湖南甲基化测序

时间:2023年08月02日 来源:

案例2:METTL1通过m7G甲基化促进let-7MicroRNA的加工原文:METTL1Promoteslet-7MicroRNAProcessingviam7GMethylation期刊:MolecularCell影响因子:14.25剑桥大学戈登研究所和病理学系中心,借助m7GRNA甲基化测序技术,识别了A549细胞中miRNA具有m7G甲基化修饰。该研究发现Mettl1调控的pri-let7m7G修饰通过改变pri-let7中G-四重结构,进一步调控pre-let7和let7的表达,影响肺ai细胞迁移。该研究揭示了Mettl1依赖的m7G甲基化修饰可以作为调控miRNA结构、生物发生和细胞迁移的一种新的RNA修饰。m7G RNA甲基化修饰能够调节mRNA的转录。湖南甲基化测序

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样品要求 样品类型 细胞、组织或RNA,其他样本类型请电询。 样品量 a)细胞:≥2×107 b)组织:500mg - 1g c) RNA:30μg - 300μg d) 超微量满足500ng - 30μg 样品运输与保存 样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。 样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存,避免反复冻融。云序优势 一站式服务: 客户只需提供细胞、组织或RNA,云序生物为您完成从MeRIP富集,文库制备,上机测序到数据分析整套服务流程。dna 去甲基化测序在全转录范围内及tRNA水平查看基因m5C甲基化修饰水平。

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样本要求1)样品类型:细胞、新鲜组织或RNA样品。2)样品量:细胞:2×107组织:500mg-1gRNA:30-300μg,浓度不低于100ng/μL3)RNA质量要求:OD260/280:1.8~2.1浓度≥100ng/μlRNA无明显降解(28S:18S≥1.5或者RIN≥7)4)样品保存:新鲜组织可用RNA保护剂处理或液氮冻存后,-80℃保存。细胞样品,离心收集细胞沉淀后用PBS洗2遍,直接-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存。样品保存Note:样品保存期间避免反复冻融。5)样品运输:样品置于1.5mlEppendorf管或冻存管中,封口膜封好,装在塑料袋中,干冰运输。

m7GRNA甲基化是在甲基化转移酶的作用下,使RNA鸟嘌呤(G)的第七位N上加上甲基的一种修饰(N7-methylguanosine,m7G)。研究表明,m7GRNA甲基化修饰存在于各类分子中,包括:mRNA5’帽子结构、mRNA内部、pri-miRNA、转运RNA(tRNA)和核糖体RNA(rRNA)。m7GRNA甲基化修饰能够调节mRNA的转录、miRNA的生物合成和生物学功能、tRNA稳定性、18SrRNA的核内加工及成熟。m7GRNA甲基化修饰作为一类新型RNA甲基化,近两年高影响因子文章不断,是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点。云序生物一家长期做高通量测序的公司,口碑良好。

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在本研究中,作者对两个玉米(Zeamays)自交系转录组范围内的m6AmRNA分布和多聚体分析进行了平行分析,以评估m6A修饰与翻译状态的整体相关性。m6A位点普遍分布于数千个蛋白编码基因中,局限于一个共识基序内,主要富集于3’UTR区,且m6A修饰在调节替代聚腺苷酸位点的选择中发挥作用。更重要的是,m6A修饰根据其强度和基因位置显示了与翻译状态的多方面相关性。此外,在m6A修饰中观察到大量的种内变异,这种自然变异部分是由基因特异性表达和选择性剪接驱动的。总之,这些发现为鉴定玉米中受m6A修饰的转录本提供了宝贵的资源,并为更好地理解m6A在介导基因表达调控中的自然变异铺平了道路。RNA去甲基化可以提高水稻和马铃薯植株的产量和生物量。湖北甲基化筛选

m7G RNA甲基化是在甲基化转移酶的作用下,使RNA鸟嘌呤(G)的第七位N上加上甲基的一种修饰。湖南甲基化测序

RNAm6A甲基化是RNA较关键的内部修饰之一,是真核生物丰富和调节遗传信息的一种保守的转录后机制。m6A修饰具有多种生物学功能,如调控mRNA翻译、转录以及稳定性等。目前,已在多种植物中发现这种RNA修饰,参与调控不同植物的各方面生物学功能。其中,拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与m6A甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化普遍存在于拟南芥各个发育期,并揭示了RNA甲基化相关酶在特殊发育时期,如开花,叶片形成,种子发育,根部生长等过程中发挥重要作用。湖南甲基化测序

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