蓟州区m1A
样本要求:样品类型:组织、细胞、体液或RNA样品。其它类型样品请详询。样品量:细胞:>1×108,组织:>5g ,总RNA:>300μg(OD260/280≥1.8;OD260/230≥1.5;无明显降解,电泳检测样品特征性条带完整清晰,无明显弥散或拖尾28S:18S≥1.5或者RIN≥7),样品运输及保存:样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。样品保存:细胞样品或新鲜组织块(切成5-10mg的小块),可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后,-80℃保存,RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,样品保存期间避免反复冻融。云序客户|华南农业大学余义勋课题组揭示植物RNA m1A修饰调控机制。蓟州区m1A
公司作为国内表观修饰&转录组领域的领jun者,拥有一支具有国际水准的生物信息分析团队,不仅可以提供标准化的生物信息分析,还可以根据课题需求,提供个性化的深度数据挖掘,与众多学术机构建立了合作关系。合作单位包括超过200家科研院所和高校、150余家医院等,与中国科学院,北京大学,复旦大学,上海交通大学,同济大学,浙江大学,山东大学,华南农业大学,华中农业大学等高校和研究院所建立了良好的合作关系,获得业内高度认可。未来,公司将致力于高通量技术在疾病预测、诊断、个性化医疗等方面的应用和开发,致力于为国内外科研和医疗用户提供国际先进的高通量检测系统解决方案。静海区云序生物m1A与m6A RNA检测方式一致,针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术。
此研究由云序生物合作客户华南农业大学余义勋课题组完成的,该课题组利用m1A-seq&RNA-seq(本实验云序提供)技术对矮牵牛花瓣中含m1A修饰的RNA进行全转录组分析,发现乙烯处理降低了花瓣mRNAm1A峰的水平。另外还发现矮牵牛tRNA特异性甲基转移酶61A(PhTRMT61A)的沉默降低了体内和体外mRNA的m1A水平,定位于细胞核内的PhTRMT61A被抑制会导致叶片发育异常。这些研究结果显示RNAm1A修饰可以作为表观转录组调控机制并在植物生长发育中起着重要作用。矮牵牛m1A峰的motif序列和结构特征,矮牵牛m1A峰的motif序列和结构特征,云序生物热门RNA修饰—m5C甲基化。
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案例3:细胞核和线粒体编码的转录本的m1A甲基化修饰-Base-Resolution,期刊:MolecularCell 影响因子:13.84,本研究通过单碱基分辨率方法的m1ARNA甲基化测序技术鉴定了细胞核和线粒体中m1A 甲基化修饰位点。结果发现大多数m1A甲基化修饰富集在mRNA的5’UTR,小部分符合“GUUCRA”基序的m1A 位点由一个已知的甲基化酶复合物TRMT6/61A 修饰。此外,线粒体编码的转录本中也有大量的m1A 甲基化修饰。该研究还表明,位于5’UTR 区,尤其是转录本di一和第二位上的m1A 可促进mRNA 翻译,而位于编码区的m1A 可抑制翻译作用。因此,m1A 测序不仅揭示了核编码和线粒体编码的转录本上不同类型的m1A 甲基化修饰,还为进一步m1A 甲基化功能验证提供了重要工具。RNA甲基化位点motif分析。北辰区m1Apri-miRNA测序
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