浙江测序lncRNA

时间:2023年05月26日 来源:

m6A修饰就是真核生物mRNA中较常见存在的一种修饰形式,得到了常见的关注和研究。除此之外,还存在着一种分子结构上非常相似的RNA修饰形式:m6Am——在m6A修饰的基础上,同一个腺苷酸残基的核糖的2’羟基也被甲基化,产生2’甲氧基结构(2’-O-CH3)。与m6A的常见分布所不同的是,m6Am修饰的分布主要局限于mRNA5’帽子结构下游的较早核苷酸残基上发生。该位点的m6Am修饰在进化上高度保守,无论是在斑马鱼、小鼠还是人类细胞中均有发现。云序生物提供了成熟的 RNA O8G氧化MeRIP-Seq技术服务。浙江测序lncRNA

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云序优势 单碱基分辨 m7G RNA甲基化单碱基测序方式,可对m7G甲基化修饰进行单碱基定位。 抗体富集效率高 m7G MeRIP测序方式,采用预验证的商业化抗体和精心优化的实验流程,具有极高的效率和特异性。 高通量检测 可对全转录组范围内的m7G位点进行高通量地平行检测。 全分子覆盖 可较全地对环状RNA、mRNA、lncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多类RNA分子的m7G位点进行检测。 一站式服务 客户只需提供组织或细胞,云序生物一站式完成RNA抽提,样品预处理,建库,测序,数据分析全套流程。 专业的生物信息学分析 专业的生物信息学团队,能够满足客户的各类深入数据分析需求贵州测序平台云序生物拥有强大的生信分析团队,可以为客户提供个性化要求。

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云序优势环状DNA检出率高:采用多种方法高效地富集环状DNA,环状DNA检出率高。专业的生物信息学分析:专业的生物信息学团队,开发了高效识别分析环状DNA的算法,满足客户的各类深入数据分析需求。一站式服务:客户只需提供细胞、组织或基因组DNA,云序生物为您完成从样品准备、环状DNA富集、文库制备、上机测序到数据分析整套服务流程。目前,环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物,还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。可以预见的是,环状DNA将迅速成为新的科研热点,甚至会对传统遗传学和基因组学带来性影响。

云序生物提供两种m7GRNA甲基化测序服务:(1)m7GRNA甲基化单碱基测序,可对m7G修饰进行高通量检测和单碱基定位;(2)MeRIP测序,可通过m7G特异性抗体,抓取有甲基化修饰的片段进行测序,对m7G修饰进行高通量测序和peak峰定位。此外,云序生物针对m7GRNA甲基化开发了多款产品,可实现对mRNA、LncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多类RNA分子的m7G甲基化修饰水平的全多方面检测。目前,环状DNA不只可以作为一种新型特异的tumour标志物,还在tumour发生和发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。环状RNA是新发现的一类新型非编码RNA分子。

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案例1:环状DNA促进染色质的开放和促cancer基因的表达 原文:Wu, S., Turner, K.M., Nguyen, N. et al. Circular ecDNA promotes accessible chromatin and high oncogene expression. Nature (2019) . 期刊:Nature 影响因子:43.07 研究团队首先结合二代全基因组测序和光学匹配(optical mapping),从序列的角度发现,扩增出来的环状DNA形成了环状结构,不仅证实了tumour中的环状DNA确实是环状的,还证明了环状DNA的染色质是高度开放的,从而进一步阐释了环状DNA能大量表达cancer基因和其环状结构介导的超远距离相互作用,这也表明了环状DNA可能形成了新的基因调控回路和在驱动tumour异质性的机制研究中发挥着重大的作用。RNA抽提,RNA质控,环状RNA特异性引物设计,环状RNA逆转录,环状RNA qPCR检测。北京平台测序

每个样品组做一个Input,以去除基因组背景,降低假阳性率 。浙江测序lncRNA

m7G lncRNA测序 m7G RNA甲基化是在甲基化转移酶的作用下,使RNA鸟嘌呤(G)的第七位N上加上甲基的一种修饰(N7-methylguanosine,m7G)。研究表明,m7G RNA甲基化修饰存在于各类分子中,包括:mRNA 5’帽子结构、mRNA内部、pri-miRNA、转运RNA(tRNA)和核糖体RNA(rRNA)。m7G RNA甲基化修饰能够调节mRNA的转录、miRNA的生物合成和生物学功能、tRNA稳定性、18S rRNA的核内加工及成熟。m7G RNA甲基化修饰作为一类新型RNA甲基化,近两年高影响因子文章不断,是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点。浙江测序lncRNA

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