江苏分析表观遗传组测序研究

时间:2022年01月08日 来源:

云序优势 一站式服务: 客户只需提供细胞或组织,云序生物为您完成从样品准备、文库制备、上机测序到数据分析的整套服务流程。 严格的质控: 严格的质控是ChIP-Seq实验成功的前提。云序生物对ChIP-Seq实验的各个环节进行严格的质控,尽可能地降低实验风险。 优化的ChIP流程: ChIP富集效率是ChIP-Seq成败的关键,云序生物采用商业化ChIP试剂盒和优化的实验流程,确保客户获得更好的数据。 专业的生物信息学分析: 云序生物具有强大的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析需求。促进tumsour细胞演进和适应性进化,增加了基因组的可塑性和不稳定性。江苏分析表观遗传组测序研究

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在过去十年中,对非小细胞肺ai(NSCLC)的理解发生了重要的变化。现在证实,NSCLC具有不同的分子亚型。现在医生认为,针对NSCLC的个性化医治,应该是利用这些分子亚型匹配相对应的靶向疗法。表皮生长因子(EGFR)突变和ALK易位被认为是NSCLC医治很有效的靶点。但是EGFR和ALK的突变数量是多种多样的,并且我们检测到的突变类型还在不断地增加。因此,现代科学家们利用基于NGS的ctDNA技术,从患者血液中可以获得ROS1,BRAF,KRAS,HER2-,c-MET,RET,PIK3CA,FGFR1和DDR2的突变信息,从而利用这些突变信息为患者选择合适的靶向疗法。江苏分析表观遗传组测序研究在治 疗过程中,ctDNA甲基化水平与ai细胞数量呈正比。

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案例2:良性和恶性外周神经鞘膜瘤的比较甲基化组分析 Feber, A., G. A. Wilson, et al. "Comparative methylome analysis of benign and malignant peripheral nerve sheath tumors." Genome Res 21(4): 515-24. MeDIP测序可以对基因组中的甲基化区进行无偏差的分析,而不只局限于基因启动子和CpG岛。本文通过MeDIP测序对恶性外周神经鞘膜瘤、良性神经纤维瘤和正常雪旺细胞中的甲基化组进行了比较分析,找到了101,466个ai症特异性差异甲基化区(cDMRs)。数据表明:这些cDMRs在两类卫星重复序列(SATR1 和ARL a)中明显富集;此外,高甲基化cDMRs在CpG岛岸、非CpG岛相关启动子中明显富集,而低甲基化cDMRs在SINE重复序列中明显富集。通过与基因表达数据的联合分析发现:与CpG岛岸cDMRs相关的基因的表达模式可以区分疾病表型。

染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)是研究蛋白质与DNA相互作用的经典技术,被普遍应用于转录因子结合位点或组蛋白修饰位点的研究。 云序生物提供的ChIP-Seq服务,将ChIP和高通量测序技术结合,在全基因组范围内检测与特定转录因子或组蛋白结合的DNA位点。配合强大的生信分析实力,云序生物提供的不仅是海量的测序数据,而且是根据您的研究目的,有针对性地挖掘提炼出取之即可用的结果及出版级图片。云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。

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ATAC测序的全称是Assay for Transposase Accessible Chromatin using sequencing,运用测序手段研究转座酶可接近的染色质的一种技术。该技术通过转座酶对某种特定时空下开放的核染色质区域进行切割,进而获得在该特定时空下基因组中活跃转录的调控序列。这项技术只需少量细胞便可获得实时全基因组活性调控序列信息,应用于转录因子结合分析、核小体定位、活性调控元件分布等研究,在表观遗传机制研究领域有广阔的应用前景。 云序生物对染色质开放区域进行研究的技术是利用ATAC测序技术,其原理为:利用DNA转座酶可以携带DNA去识别染色质开放区域。人为地将携带已知DNA序列标签的转座复合物(即带着测序标签的转座酶),加入到细胞核中,再利用已知序列的标签进行建库后测序,从而识别染色质的开放区域。可用于协助评估用药疗效、复发及医治后期转移动态的监测。江苏分析表观遗传组测序研究

还在tumsour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。江苏分析表观遗传组测序研究

而NGS技术能够检测基因突变。靶向深度测序和基于捕获物测序的方法可以在指定区域进行检测。重要的是,外显子血浆DNA分析开辟了一种新的机遇,即其可以描述突变组的特征,而不需要关注之前或者现在存在的突变。基于NGS的ctDNA全基因组测序,不仅可以发现染色体重组,易位等情况,其对tumsor标记物还具有敏感性和特异性。同时,在选定的情况下,基于NGS的ctDNA测序还能发现体细胞拷贝数的畸变。正是基于以上优势,NGS在ctDNA检测中,开始扮演越来越重要的角色。而基于NGS的ctDNA检测的效果,也在很多临床实验中得到了证实。江苏分析表观遗传组测序研究

上海云序生物科技有限公司是一家上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。的公司,是一家集研发、设计、生产和销售为一体的专业化公司。云序生物拥有一支经验丰富、技术创新的专业研发团队,以高度的专注和执着为客户提供RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体。云序生物继续坚定不移地走高质量发展道路,既要实现基本面稳定增长,又要聚焦关键领域,实现转型再突破。云序生物创始人李巍,始终关注客户,创新科技,竭诚为客户提供良好的服务。

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