昌平区分析m1A

时间:2022年01月13日 来源:

自2010年以来,RNA表观遗传学概念提出后,随后几年这一领域的研究便如火如荼的开展起来,同时也取得了zhuo越的成果,其中包括m6A,m5C RNA甲基化修饰等,而我们要来谈一谈的是近发表在Molecular Cell (IF:14.714)上的一篇关于m1A RNA甲基化的文章,这是一类新型RNA修饰,想必大家也迫不及待地想看看科研研究成果了吧,话不多说,让我们来一探究竟。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤di1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。上海,北京,广州,天津、福建、广东,广西。昌平区分析m1A

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云序生物作为国内很早做m6A的科研平台,至今用户已发表15+篇m6A相关文章,其中多篇影响因子超过10分,成为国内m6A测序专业的服务平台。云序生物RNA修饰高通量测序产品覆盖面广,包括编码mRNA和非编码lncRNA,circRNA,microRNA等分子。云序生物既提供针对单个分子的m6A测序,也提供一次检测多种RNA分子m6A修饰的全转录组测序,此外公司长期致力于提供you质前沿表观研究测序产品,结合科研热点继m6A、m5C、m1A之后,隆重推出多款RNA新修饰,不仅有m7G测序,还包括m3C测序、ac4C乙酰化测序和2'-O-甲基化测序,打造了全修饰和全分子覆盖的研究平台。如今云序用户m6A,m5C、m1A文章接连发表,期待云序用户其他RNA修饰研究的发表!昌平区分析m1A全转录组测序,哪家比较好,云序生物比较好。

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MeRIP-Seq技术服务由上海云序生物科技有限公司提供,是在已发表实验方法的基础上开发而来,方法简述如下:片段化的RNA与m1A抗体在IPP缓冲液中4度共孵育2小时。反应混合物进一步用protein A磁珠(Thermo Fisher)在4度免疫沉淀2小时。然后用游离的m1A腺苷类似物洗脱磁珠上结合的RNA。洗脱的RNA进一步通过Trizol试剂(Thermo Fisher)进行抽提。抽提纯化的RNA通过RNA建库试剂盒(NEB)建库,并在Illumina Hiseq测序仪上进行双端150bp测序。

2. m1A-MAP揭示人全转录组m1A修饰,作者通过m1A-MAP在人全转录组水平上进行检测,发现了740个m1A修饰位点,其中473个位点位于mRNA和lncRNA,大部分位于5’-UTR。通过比对SNP数据库,作者还排除了假阳性结果。另外,作者通过多核糖体图谱还发现5’-UTR区域发生m1A与mRNA翻译效率呈正相关,且这种正相关性在cap+1位置上更xian著,但在CDS区域和3’-UTR区都没有出现。这些发现不同位置的m1A修饰可能发挥不同的生物学功能。通过motif分析,作者发现m1A修饰位点偏好GUUCRA序列。另外,作者发现TRMT6/61A不仅是tRNA m1A甲基化酶复合物,也是mRNA上发生m1A修饰所需要的酶。近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。

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目前热门的有三种,分别是:m6A RNA甲基化﹑m5C RNA甲基化﹑m1A RNA甲基化。而m1A RNA甲基化是一个新进入大家的视野的RNA甲基化修饰类型,即 RNA 分子腺嘌呤第 1 位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。我们为大家带来m1A RNA甲基化研究进展。1. Nature:真核生物mRNA中m1A的动态修饰研究,2.Cell:ALKBH1介导的tRNA去甲基化调控翻译,3. Nature Chemical Biology:全转录组水平测序揭示可逆与动态的m1A RNA修饰,4.Molecular Cell:细胞核和线粒体编码的转录本的m1A甲基化修饰: Base-Resolution。分辨质谱对mRNA中的m1A修饰进行定量,发现其存在于各种细胞系中。昌平区分析m1A

RNA甲基化富集峰分布图。昌平区分析m1A

生物化学表征分析显示:ALKBH1在体外或者细胞内对tRNA中的m1A甲基化都具有去甲基化活性。同时展示了ALKBH1控制tRNA iMet以影响翻译起始,并且m1A甲基化的tRNA优先被招募到多核糖体以促进翻译伸长。ALKBH1介导的tRNA去甲基化控制在翻译中具靶标的效用翻tRNAs,从而直接影响蛋白质的合成。这个过程是动态的,并被人类细胞用于对葡萄糖剥夺作出反应。这一发现打开了一个潜在的可逆tRNA甲基化影响基因表达的新范式。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,昌平区分析m1A

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