安徽环状lncRNA测序

时间:2023年05月25日 来源:

研究指出,环状RNA能够调控来源基因的表达。为了进一步了解小麦差异表达环状RNA的功能,研究人员对它们的来源基因进行GO(GeneOntology)分析。结果显示在脱水作用下,差异表达的环状RNA的来源基因可能在不同的生物进程和分子功能方面发挥作用。2013年两篇Nature文章揭示环状RNA具有miRNA海绵的功能,它可以吸附miRNA来调节基因的表达。研究人员对不同样本之间差异表达的62种环状RNA进行靶miRNA的结合预测。发现其中6种环状RNA具有潜在的miRNA结合位点。随后,研究人员对这些miRNA下游靶基因进行功能预测,分析结果显示靶基因参与的信号通路都与脱水应激反应相关,暗示着这7种差异表达的环状RNA可能通过miRNA海绵机制发挥作用。云序生物作为业内成熟的测序公司,能为不同的客户提供个性化的服务。环状RNA不同物质间进化上具有保守性。安徽环状lncRNA测序

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从环状RNA结合功能蛋白角度,成功的向我们展示了核内circRNA具有重要生理功能,以及该类型circRNA的研究方法。首先通过高通量测序筛选与造血干细胞干性维持相关的circRNA分子,围绕该分子设计一系列体内、体外干扰实验,确定其可引起干细胞干性维持相关细胞表型改变。后续,与circRNA海绵机制研究类似,RNAPullDown实验及RIP实验成为机制研究成功与否的关键钥匙。作者基于RNAPull-down技术筛选到可能与Cia-cGAS相互作用的蛋白质,并进一步通过RIP实验反向验证。天津外泌体环状dnam5C环状RNA测序,是近年来发现的一类在tRNA及rRNA高丰度存在的甲基化修饰。

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作为一种广fan存在于各类真核生物中的新型非编码RNA,环状RNA逐渐成为了当下热门的明星分子。由于环状RNA的研究刚刚起步,已经进行过环状RNA研究的物种数量还非常有限。因此,对新物种中环状RNA表达谱进行系统性研究就成为了发表SCI文章的一条捷径。云序生物客户发表的这项成果是全世界di一篇对非洲爪蟾环状RNA进行系统性研究的文章,也为广大研究人员提供了一个非常好的模板,即:如何通过环状RNA高通量测序和生物信息学分析,在不进行功能和分子机制研究的情况下,短平快的发表一篇影响因子不错的文章,非常具有借鉴意义。

环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品,严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章,受到了广大客户的一致好评。迄今为止,云序已经积累了超过10000例环状RNA测序的经验,样本覆盖20多个物种以及50多种疾病,客户发表文章达20篇以上,“云序制造”越来越多的出现在科研论文当中。云序生物作为国内早期提供环状RNA测序的公司,拥有先进的技术,专业的团队,精密的仪器。环状RNA(circular RNA,circRNA)是新发现的一类新型非编码RNA分子。

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自2013年的两篇在Nature期刊上对于环状机制研究成果问世以来,对于环状RNA的关注达到了空前的地步,迅速成为RNA领域火热的明星分子之一。环状RNA相比于线性结构的mRNA分子,具有更稳定的环状封闭结构,因此在循环体系中环状的表达量更稳定。多篇文章已报道环状RNA可行使“microRNA海绵机制”,通过竞争性的结合miRNA间接影响mRNA,在多种疾病的发生和发展中起到了重要的调控作用。环状RNA的研究从传统的“海绵机制”逐步发展多元化,更多的呈现出功能的多样性,如结合功能蛋白、编码蛋白潜能、影响可变剪切、受甲基化调控等。无处不在的功能覆盖让环状研究备受亲睐。新年伊始,云序生物公众号将为大家优中评优,悉数云序客户部分的环状RNA研究成果2006年在果蝇中发现来自于Muscleblind的未知环状转录本。浙江m1A环状RNA研究

RIP(RNA Immunoprecipitation)是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术。安徽环状lncRNA测序

为了更全检测小麦中所有环状RNA的表达情况,研究人员分别对PEG和水处理后的小麦幼苗叶子进行环状RNA测序,共发现了88条环状RNA。通过对环状RNA的基因组来源进行分析,发现环状RNA可分为5类,其中基因间(intragenic)产生的环状RNA占大多数。接下来,研究人员系统分析了不同样本之间环状RNA的表达情况,发现62条环状RNA差异表达,这暗示着这些环状RNA可能在脱水应激中发挥作用。为了验证测序结果的准确性,研究人员挑选了16条环状RNA,利用“divergentprimers”进行环状RNA定量PCR检测。安徽环状lncRNA测序

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