江西环状结果

时间:2023年02月16日 来源:

胶质瘤作为较常见的颅内恶性tumour占颅脑tumour的40%~50%,电磁辐射等其他环境致cancer因素会导致胶质瘤的发生,尽管手术切除、术后放疗、药物化疗等方法可以作为主流的胶质瘤医治手段,但是多形性胶质母细胞瘤(GBM)的强侵袭、增殖能力仍给病人的医治造成很大的困难。上海第二军医大学附属长征医院研究者通过环状RNA测序,从环状RNA角度对胶质瘤的发生和发展进行了研究, 共发现206个上调环状和1205个下调环状,其中扩大样本量qPCR验证(13例正常、68例疾病)后将目标锁定在circBRAF。该环状转录自BRAF基因,虽然在正常人样本当中BRAF基因编码的环状cricBRAF分子mRNA分子水平无明显差异,但是在疾病样本当中circBRAF有明显上调,KM曲线结合临床资料表明该环状的高表达能一定程度上预示着疾病的恶性程度和预后情况。m6A环状RNA测序,云序生物提供成熟m6A RNA甲基化MeRIP-seq服务。江西环状结果

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河南农业大学的研究团队利用云序生物提供的环状RNA测序服务,在小麦幼苗叶片中鉴定出大约88个环状RNA分子,而在脱水胁迫幼苗中有62个环状RNA分子存在差异表达。在脱水反应的环状RNA分子中,有6个在小麦中作为26个相应的miRNA的海绵。利用qPCR验证16个环状RNA,包括6个miRNA海绵和10个随机选择的环状RNA, 其中14个环状RNA与测序结果趋势一致,反应测序数据的真实性可靠性。GO分析和KEGG分析揭示circRNAs潜在的生物学功能,例如所涉及的参与脱水反应过程,如光合作用,叶绿素代谢,氧化磷酸化,氨基酸生物合成、代谢以及植物激su信号转导和生长素生物合成等。并且揭示了环状RNA与小麦叶片脱水抗性相关功能基因表达之间关系。河南m5c环状rna环状 RNA 呈封闭环状结构,在生物体中稳定存在。

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莠去津(Atrazine,AZ)是一种影响两栖动物发育的环境内分泌干扰物质。山东职业卫生研究中心研究团队通过比较AZ诱导发育异常组织和正常非洲爪蟾组织中环状分子的异常表达,推测环状分子可以参与wnt信号通路与孕酮介导的卵母细胞成熟信号通路。非洲爪蟾睾丸组织云序生物全转录组测序,进行环状RNA筛选验证,生信预测发现部分差异明显的环状RNA在miRNA海绵中发挥作用。本研究证明AZ可以通过调节非洲爪蟾睾丸功能基因的表达来改变环状RNA,而环状RNA在发育中的雄性非洲爪蟾的AZ诱导睾丸变性中发挥作用。

作为一种普遍存在于各类真核生物中的新型非编码RNA,环状RNA逐渐成为了当下热门的明星分子。由于环状RNA研究刚刚起步,已经进行过环状RNA研究的物种数量还非常有限。因此,对新物种的环状RNA表达谱进行系统性研究就成为了发表SCI文章的一条捷径。云序生物客户发表的这项成果是全世界first篇对小麦环状RNA进行系统性研究的文章,也为广大研究人员提供了一个非常好的模板,即:如何简单地通过环状RNA测序,环状RNA定量PCR和生物信息学分析,在不进行功能和分子机制研究的情况下,短平快的发表一篇影响因子不错的文章,非常具有借鉴意义。m5C环状RNA测序,是近年来发现的一类在tRNA及rRNA高丰度存在的甲基化修饰。

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研究指出,环状RNA能够调控来源基因的表达。为了进一步了解小麦差异表达环状RNA的功能,研究人员对它们的来源基因进行GO(GeneOntology)分析。结果显示在脱水作用下,差异表达的环状RNA的来源基因可能在不同的生物进程和分子功能方面发挥作用。2013年两篇Nature文章揭示环状RNA具有miRNA海绵的功能,它可以吸附miRNA来调节基因的表达。研究人员对不同样本之间差异表达的62种环状RNA进行靶miRNA的结合预测。发现其中6种环状RNA具有潜在的miRNA结合位点。随后,研究人员对这些miRNA下游靶基因进行功能预测,分析结果显示靶基因参与的信号通路都与脱水应激反应相关,暗示着这7种差异表达的环状RNA可能通过miRNA海绵机制发挥作用。云序生物作为业内成熟的测序公司,能为不同的客户提供个性化的服务。同一基因位置可以产生不同类型的环状RNA。北京ac4c环状平台

circRNA与白血病、恶性胶质liu、胃ai、肝ai等疾病的发生、发展密切关联。江西环状结果

技术简介 环状RNA(circular RNA,circRNA)是新发现的一类新型非编码RNA分子,其在真核细胞中的大量存在颠覆了传统的线性RNA观点,成为近两年来RNA领域中迅速升起的一颗新星。环状RNA的表达具有组织和疾病特异性,与组织发育、疾病的发生 和发展密切相关。此外,环状RNA不易降解,能在血浆、唾液等体液中稳定存在,可以作为新型疾病分子标志物。当前,科研人员对这一功能性分子仍知之甚少,可见对其展开深入的研究势在必行,一场科研的竞赛已悄然开始! 云序生物提供的环状RNA测序服务,采用Cloudseq CircRNA Enrichment Kit,去除样本中的线性mRNA和rRNA,保留纯化后的环状RNA,因此测序获得的环状RNA有效数据量是其他测序服务供应商远远无法企及的,帮助客户以较低的成本检测到更多的环状RNA。此外,Cloudseq CircRNA Enrichment Kit覆盖几乎全部已知物种,对环状RNA的研究将不再局限于人、小鼠、大鼠等常见物种。江西环状结果

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