上海比色法检测整体甲基化
样本要求 1)样品类型:细胞、新鲜组织或RNA 样品。 2)样品量: 细胞:2×107 组织:500 mg-1 g RNA:30 - 300 μg,浓度不低于100 ng/μL 3)RNA 质量要求: OD260/280:1.8~2.1 浓度≥ 100 ng/μl RNA 无明显降解(28S:18S ≥ 1.5 或者RIN ≥ 7) 4)样品保存: 新鲜组织可用RNA保护剂处理或液氮冻存后,-80℃保存。 细胞样品,离心收集细胞沉淀后用PBS洗2遍,直接-80℃保存;RNA 样品可溶于乙醇或RNA-free 的超纯水中,-80℃保存。样品保存 Note:样品保存期间避免反复冻融。 5)样品运输:样品置于1.5 ml Eppendorf管或冻存管中,封口膜封好,装在塑料袋中,干冰运输。核糖RNA在2’位置上发生甲基化的化学修饰。上海比色法检测整体甲基化
云序优势 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。 样本要求 样品类型: 细胞、新鲜组织或RNA样品。其它类型样品请详询。 样品量: a) 细胞:2×107 b) 组织:100 mg-1 g c) RNA:30-300 μg(OD260/280:1.6-2.3;RNA无明显降解28S:18S>1.5或RIN>7) 样品运输与保存 样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。上海比色法检测整体甲基化RNA 修饰在基因表达调控中扮演着非常重要的角色。
PNAS| 8-oxoG在mRNA中的积累可以改变哺乳动物细胞中的蛋白质翻译 发表时间:2018年4月17号 影响因子:9.412 PNAS杂志发表了来自国家老年医学中心、北京医院研究的一篇有关O8G氧化修饰改变哺乳动物细胞中蛋白合成的研究成果。文章题目为“Transcriptional mutagenesis mediated by 8-oxoG induces translational errors in mammalian cells”。 哺乳动物细胞内形成的活性氧可以在mRNA中产生8-oxoG修饰,这一氧化修饰在基因表达过程中会导致碱基错配。本研究首先构建了一种基于超敏荧光素酶Gluc(Gussia luciferase)的报告基因检测系统,通过第二代测序技术发现当RNA中8-oxoG含量增加使U-to-G位点增加,从而诱导表达淀粉样前体蛋白的淀粉样β肽(老年痴呆的重要标志物)。该研究结果表明,8-oxoG在mRNA中的积累可以改变哺乳动物细胞中的蛋白质合成。本论文的发表为深入氧化修饰与蛋白合成间的分子机理提供了全新的研究思路!
RNA m6A甲基化是RNA较关键的内部修饰之一,是真核生物丰富和调节遗传信息的一种保守的转录后机制。m6A修饰具有多种生物学功能,如调控mRNA翻译、转录以及稳定性等。目前,已在多种植物中发现这种RNA修饰,参与调控不同植物的各方面生物学功能。其中,拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与m6A甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化普遍存在于拟南芥各个发育期,并揭示了RNA甲基化相关酶在特殊发育时期,如开花,叶片形成,种子发育,根部生长等过程中发挥重要作用。2’-O-RNA甲基化是一种受RNA甲基化酶或纤维蛋白酶作用下。
原文:METTL4 catalyzes m6Am methylation in U2 snRNA to regulate pre-mRNA splicing 期刊:Necleic Acids Research 影响因子:16.48 新加坡南洋理工大学的研究人员通过人类全转录组 RNA 甲基化测序,在 Mettl4 敲除组与野生型对照组之间寻找出 m6Am 相对甲基化水平的差异位点,其中 U2 snRNA 的第 30 位 RNA 残基有明显的 m6Am 修饰水平差异。进一步的 FLAG-tag 融合蛋白实验证明,METTL4 蛋白直接催化了 U2 snRNA 上的 m6Am 甲基化修饰的发生。METTL4 过表达实验发现,其催化的 RNA 内部 m6Am 修饰位点具有 HMAGKD 的序列 motif 特征(H=A/C/U, M=A/C, K=G/U, D=A/G/U)。 在 Mettl4 敲除的人类细胞中,因为 U2 snRNA 无法完成 m6Am 修饰,故而对 snRNA 的 pre-mRNA 剪接功能产生了诸多影响。目前对m6A RNA流行检测手段为MeRIP-Seq技术。上海比色法检测整体甲基化
RNA甲基化普遍存在于拟南芥各个发育期。上海比色法检测整体甲基化
案例1:m5C RNA甲基化调控mRNA出核新机制 原文:5-methylcytosine promotes mRNA export — NSUN2 as the methyltransferase and ALYREF as an m5C reader 期刊:Cell Research 影响因子:15.60 中科院汪海林等研究团队揭示了m5C修饰在mRNA的分布图谱规律及其对调控mRNA出核作用新机制。研究人员建立了改进的RNA m5C单碱基分辨率高通量测序与生物信息分析技术,以此揭示mRNA m5C的分布规律,并绘制了精细的m5C修饰图谱,发现m5C在mRNA的翻译起始位点下游有明显富集,并且主要分布于CG富集区域。通过分析对比人和小鼠不同组织,发现m5C在mRNA上的分布特征在哺乳动物中十分保守,而在不同组织中修饰的基因具有特异性。研究团队同时发现,在小鼠睾丸发育过程中,动态的m5C修饰基因明显富集于精子发育相关功能,提示m5C修饰参与生殖发育调控。上海比色法检测整体甲基化
上海云序生物科技有限公司总部位于上海市松江区新桥镇莘砖公路518号20幢302室-2,是一家上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。的公司。云序生物拥有一支经验丰富、技术创新的专业研发团队,以高度的专注和执着为客户提供RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体。云序生物始终以本分踏实的精神和必胜的信念,影响并带动团队取得成功。云序生物始终关注商务服务市场,以敏锐的市场洞察力,实现与客户的成长共赢。
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