dna甲基化研究

原文：METTL4catalyzesm6AmmethylationinU2snRNAtoregulatepre-mRNAsplicing期刊：NecleicAcidsResearch影响因子：16.48新加坡南洋理工大学的研究人员通过人类全转录组RNA甲基化测序，在Mettl4敲除组与野生型对照组之间寻找出m6Am相对甲基化水平的差异位点，其中U2snRNA的第30位RNA残基有明显的m6Am修饰水平差异。进一步的FLAG-tag融合蛋白实验证明，METTL4蛋白直接催化了U2snRNA上的m6Am甲基化修饰的发生。METTL4过表达实验发现，其催化的RNA内部m6Am修饰位点具有HMAGKD的序列motif特征（H=A/C/U,M=A/C,K=G/U,D=A/G/U）。在Mettl4敲除的人类细胞中，因为U2snRNA无法完成m6Am修饰，故而对snRNA的pre-mRNA剪接功能产生了诸多影响。采用类似ELISA抑 制竞争免疫的方法，实验样本和RNA甲基化标准品与RNA甲基化抗体共孵育。dna甲基化研究

Nature | miR-1的位置特异性氧化导致心脏肥大 发表时间：2020年8月5日 影响因子：42.778 Nature上发表的来自韩国高丽大学Sung Wook团队的一篇研究在氧化还原相关疾病心肌肥大的大鼠模型中对氧化的miRNA进行了特异性测序研究。 作者在氧化还原相关疾病心肌肥大的大鼠模型中对氧化的microRNA（miRNA）进行了特异性测序。结果发现8-氧代鸟嘌呤2（o8G）修饰是选择性地在miRNA的特殊区域（位置2-8）产生的，并通过o8G-A碱基互补配对来调节其他mRNA。用肾上腺素能激动剂医治后主要在miR-1（7o8G-miR-1）的第7位诱导了o8G氧化修饰。单独引入的7o8G-miR-1或7U-miR-1（其中7位的G被U取代）足以引起小鼠心脏肥大，o8G-miR-1的mRNA靶基因在受影响的表型中起作用，反之对小鼠心肌细胞7o8G-miR-1的特异性抑制可减轻心脏肥大。o8G-miR-1也与心肌病患者有关。本研究表明miRNA的位置特异性氧化可以作为表观转录机制来协调病理生理学氧化还原介导的基因表达，为研究氧化修饰在病理生理学中的作用提供了新的思路。ac4C RNA乙酰化甲基化水平将m1A RNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育。

样品类型 细胞、组织或RNA，其他样本类型请电询。 样品量 组织：100 mg – 1 g 细胞：2× 107 个以上 RNA：30-300 μg （OD260/280：1.6-2.3；RNA无明显降解28S:18S>1.5或RIN>7） 样品保存与运输 样品保存：细胞样品或新鲜组织块（切成 5-10 mg 的小块），可用 TRIzol 或 RNA 保护剂处理，液氮冻存后，-80℃ 保存， RNA 样品可溶于乙醇或 RNA-free 的超纯水中，-80℃ 保存，样品保存期间避免反复冻融。 样品运输：样品置于 1.5 mL 离心管中，封口膜封好，埋在盛有干冰的泡沫盒中运输。

案例3：m6ARNA去甲基化酶ALKBH5通过结合lncRNA促进胶质瘤细胞期刊：CancerCell影响因子：27.43近年来，m6ARNA修饰的研究已成为当今生命科学领域前沿研究之一，不断有高影响分子文章问世。m6ARNA修饰的催化、去除以及识别的分子机理研究越来越清晰，此时人们更关心m6ARNA修饰与重大疾病之间的相关性。近期CancerCell报道了m6ARNA去甲基化酶ALKBH5在神经胶质瘤中具有生理作用。在本研究中，去甲基化酶ALKBH5在恶性胶质瘤干性样细胞表达上调，而ALKBH5高表达的胶质细胞瘤患者预后生存率更差。通过敲低ALKBH5，meRIP鉴定m6ARNA甲基化修饰模式，基因芯片检测差异表达>2倍的基因，终筛选到与细胞周期调控相关的FOXM1基因，其在GSCs的自我修复和tumsour形成中起到关键作用。RNA去甲基化可以提高水稻和马铃薯植株的产量和生物量。

案例1：m5CRNA甲基化调控mRNA出核新机制原文：5-methylcytosinepromotesmRNAexport—NSUN2asthemethyltransferaseandALYREFasanm5Creader期刊：CellResearch影响因子：15.60中科院汪海林等研究团队揭示了m5C修饰在mRNA的分布图谱规律及其对调控mRNA出核作用新机制。研究人员建立了改进的RNAm5C单碱基分辨率高通量测序与生物信息分析技术，以此揭示mRNAm5C的分布规律，并绘制了精细的m5C修饰图谱，发现m5C在mRNA的翻译起始位点下游有明显富集，并且主要分布于CG富集区域。通过分析对比人和小鼠不同组织，发现m5C在mRNA上的分布特征在哺乳动物中十分保守，而在不同组织中修饰的基因具有特异性。研究团队同时发现，在小鼠睾丸发育过程中，动态的m5C修饰基因明显富集于精子发育相关功能，提示m5C修饰参与生殖发育调控。近两年高影响因子文章不断，是继m6A修饰之后的又一表观转录组学热点。西藏pri-miRNA甲基化

m6A修饰在各种真核生物、各类组织细胞中普遍存在。dna甲基化研究

云序优势 一站式服务： 客户只需提供细胞、组织或RNA，云序生物为您完成从MeRIP富集，文库制备，上机测序到数据分析整套服务流程。 样本要求： 样品类型： 细胞、组织或RNA，其他样本类型请电询。 样品量： a) 细胞：2×107 b) 组织：100 mg-1 g c) RNA：30-300 μg（OD260/280：1.6-2.3；RNA无明显降解28S:18S>1.5或RIN>7） 样品运输及保存： 样品运输：样品置于1.5mL离心管中，封口膜封好，干冰运输。 样品保存：细胞样品或新鲜组织块可用TRIZOL或RNA保护剂处理，液氮冻存后-80℃保存;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存，避免反复冻融。dna甲基化研究

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