青海修饰环状DNA

案例1：环状DNA促进染色质的开放和促ai基因的表达研究团队首先结合二代全基因组测序和光学匹配（opticalmapping），从序列的角度发现，扩增出来的环状DNA形成了环状结构,不only证实了tumour中的环状DNA确实是环状的，还证明了环状DNA的染色质是高度开放的，从而进一步阐释了环状DNA能大量表达ai基因和其环状结构介导的超远距离相互作用，这也表明了环状DNA可能形成了新的基因调控回路和在驱动tumour异质性的机制研究中发挥着重大的作用。2019年关于环状RNA的国自然审批金额高达8000多万。青海修饰环状DNA

2017年：Nature，17种tumour的2572种细胞系的全基因组测序分析，证明eccDNA在tumour组织中普遍存在；2018年：NatureCommunications，健康人的肌肉和血液细胞中分离到超过十万种eccDNA分析，它们绝大部分都携带基因或基因片段，证明eccDNA在正常组织中是普遍存在的；2019年：NatureGenetics,eccDNA驱动神经母细胞瘤基因组重塑；2019年：Nature，eccDNA促进染色质可接近性和致ai基因的高表达；2019年：Cell，功能性增强子自造成染色体外ai基因的扩增。宁夏云序生物环状DNA云序采用多种方法高效地富集和扩增环状DNA。

传统上，环状DNA被认为only存在于原核生物以及部分病毒当中，在真核生物当中，only有半自主细胞器线粒体和叶绿体当中具有环状DNA。1964年，伊利诺伊大学的YasuoHotta和AlixBassel却在小麦的胚和公猪精ye当中发现了环状DNA，证明了这种看似结构怪异的DNA在高等植物和哺乳动物中亦存在。从1960年代至今的半个多世纪里，研究者已经在几乎所有的物种当中发现环状DNA的踪迹。因为这些环状DNA存在于染色体之外，因此也得名“染色体外环状DNA”（extrachromosomalcircularDNA，简称eccDNA）。不过，eccDNA虽然早已被证明普遍存在，但是囿于分离纯化以及测序技术的限制，学界对于eccDNA的认知，却是只知其存在，不知其来历。

云序生物是国内best早提供eccDNA测序服务的公司，云序在2018年已就启动了组织细胞eccDNA测序服务的开发，随后又在国内first发血清血浆环状DNA测序服务。迄今为止，我们已经完成上千例样品的eccDNA测序，积累了丰富的项目经验，样品类型涵盖：组织﹑细胞﹑血清﹑血浆﹑尿液等，物种涵盖：人﹑小鼠﹑大鼠﹑拟南芥﹑果蝇﹑酵母﹑非洲爪蟾等。云序生物采用A&ABiotechnology公司的环状DNA纯化柱，是绝大部分环状DNA高分文章中所使用的纯化柱，并且云序生物是该品牌在国内的总代理。今年，云序生物又在港中大教授卢煜明（Y.M.DennisLo）发表的Tn5转座酶法的基础上，在全国范围内率先推出了血清血浆eccDNA甲基化测序服务。环状DNA在不同基因区域、重复序列元件区域分布。

eccDNA新功能 作者分析测序数据发现神经母细胞瘤基因组中多数染色体内和染色体间基因的重排与eccDNA区域相吻合，支持了eccDNA介导基因组重塑的猜想。而且2018年文章报道在对546个儿科tumour基因组重排情况数据收集分析发现其中9%的儿科tumour的eccDNA存在树状重排模式，由此作者推测eccDNA衍生的树形重排可以dai表eccDNA整合到基因组中形成嵌合体。作者发现环状整合位点以及嵌合体中富集了tumour相关基因。检测整合对于基因表达的影响发现eccDNA整合激huo原ai基因的表达扩增以及异常融合基因表达。这些研究结果为儿童ai症的发病机理研究提供了一个方向，同时也有望成为ai症的诊断标志。对整体或单独样本中的环状DNA在各染色体上的数量、密度进行统计和展示。重庆环状DNA分析

富集后，通过NGS测序高通量地检测细胞中所有的环状DNA分子。青海修饰环状DNA

近年来，由于实验技术和生信分析技术的进步，eccDNA 相关研究发表 SCI 论文的数量呈井喷之势增长。PubMed 搜索数据显示，2017 年 eccDNA 相关论文全世界only 4 篇，后续几年逐步增长为 6、7、10 篇，而到了现在的 2021 年，only before 十个月，就已经有 15 篇 eccDNA 相关论文见刊，其中还不乏 Nature、Methods in Molecular Biology、Nucleic Acids Research、Molecular Cancer 等高分期刊。见微知著，eccDNA 虽小，但很可能成为下一个生命科学的科研热点。云序生物是国内best早提供 eccDNA 测序服务的公司，云序在2018年已就启动了组织细胞 eccDNA 测序服务的开发。青海修饰环状DNA

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