海南RIP环状RNA修饰

时间:2023年05月24日 来源:

云序生物—环状RNA研究优势云序生物作为国内早期提供环状RNA测序的测序公司,自行建立的环状RNA数据库circDB,借物种覆盖广、数据量大、疾病背景多的特点为客户提供好的服务。云序积累了超过10000例环状RNA测序的经验,样本覆盖20多个物种以及50多种疾病。云序生物提供系统性环状RNA服务,从筛选(circRNA测序)到验证(qPCR)再到机制研究(RIP、RNApull-down、ChIP、双荧光素酶实验)以及上游表观调控(m6A甲基化等各类RNA修饰研究),为您更全的覆盖环状RNA上下游分子机制验证的重要研究环节。除了提供组织和细胞的样本类型测序之外,我们还提供体液、血清血浆、外泌体石蜡样本等特殊样本的测序服务。回首过去,从国内发出circRNA测序到全转录组测序概念提出,到m6A等RNA甲基化测序平台出现,再到如今的eccDNA测序服务,我们一直在紧跟国际科研热点方向进行测序技术的创新。m6A RNA-seq的富集效率是决定数据质量的关键。海南RIP环状RNA修饰

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“一站到底”!云序生物环状RNA研究从做谱(环状RNA测序、全转录组测序、环状RNA甲基化测序)到机制研究(RNA Pull Down、RIP),为您更全的覆盖差异环状RNA分子筛选到下游分子机制验证的重要研究环节。此外,云序生物自行建立并维护的环状RNA数据库circDB凭借物种覆盖广、数据量大、疾病背景多的特点,支持许多客户发表环状RNA成果。在过去的时间里云序生物和各位生命科学领域的**学者、医护工作者共同进步成长,探索未知的奥秘。回首过去,从表观遗传学到表观转录组学,从基因组到蛋白质组,从细胞内到外泌体,云序生物依托于高通量测序技术为越来越多的临床与基础生物研究者提供了高质量的科研服务。在我们的共同努力下,相信在新的一年里云序客户会发表更多的高分文章。重庆外泌体环状研究云序生物对ac4C RNA乙酰化检测手段为acRIP-Seq技术。

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研究三:环状RNA分子功能机制 在确定Cia-cGAS具有明显细胞表型之后,作者围绕其分子机制展开了详细的探索。为了找到Cia-cGAS影响下游的靶基因,作者在敲除Cia-cGAS后进行转录组分析,发现差异表达的基因与IFN-α下游靶基因是一致的。且当Cia-cGAS敲除后I型IFN mRNAs 表达量也明显增高。结果,作者证实cia-cGAS通过调控I型IFN通路影响LT-HSC静息状态。接下来,作者针对Cia-cGAS在该通路中的作用机理进行了详细解析。作者直接采用RNA Pull Down技术手段找到与Cia-cGAS相互作用的功能蛋白。基于这一技术手段,作者发现Cia-cGAS与cGAS蛋白具有明显相互作用。cGAS RIP实验反向证实二者之间具有真实的相互作用。免疫荧光及FISH实验证实Cia-cGAS及cGAS细胞内共定位表达。基于EMSA等技术手段,作者找到了二者相互作用位点。后续作者补充大量生理生化实验,结果揭示LT-HSC中Cia-cGAS结合并抑制cGAS的活性,结果通过拮抗cGAS催化产物I型IFN来维持HSCs静息状态。

1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速轰动了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项youxiu青年基金,两项重点项目,94项面上项目,62项青年基金项目,15项地区科学基金项目。比如中医学和药理学方向,相信未来其他类型的tumour和学科方向必定会争取更多的环状RNA课题资助。与此同时,生命科学方向环状RNA研究显得略微低调些,m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰。

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样本要求样品类型:组织、细胞、体液或总RNA样品。其它类型样品请详询。样品量:a)细胞:2×106b)组织:50mgc)体液:全血、血清、血浆2-3ml脑脊液:5ml尿液:50mld)总RNA:2μg(OD260/280≥1.8;OD260/230≥1.5无明显降解,电泳检测样品特征性条带完整清晰,无明显弥散或拖尾)样品运输及保存:样品运输:样品置于1.5mL管中,封口膜封好,干冰运输。样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;血液样品应使用EDTA抗凝,不可用肝素;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。circRNA分子呈封闭环状结构,不受RNA外切酶影响。湖北环状DNA测序

云序生物环状RNA测序服务,采用Cloudseq CircRNA Enrichment Kit。海南RIP环状RNA修饰

云序优势适用于任何物种:可以检测几乎所有动植物的环状RNA。适用于降解样品:可以检测部分降解的样品的环状RNA。有效数据量高:通过商业化kit富集环状RNA,极大地提高了有效数据比例。性价比高:能够用较低的成本检测更多的环状RNA。一站式服务:客户只需提供细胞、组织、体液或总RNA,云序生物为您完成从样品准备、文库制备、上机测序到数据分析的整套服务流程。专业化的生物信息学分析:云序生物具有强大的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析要求。海南RIP环状RNA修饰

上海云序生物科技有限公司汇集了大量的优秀人才,集企业奇思,创经济奇迹,一群有梦想有朝气的团队不断在前进的道路上开创新天地,绘画新蓝图,在上海市等地区的商务服务中始终保持良好的信誉,信奉着“争取每一个客户不容易,失去每一个用户很简单”的理念,市场是企业的方向,质量是企业的生命,在公司有效方针的领导下,全体上下,团结一致,共同进退,**协力把各方面工作做得更好,努力开创工作的新局面,公司的新高度,未来云序供和您一起奔向更美好的未来,即使现在有一点小小的成绩,也不足以骄傲,过去的种种都已成为昨日我们只有总结经验,才能继续上路,让我们一起点燃新的希望,放飞新的梦想!

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