅揭示了m7G甲基化在人类细胞中的分布特征,同时还发现METTL1是一种甲基转移酶,它在mRNA中催化了m7G甲基化修饰,并表明m7G的内部甲基化可以影响mRNA的翻译。云序生物一家长期做高通量测序的公司,口碑良好。

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m5C RNA是近年来发现的一类在tRNA及rRNA高丰度存在的甲基化修饰。利用高通量测序手段验证了非编码RNA以及部分mRNA中m5C存在,但是在不同物种、不同组织中m5C修饰分布图谱尚没有系统性报道。云序生物率先开展m5C RNA甲基化测序服务,采用经典重亚硫 酸盐处理的方式进行测序。在全转录范围内及tRNA水平查看基因m5C甲基化修饰水平。 通过高通量测序和生物信息分析,识别甲基化富集的基因组区域。 富集峰识别后,得到的是一堆基因组位置信息,通过生物信息分析利用邻近基因对富集峰进行注释,并根据峰中点相对于已知基因的位置,将富集峰为启动子峰、上游峰、内含子峰、外显子峰、基因间峰。 RNA m6A是真核生物丰富和调节遗传信息的一种保守的转录后机制。miRNA甲基化基因

云序生物自2018年推出了超微量RNA甲基化测序。西藏超微量RNA甲基化

mRNAm6Am-Exo-seq测序服务云序生物在国内首批引入m6Am-Exo-seq测序服务,利用5’核酸外切酶消除非目的性的RNA的片段上m6A修饰的信号干扰,选择性地获取mRNA5’帽子结构下游m6Am修饰富集区域的序列信息。对选择性获取到的m6Am修饰的RNA的片段进行反转录建库和高通量测序,可为后续的生物信息学分析提供丰富的数据,进而揭示差异性m6Am修饰位点的特征及其可能的生物学功能,为您的科研课题提供强劲的助力。云序优势一站式服务:客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。西藏超微量RNA甲基化

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