上海项目表观遗传组测序案例

时间:2022年01月19日 来源:

案例1:解析组蛋白修饰 原文:Epigenomic analysis of multilineage differentiation of human embryonic stem cells 期刊:Cell 影响因子:31.39 为了研究胚胎发育过程中的表观遗传调控,本文结合ChIP测序、甲基化测序和转录组测序,系统性地调查了人类胚胎干细胞在分化为不同类型细胞过程中的染色体修饰、DNA甲基化修饰以及转录组变化。通过各种测序数据的联合分析发现:胚胎发育早期活跃的启动子CpG含量比较高,并且在不表达的细胞中它们往往具有组蛋白H3K27me3修饰,从而维持抑 制状态。相反地,胚胎发育后期表达的基因的启动子CpG含量比较低,并且主要通过DNA甲基化维持抑 制状态。 在治 疗过程中,ctDNA甲基化水平与ai细胞数量呈正比。上海项目表观遗传组测序案例

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本文作者利用850K芯片分别检测健康表皮、光化性角化病表皮、皮肤鳞状细胞ai表皮的DNA甲基化状态,发现AK甲基化显示出经典的tumsor甲基化的结构与cSCC的结构高度相似,通过降低DNA甲基化年龄、非CpG岛甲基化、干细胞相关的角蛋白和增强子甲基化模式进一步分析,证实了干细胞甲基化的典型特征。同时还发现这些特征只在一半的样本中检测到,而另一半则显示出与健康的表皮关系更密切。这些都表明AK 和 cSCC 存在两种亚型,并分别起源于不同的角质形成细胞分化阶段。总而言之,本文利用高通量技术手段研究鳞状细胞aiDNA甲基化在细胞分化过程中特征性分析,为其临床学的应用奠定了基础。ai症组中ctDNA甲基化水平与正常组差异明显。天津服务表观遗传组测序是什么

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