中国香港云序表观遗传组测序案例

时间:2023年08月01日 来源:

DNA甲基化是基因组一种主要的表观遗传修饰形式,它能够调控基因表达、染色质稳定性、X染色体失活及抑制病毒和外源基因的表达等生物过程,与人类的ai症、衰老、老年痴呆等许多疾病密切相关,是表观遗传学研究中的热点之一。云序生物提供新一代的DNA甲基化芯片IlluminaInfiniumMethylationEPICBeadChip测序服务(下文中以850K芯片代称)。850K甲基化芯片有效的利用高通量筛选技术,不但实现基因区域和CpG岛的覆盖,还包括CpG岛之外的甲基化位点、在人类干细胞中鉴定出了非CpG甲基化位点、miRNA启动子区域、以及tumsor和正常组织中差异表达的甲基化位点等。普遍应用于ai症、tumsor和其他复杂疾病的研究,是目前适合表观基因组全关联分析研究的全基因组DNA甲基化芯片。为环状DNA的深入研究及新型分子标志物的开发提供了新的技术手段。中国香港云序表观遗传组测序案例

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CUT&Tag技术研究蛋白质-DNA互作的优势原文:CUT&Tagforefficientepigenomicprofilingofsmallsamplesandsinglecells期刊:NatureCommunications发表时间:20190429影响因子:11.878在生物学研究中,DNA与蛋白质之间的互作是至关重要的,参与基因的表达、调控、复制、重组和修复以及RNA的转运、翻译和调控等多个过程,几乎涉及所有的生命活动。目前研究两者互作的方法很多,作者选择了传统的研究手段ChIP-seq,优化的CUT&RUN方法,以及新方法CUT&Tag共同研究组蛋白H3K27me3。通过比对实验结果,发现CUT&Tag有低的背景噪声以及强的信号。通过对H3K4me1修饰物进行分析,显示CUT&Tag的灵敏度高,实验可重复性好。中国台湾分析表观遗传组测序介绍cfDNA是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中的降解的DNA小片段。

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优势一:一站式服务。客户只需提供样本,云序生物为您完成从ctDNA提取,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。优势二:超微量ctDNA起始量要求。云序生物可以进行低至10ng的ctDNA测序。优势三:测序数据真实可靠。云序生物避免了传统5mC检测方法的GC覆盖度偏误,还拥有更完整的DNA读长,文库质量更加可靠。优势四:严格质控流程:云序生物质控流程严格,层层把关,为客户提供高准确度的结果。优势五:专业化生物信息分析:云序生物强大生物信息团队,满足客户个性化数据分析要求。

CUT&Tag 是蛋白质-DNA互作关系研究的新方法,相较于传统的 ChIP-Seq 具有以下优点:省时高效、所需的细胞量少、背景信号低、可重复性好等优点,甚至可用于单细胞水平测序。CUT&Tag 有望将蛋白与染色质 DNA 互相作用的研究变成了一种类似 PCR 反应的常规操作,对基因调控、表观遗传等领域的研究具有**性的意义。 在生物学研究中,DNA 与蛋白质之间的相互作用(DNA-Protein Interaction, DPI)是至关重要的,基因的表达、调控、复制、重组和修复,RNA的转运、翻译和调控,都离不开 DPI,几乎所有的生命活动都会涉及 DPI。云序生物环状DNA甲基化测序技术基于转座酶和m5C位点酶学转化方法。

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报道表明:ctDNA羟甲基化不但可以作为tumsor分子标志物,还可用于追溯tumsor细胞的组织来源。在医疗大趋势下,ctDNA羟甲基化检测既具有极高的科研价值,又具备推进医疗临床实践的巨大潜能,为实现tumsor临床医治的全病程管理提供强有力的支持。利用ctDNA羟甲基化测序,凭一管液体就可以进行tumsor诊断、疗效评估、实时监控、个体化用药、预测复发等,是里程碑式的新型液体活检技术。云序生物率先推出ctDNA羟甲基化测序服务,低需1ngctDNA既可进行测序。客户需提供血浆,血清或体液样本,云序生物为您完成从ctDNA提取,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。目前也习惯将巨大的环状DNA(>1Mb)称为ecDNA, 而将相对较小的环状DNA称为eccDNA。安徽服务表观遗传组测序内容

这种形式的DNA被称为环状DNA (extrachromosomal circular DNA)。中国香港云序表观遗传组测序案例

云序生物为您带来一种基于酶学方法的 DNA 甲基化测序技术 EM-seq(EnzymaticMethyl-seq),该方法结合使用多种酶,在保证 5mC 和 5hmC 在 Illumina 测序中仍被识别为 C 的前提条件下,将未发生修饰的胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(U),并在后续的扩增和测序过程中被识别为胸腺嘧啶(T)。EM-seq 有效弥补了 Bis-Seq 需要极端反应条件的缺陷,可以普遍应用于包含 ctDNA 在内的微量脆弱 DNA 样品。同时,EM-seq 得到的测序结果与 WGBS 得到的转化序列相同,因此可以使用相同的数据分析流程。运用 EM-seq 技术,需低至 10ng 的 DNA 样品便可进行单碱基精度的全基因组 5mC 修饰测序。中国香港云序表观遗传组测序案例

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