海南m1A环状RNA实时定量PCR

时间:2023年02月16日 来源:

研究思路:作者首先分离了采用除草剂处理的雄性非洲爪蟾的睾丸组织,提取RNA,通过全转录组测序检测样本中环状RNA的表达变化。结果发现405个差异表达的环状RNA,其中44条上调和361条下调,这暗示着这些环状RNA可能在AZ污染过程中发挥作用。接下来通过环状RNA定量PCR检测和RNaseR耐受性实验验证了环状RNA的表达量和结构。随后通过生信分析如GO及KEGG分析对差异表达的环状RNA进行了功能预测。GO分析表明这些RNA分子主要参与19条信号通路,其中Wnt信号通路和黄体酮介导的卵母细胞成熟通路可能是AZ污染涉及的信号通路。CircRNA-miRNA互作网络图揭示了环状RNA作用靶miRNA及可能的功能。本文研究了非洲爪蟾的环状RNA表达谱,为后续分子机理详细研究提供诸多靶分子。越来越多的研究表明circRNA可发挥miRNA海绵或ceRNA的作用。海南m1A环状RNA实时定量PCR

海南m1A环状RNA实时定量PCR,环状

莠去津(Atrazine,AZ)是一种影响两栖动物发育的环境内分泌干扰物质。山东职业卫生研究中心研究团队通过比较AZ诱导发育异常组织和正常非洲爪蟾组织中环状分子的异常表达,推测环状分子可以参与wnt信号通路与孕酮介导的卵母细胞成熟信号通路。非洲爪蟾睾丸组织云序生物全转录组测序,进行环状RNA筛选验证,生信预测发现部分差异明显的环状RNA在miRNA海绵中发挥作用。本研究证明AZ可以通过调节非洲爪蟾睾丸功能基因的表达来改变环状RNA,而环状RNA在发育中的雄性非洲爪蟾的AZ诱导睾丸变性中发挥作用。甘肃m5c环状DNA测序云序生物环状RNA测序服务,采用Cloudseq CircRNA Enrichment Kit。

海南m1A环状RNA实时定量PCR,环状

为了更全检测小麦中所有环状RNA的表达情况,研究人员分别对PEG和水处理后的小麦幼苗叶子进行环状RNA测序,共发现了88条环状RNA。通过对环状RNA的基因组来源进行分析,发现环状RNA可分为5类,其中基因间(intragenic)产生的环状RNA占大多数。接下来,研究人员系统分析了不同样本之间环状RNA的表达情况,发现62条环状RNA差异表达,这暗示着这些环状RNA可能在脱水应激中发挥作用。为了验证测序结果的准确性,研究人员挑选了16条环状RNA,利用“divergentprimers”进行环状RNA定量PCR检测。

2.环状RNA定量PCR及RNaseR耐受实验,验证环状RNA的表达和结构为了验证测序结果的准确性,研究人员随机选取了8条差异表达的环状RNA,利用“divergentprimers”进行环状RNA定量PCR检测和RNaseR耐受性实验。所有环状RNA的表达都能够被定量PCR实验检测到,并且定量PCR结果与测序结果趋势一致,表明环状RNA测序结果准确性非常高。所有环状RNA都能抵抗RNaseR的消化,进一步证实了这些RNA的环形结构。云序生物作为国内早期提供环状RNA测序的测序公司,自行建立的环状RNA数据库circDB,借物种覆盖广、数据量大、疾病背景多的特点为客户提供好的服务。云序生物对m6A RNA-seq实验每一步骤均设有关键质控。

海南m1A环状RNA实时定量PCR,环状

作为明星分子,环状RNA的热度与日俱增。环状RNA到底火到了什么程度?从云序客户捷报频传﹑研究成果不断就可见一斑:上期我们刚刚介绍云序客户发表了世界小鼠脑创伤模型外泌体环状RNA的研究,整合了外泌体和环状RNA两大科研热点。在探索新物种的环状RNA研究上,云序客户此前更是先后发表了全世界first斑马鱼环状RNA、first篇小麦环状RNA和first篇鸡环状RNA文章,如今首篇非洲爪蟾的环状RNA文章新鲜出炉了!这一成果今年年初发表在《Chemosphere》(影响因子4.2)上!环状RNA在未来可能成为一种新型的生物标志物。四川m6a环状dna

种类繁多,而且有些circRNA高于其相应的线性RNA10倍之多。海南m1A环状RNA实时定量PCR

是主要从事RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体的一家企业,公司成立于2015-03-02,公司位于上海市松江区新桥镇莘砖公路518号20幢302室-2。目前公司产品及服务涉及多个行业。拥有着RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体等主要的业务,我们坚持以市场为导向,以客户为根本本,以客户为中心,以技术和服务为动力和依托,积极进取。公司致力于为客户提供多维度的新兴和成熟技术及服务,RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体有着完善的行业解决方案和产品及服务。多年来公司平稳发展,在与行业众多企业共同发展中,积累了很多经验,公司在商务服务行业中颇有竞争力。一直以来公司本着合作共赢的精神,以人性化管理为基础,树立多维度、协调、可持续的发展观。海南m1A环状RNA实时定量PCR

上海云序生物科技有限公司是一家有着雄厚实力背景、信誉可靠、励精图治、展望未来、有梦想有目标,有组织有体系的公司,坚持于带领员工在未来的道路上大放光明,携手共画蓝图,在上海市等地区的商务服务行业中积累了大批忠诚的客户粉丝源,也收获了良好的用户口碑,为公司的发展奠定的良好的行业基础,也希望未来公司能成为*****,努力为行业领域的发展奉献出自己的一份力量,我们相信精益求精的工作态度和不断的完善创新理念以及自强不息,斗志昂扬的的企业精神将**云序供和您一起携手步入辉煌,共创佳绩,一直以来,公司贯彻执行科学管理、创新发展、诚实守信的方针,员工精诚努力,协同奋取,以品质、服务来赢得市场,我们一直在路上!

信息来源于互联网 本站不为信息真实性负责