武清区云序m1A

时间:2022年02月12日 来源:

1. m1A-MAP技术及其在tRNA中的验证,利用m1A会导致错配的特性,采用去甲基化酶AlkB来实现m1A去甲基化,对比(-)去甲基化酶和(+)去甲基化酶的结果,捕捉碱基突变的信号,来实现m1A RNA修饰位点单碱基分辨率的鉴定,为了增加检测灵敏度,作者还利用抗体富集的方式来特异性富集m1A的RNA的片段,作者将这个方法命名为m1A-MAP。在哺乳动物中,已知tRNA第9,14和58位会发生m1A RNA修饰,通过这个技术,细胞质中tRNAAsp(GUC)第9位及tRNA第58位都被检测到m1A RNA修饰,以上结果都证实该方法确实可有效单碱基分辨率的鉴定m1A RNA修饰位点。RNA甲基化富集峰可视化图。武清区云序m1A

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m1ARNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰。研究表明,m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰,近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。m1A修饰作为一类新型RNA甲基化,其功能和机制都亟待挖掘。与m6ARNA检测方式一致,针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术,抗体富集的技术原理如下:将m1ARNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA的片段进行共孵育,抓取有甲基化修饰的片段进行测序;同时需要平行测序一个对照(Input)样本,对照样本为未进行IP反应的RAN片段,对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。北辰区测序m1Am1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化。

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这一分布规律与m6A(真核细胞mRNA中广fan的甲基化修饰)截然不同,后者主要集中在mRNA的靠后一个外显子上,并且对mRNA的翻译、定位、稳定性等多个过程进行调控。该研究进一步鉴定了m1A修饰的一个去甲基化酶ALKBH3,并发现了转录组中ALKBH3的近千个作用位点。因此,该研究不但揭示了m1A的广fan存在、绘制了转录组中m1A RNA修饰的谱图,也为m1A修饰参与基因表达调控的研究提供了重要工具。云序生物是一家比较不错的做RNA甲基化的公司,他们的RNA甲基化口碑很好,

云序生物作为国内很早做m6A的科研平台,至今用户已发表15+篇m6A相关文章,其中多篇影响因子超过10分,成为国内m6A测序专业的服务平台。云序生物RNA修饰高通量测序产品覆盖面广,包括编码mRNA和非编码lncRNA,circRNA,microRNA等分子。云序生物既提供针对单个分子的m6A测序,也提供一次检测多种RNA分子m6A修饰的全转录组测序,此外公司长期致力于提供you质前沿表观研究测序产品,结合科研热点继m6A、m5C、m1A之后,隆重推出多款RNA新修饰,不仅有m7G测序,还包括m3C测序、ac4C乙酰化测序和2'-O-甲基化测序,打造了全修饰和全分子覆盖的研究平台。如今云序用户m6A,m5C、m1A文章接连发表,期待云序用户其他RNA修饰研究的发表!RNA甲基化位点motif分析。

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02 检测整体m1A RNA修饰水平, LC-MS/MS检测整体RNA修饰水平,准确高效,可以实现一次检测,9类修饰水平检测,一步到位。03 m1A RNA修饰上游酶的筛选, m1A RNA修饰相关酶PCR芯片,寻找上游直接调控m1A RNA甲基化的甲基转移酶。04 m1A RNA修饰靶基因验证,meRIP-qPCR,云序提供各类不同修饰的meRIP-qPCR服务,可针对mRNA,lncRNA,环状RNA等不同类型的RNA分子进行检测,低通量验证RNA修饰靶基因表达水平。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。差异甲基化区的GO和KEGG信号通路分析。大兴区m1A平台

与m6A RNA检测方式一致,针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术。武清区云序m1A

Molecular Cancer (IF=10.679)杂志刊登了m6A修饰研究:m6A依赖的糖酵解增强结直肠ai(CRC)发生。该文章采用多组学联合应用技术检测了Mettl3-KO(m6A甲基化转移酶敲除细胞株)和WT HCT116(结直肠ai细胞株)甲基化修饰,这项研究揭示METTL3通过m6A-IGF2BP2/3-依赖性机制稳定HK2和SLC2A1 (GLUT1)在CRC中表达,表明m6A修饰的糖酵解途径可以促进结直肠ai的发展,同时为以METTL3及其途径为靶点高糖代谢的CRC患者提供了合理的zhi疗靶点和zhi疗方向。m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化,即RNA分子腺嘌呤di1位氮原子上的甲基化修饰(N1-methyladenosine,m1A)。武清区云序m1A

上海云序生物科技有限公司总部位于上海市松江区新桥镇莘砖公路518号20幢302室-2,是一家上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。的公司。云序生物拥有一支经验丰富、技术创新的专业研发团队,以高度的专注和执着为客户提供RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体。云序生物不断开拓创新,追求出色,以技术为先导,以产品为平台,以应用为重点,以服务为保证,不断为客户创造更高价值,提供更优服务。云序生物创始人李巍,始终关注客户,创新科技,竭诚为客户提供良好的服务。

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