江西云序生物测序RNA甲基化

时间:2023年05月26日 来源:

外显子组测序利用序列富集技术特异性的检测基因组中的外显子区域(编码蛋白的DNA区域),能够直接发现与蛋白质功能变异相关的遗传突变。与全基因组重测序相比,外显子组测序只针对外显子区域,性价比极高,更适用于大样本量疾病及ai症样本分析。外显子捕获试剂盒:云序生物采用Agilent外显子捕获试剂盒,不仅能检测全部外显子区域,还能检测与蛋白功能密切相关的UTR区域专业化的生物信息分析:云序生物具有强大的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析要求环状DNA是从染色体上断裂、环化或者额外复制产生的序列。江西云序生物测序RNA甲基化

江西云序生物测序RNA甲基化,测序

环状DNA连登《Nature》《Cell》等高级期刊,彻底颠覆了人们对基因遗传的传统认知,成为了很有潜力的科研新热点。云序生物环状DNA甲基化测序技术基于转座酶和m5C位点酶学转化方法,用核酸外切酶V消化以去除线性DNA。通过转座酶打开环状DNA的环形结构,并在DNA的片段的两端加上接头。通过Klenow酶修复转座产物的末端缺口。通过温和的酶转化法,将未甲基化的胞嘧啶(C)高效地转化为尿嘧啶(U),后续进行文库构建与高通量测序,从而获得发生甲基化修饰的环状DNA。该技术可以同时检测环状DNA和环状DNA的甲基化修饰状态,为环状DNA的深入研究及新型分子标志物的开发提供了新的技术手段。湖南测序研究环状RNA是新发现的一类新型非编码RNA分子。

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LC-MS/MS检测核酸修饰水平实验原理:云序生物建立了一种基于LC-MS/MS平台的核酸修饰分析方法,定量4类DNA修饰(5-mdC、5-hmdC、5-fodC、6-mdA)和9类RNA修饰(m5C、m6A、Am、Gm、Cm、Um、m1A、m7G、ac4C),为表观遗传研究提供理想的技术平台。液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)能够很好的检测到极性高、稳定性差的化合物,并能够对物质进行精确的定量。LC-MS/MS法是目前所有总体甲基化水平分析方法中能够对含量极低的修饰碱基进行准确定性定量的方法;而将LCMS/MS法与一定的样品前处理方法相结合,能够更好地对各类生物样品中的DNA/RNA修饰进行检测。

m6A环状RNA测序:近年来,科学家们发现了一种可逆的RNA甲基化—m6A,即RNA分子腺嘌呤第6位氮原子上的甲基化修饰(N6-methyladenosine,m6A)。研究发现,m6A是真核生物mRNA上常见的一种转录后修饰,m6A在细胞加速mRNA代谢和翻译,在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。目前对m6ARNA流行检测手段为MeRIP-Seq技术,云序生物提供成熟m6ARNA甲基化MeRIP-seq服务,技术原理如下:将甲基化RNA特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育,抓取有甲基化修饰的片段进行测序。云序生物拥有受行业认可的BD Rhapsody™单细胞测序平台。

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m5C全转录组测序m5C RNA是近年来发现的一类在tRNA及rRNA高丰度存在的甲基化修饰。利用高通量测序手段验证了非编码RNA以及部分mRNA中m5C存在,但是在不同物种、不同组织中m5C修饰分布图谱尚没有系统性报道。云序生物率先开展m5C RNA甲基化测序服务,采用经典重亚硫 酸盐处理的方式进行测序。在全转录范围内及tRNA水平查看基因m5C甲基化修饰水平。 样品运输与保存 样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。云序生物采用商业化RIP试剂盒,保证了RIP实验的成功率和稳定性。广东测序lncRNA

云序生物acRIP-seq实验采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程。江西云序生物测序RNA甲基化

目前对m6ARNA流行检测手段为MeRIP-Seq技术,云序生物提供成熟m6ARNA甲基化MeRIP-seq服务,技术原理如下:将甲基化RNA特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育,抓取有甲基化修饰的片段进行测序;同时需要平行测序一个对照(Input)样本,对照样本只含有打断的RNA的片段,并不添加RNA甲基化特异性抗体与其共孵育。对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。对比免疫共沉淀(IP)样本和对照样本(Input)中的序列片段,将RNA甲基化修饰位点定位到转录组上,并根据RNA-seq数据,计算样本中RNA甲基化程度。江西云序生物测序RNA甲基化

上海云序生物科技有限公司在同行业领域中,一直处在一个不断锐意进取,不断制造创新的市场高度,多年以来致力于发展富有创新价值理念的产品标准,在上海市等地区的商务服务中始终保持良好的商业口碑,成绩让我们喜悦,但不会让我们止步,残酷的市场磨炼了我们坚强不屈的意志,和谐温馨的工作环境,富有营养的公司土壤滋养着我们不断开拓创新,勇于进取的无限潜力,云序供携手大家一起走向共同辉煌的未来,回首过去,我们不会因为取得了一点点成绩而沾沾自喜,相反的是面对竞争越来越激烈的市场氛围,我们更要明确自己的不足,做好迎接新挑战的准备,要不畏困难,激流勇进,以一个更崭新的精神面貌迎接大家,共同走向辉煌回来!

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