ctDNA甲基化

云序优势单碱基分辨可对2’-O-RNA甲基化修饰进行单碱基定位。高通量检测可对全转录组范围内的2’-O-RNA位点进行高通量地平行检测。全分子覆盖可较全地对mRNA、LncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多类RNA分子的2’-O-RNA甲基化位点进行检测。一站式服务客户需提供组织或细胞，云序生物一站式完成RNA抽提，样品预处理，建库，测序，数据分析全套流程。专业的生物信息学分析专业的生物信息学团队，能够满足客户的各类深入数据分析需求。m6A修饰在各种真核生物、各类组织细胞中普遍存在。ctDNA甲基化

Nature | miR-1的位置特异性氧化导致心脏肥大 发表时间：2020年8月5日 影响因子：42.778 Nature上发表的来自韩国高丽大学Sung Wook团队的一篇研究在氧化还原相关疾病心肌肥大的大鼠模型中对氧化的miRNA进行了特异性测序研究。 作者在氧化还原相关疾病心肌肥大的大鼠模型中对氧化的microRNA（miRNA）进行了特异性测序。结果发现8-氧代鸟嘌呤2（o8G）修饰是选择性地在miRNA的特殊区域（位置2-8）产生的，并通过o8G-A碱基互补配对来调节其他mRNA。用肾上腺素能激动剂医治后主要在miR-1（7o8G-miR-1）的第7位诱导了o8G氧化修饰。单独引入的7o8G-miR-1或7U-miR-1（其中7位的G被U取代）足以引起小鼠心脏肥大，o8G-miR-1的mRNA靶基因在受影响的表型中起作用，反之对小鼠心肌细胞7o8G-miR-1的特异性抑制可减轻心脏肥大。o8G-miR-1也与心肌病患者有关。本研究表明miRNA的位置特异性氧化可以作为表观转录机制来协调病理生理学氧化还原介导的基因表达，为研究氧化修饰在病理生理学中的作用提供了新的思路。lncRNA甲基化测序核糖RNA在2’位置上发生甲基化的化学修饰。

案例1:m6Am测序揭示了人类转录组中m6Am甲基化的动态性原文：m6Am-seqrevealsthedynamicm6Ammethylationinthehumantranscriptome期刊：NatureCommunication影响因子：13.78北京大学的研究人员开辟了一种新型的m6Am修饰RNA的测序方法，使用抗体拉取5’帽子片段富集m6Am修饰的RNA区域，再在特定生化环境条件下使用FTO酶来区分m6Am与m6A修饰，进而可达到精细至单碱基水平的m6AmRNA测序。使用该方法对人类转录组测序的结果显示，m6Am修饰的分布主要局限于mRNA5’帽子下游的翻译起始位点，并且多数具有BCA的序列motif特征（B=C/U/G）。对细胞施予热激、低氧等应激性刺激时，细胞转录组的m6Am水平有明显上升，说明RNA的m6Am动态修饰可能参与了细胞应激性反应。针对低氧环境刺激的进一步GO分析显示，m6Am水平升高的基因与内质网应激调节的生物学过程有关。

LncRNA m6Am-Exo-seq 测序服务 云序生物在国内shou批引入 m6Am-Exo-seq 测序服务，利用 5’ 核酸外切酶消除非目的性的 RNA 的片段上 m6A 修饰的信号干扰，选择性地获取 mRNA以及 LncRNA 的 5’ 帽子结构下游 m6Am 修饰富集区域的序列信息。接下来，我们对选择性获取到的 m6Am 修饰的 RNA 的片段进行反转录建库和高通量测序（测序结果将同时包含 mRNA 和 LncRNA）。通过后续的生物信息学分析，可以区分来自 mRNA 和 LncRNA 的测序片段，从而较全揭示 LncRNA和mRNA 的 m6Am 修饰位点，并推测其可能的生物学功能。而随后Cell Research也发表文章，证实环状RNA也会被m6A甲基化修饰。

PNAS|8-oxoG在mRNA中的积累可以改变哺乳动物细胞中的蛋白质翻译发表时间：2018年4月17号影响因子：9.412PNAS杂志发表了来自国家老年医学中心、北京医院研究的一篇有关O8G氧化修饰改变哺乳动物细胞中蛋白合成的研究成果。文章题目为“Transcriptionalmutagenesismediatedby8-oxoGinducestranslationalerrorsinmammaliancells”。哺乳动物细胞内形成的活性氧可以在mRNA中产生8-oxoG修饰，这一氧化修饰在基因表达过程中会导致碱基错配。本研究首先构建了一种基于超敏荧光素酶Gluc（Gussialuciferase）的报告基因检测系统，通过第二代测序技术发现当RNA中8-oxoG含量增加使U-to-G位点增加，从而诱导表达淀粉样前体蛋白的淀粉样β肽（老年痴呆的重要标志物）。该研究结果表明，8-oxoG在mRNA中的积累可以改变哺乳动物细胞中的蛋白质合成。本论文的发表为深入氧化修饰与蛋白合成间的分子机理提供了全新的研究思路！m7G RNA甲基化修饰作为一类新型RNA甲基化。新疆甲基化修饰

m6A 修饰就是真核生物 mRNA 中较常见存在的一种修饰形式，得到了常见的关注和研究。ctDNA甲基化

案例2：METTL1通过m7G甲基化促进let-7MicroRNA的加工原文：METTL1Promoteslet-7MicroRNAProcessingviam7GMethylation期刊：MolecularCell影响因子：14.25剑桥大学戈登研究所和病理学系中心，借助m7GRNA甲基化测序技术，识别了A549细胞中miRNA具有m7G甲基化修饰。该研究发现Mettl1调控的pri-let7m7G修饰通过改变pri-let7中G-四重结构，进一步调控pre-let7和let7的表达，影响肺ai细胞迁移。该研究揭示了Mettl1依赖的m7G甲基化修饰可以作为调控miRNA结构、生物发生和细胞迁移的一种新的RNA修饰。ctDNA甲基化

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