甘肃环状DNA平台

云序eccDNA测序优势一站式服务客户只需提供细胞、组织或基因组DNA，云序生物为您完成从eccDNA富集，文库制备，上机测序到数据分析整套服务流程。eccDNA检出率高采用多种方法高效地富集eccDNA，eccDNA检出率高。专业的生物信息学分析专业的生物信息学团队，开发了高效识别分析eccDNA的算法，满足客户的各类深入数据分析需求。样本要求样品类型：细胞、组织、基因组DNA。其它类型样品请详询。样品量：a）细胞2×107b）组织100mgc）DNA：每个样品总量不少于10ug，溶于无菌水或TE（PH=8）（OD260/280值应在1.7～2.0之间；RNA应该去除干净；不得有其它个体或其它物种的DNA污染）。样品运输及保存：样品运输：样品置于1.5mLEppendorf管中，封口膜封好，干冰运输，DNA可用冰袋运输。样品保存：细胞样品或新鲜组织块切块，液氮冻存后-80℃保存；DNA样品短期内可-20℃，避免反复冻融。环状RNA通过与宿主基因相互作用抑制DNA损伤修复。甘肃环状DNA平台

研究组织、细胞的环状DNA测序常用Circle-seq技术，Circle-seq测序中就包含柱纯化去除线性DNA，具体步骤是柱纯化去除基因组DNA、外切酶对柱纯化后产物进行酶消化、滚环扩增放大环状DNA信号以及***建库测序。因此，相对于大量存在的基因组DNA，环状DNA在细胞中的含量非常少，所以从样品中提取总DNA后，第一步需要通过柱纯化去除基因组DNA，以免测序中基因组DNA占据大部分数据量。柱纯化这一步骤十分关键，既要比较大限度地去除基因组DNA, 又需比较大限度保留环状DNA分子，尤其是避免丢失掉超长和超短的环状DNA。云序生物采用A&A Biotechnology的纯化柱，是绝大部分环状DNA高分文章中所使用的纯化柱，并且云序生物是该品牌在国内的***总代理。海南研究环状DNA母系来源的eccDNA比胚胎来源的eccDNA分子长度也更长。

组织细胞环状DNA测序游离于染色体基因组之外的DNA (extrachromosomal DNA，ecDNA)被发现常常以环状的形式存在，这种形式的DNA被称为环状DNA (extrachromosomal circular DNA，eccDNA）。目前也习惯将巨大的环状DNA(>1Mb)称为ecDNA, 而将相对较小的环状DNA称为eccDNA。 传统观点认为真核基因组通常形成稳定的线性染色体。但best新的研究表明：无论是在正常体细胞还是ai细胞中，都存在大量染色体外环状DNA。云序生物是国内best早提供 eccDNA 测序服务的公司，云序在2018年已就启动了组织细胞 eccDNA 测序服务的开发。

A&ABio的环状DNA纯化柱技术简介研究组织、细胞的环状DNA测序常用Circle-seq技术，Circle-seq测序中就包含柱纯化去除线性DNA，具体步骤是柱纯化去除基因组DNA、外切酶对柱纯化后产物进行酶消化、滚环扩增放大环状DNA信号以及best后建库测序。因此，相对于大量存在的基因组DNA，环状DNA在细胞中的含量非常少，所以从样品中提取总DNA后，第一步需要通过柱纯化去除基因组DNA，以免测序中基因组DNA占据大部分数据量。柱纯化这一步骤十分关键，既要best大限度地去除基因组DNA,又需best大限度保留环状DNA分子，尤其是避免丢失掉超长和超短的环状DNA。云序生物采用A&ABiotechnology的纯化柱，是绝大部分环状DNA高分文章中所使用的纯化柱。富集后，通过NGS测序高通量地检测细胞中所有的环状DNA分子。

eccDNA的大小从几百bp到几十Mb不等，其中较小的一种是2012年Science报道的被称作MicroDNA的特殊的eccDNA，大小只有200-400bp，有片段过短，因此不能携带完整的基因序列；但是目前MicroDNA被认为具有一些重要的调节功能，包括调控RNA的转录过程，或者通过分子海绵的作用调控一些非编码RNA的表达，同时这种DNA也被认为是可能在未来应用于液体活检来监测ai症的发生和发展的一种体外游离DNA的形式。双微体形式存在的eccDNA一般较大，100kb-3Mb等，很多可以在光学显微镜下被观察到，能够携带一些完整的基因结构和上游的调控序列。测序结果显示99%的eccDNA长度小于25Kb。分析环状DNA

对选定目标RNA分子可进行qPCR检测服务，包括引物设计与表达鉴定。甘肃环状DNA平台

传统上，环状DNA被认为only存在于原核生物以及部分病毒当中，在真核生物当中，only有半自主细胞器线粒体和叶绿体当中具有环状DNA。1964年，伊利诺伊大学的YasuoHotta和AlixBassel却在小麦的胚和公猪精ye当中发现了环状DNA，证明了这种看似结构怪异的DNA在高等植物和哺乳动物中亦存在。从1960年代至今的半个多世纪里，研究者已经在几乎所有的物种当中发现环状DNA的踪迹。因为这些环状DNA存在于染色体之外，因此也得名“染色体外环状DNA”（extrachromosomalcircularDNA，简称eccDNA）。不过，eccDNA虽然早已被证明普遍存在，但是囿于分离纯化以及测序技术的限制，学界对于eccDNA的认知，却是只知其存在，不知其来历。甘肃环状DNA平台

上海云序生物科技有限公司成立于2015-03-02，是一家专注于RNA甲基化，表观遗传学，转录组测序，外泌体的****，公司位于上海市松江区新桥镇莘砖公路518号20幢302室-2。公司经常与行业内技术**交流学习，研发出更好的产品给用户使用。公司现在主要提供RNA甲基化，表观遗传学，转录组测序，外泌体等业务，从业人员均有RNA甲基化，表观遗传学，转录组测序，外泌体行内多年经验。公司员工技术娴熟、责任心强。公司秉承客户是上帝的原则，急客户所急，想客户所想，热情服务。公司秉承以人为本，科技创新，市场先导，和谐共赢的理念，建立一支由RNA甲基化，表观遗传学，转录组测序，外泌体**组成的顾问团队，由经验丰富的技术人员组成的研发和应用团队。高通量测序，测序合成，科研，技术服务秉承着诚信服务、产品求新的经营原则，对于员工素质有严格的把控和要求，为RNA甲基化，表观遗传学，转录组测序，外泌体行业用户提供完善的售前和售后服务。