浙江服务表观遗传组测序价格

时间:2022年02月13日 来源:

不同于已经得到深入研究的基因组 DNA 的表观遗传修饰,ctDNA 的 5mC 甲基化修饰研究仍然是一个未被充分探索的领域,对于科研者来说是一个尚待挖掘的金矿。既然如此,那我们是不是可以按图索骥,直接将基因组 DNA 甲基化修饰研究的传统方法照搬到 ctDNA 的5mC 甲基化修饰研究上来呢?答案是否定的:因为 ctDNA 含量低、缺乏染色质结构的保护,若直接将研究基因组 DNA 的 5mC 修饰的传统方法应用于 ctDNA,则会遇到南橘北枳的困境,云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。环状DNA连登《Nature》《Cell》等期刊,成为了很有潜力的科研新热点。浙江服务表观遗传组测序价格

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多次实验之间的一致性更高 EM-seq 文库在不同起始量之间的相关性都很高,表明 EM-seq 检出的数据具有很好的可重复性,且甲基化检测灵敏度不会随着起始量的减少而降低;相形之下,不同的 WGBS 文库之间的相关性就不够理想。更精准地检测转录起始位点的甲基化数据 在低表达基因的转录起始位点附近,胞嘧啶一般会发生甲基化修饰,但由于 WGBS 法倾向于低估 GC 区域,因此难免遗漏一些转录起始位点附近的甲基化修饰;EM-seq 因为其出色的 GC 覆盖均一性,可以更精准地检测转录起始位点的甲基化数。宁夏修饰表观遗传组测序平台云序生物环状DNA甲基化测序技术基于转座酶和m5C位点酶学转化方法。

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案例:hMeDIP-seq揭示了心机细胞发育与肥大过程中的基因表达与5hmC有关 DNA hydroxymethylation controls cardiomyocyte gene expression in development and hypertrophy[J].Greco C M, Kunderfranco P, Rubino M, et al . Nature Communications, 2016, 7:12418. 5-hmC(DNA羟甲基化)在基因体上富集能够激huo基因的转录调控,但对启动子和远端调节区的功能不太清楚。本文主要是以不同发育时间点和心肌肥大的心肌细胞为实验载体,主要剖析5-hmC在心肌细胞(CMC)基因组中的分布,并揭示了5-hmC在心脏发育和疾病中的作用机制。1)通过DNA羟甲基化测序,作者发现在心脏发育过程中,CMCs中的5-hmC在基因间区域逐渐减少,并向GB上富集(图1)。2)通过DNA羟甲基化和转录组关联分析,作者得出5-hmC是CMCs发育和肥大过程中的重要调控因子(图2)。

技术简介 DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一,我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine, 5mC),却不知道随着测序技术的快速发展,一种新的DNA甲基化修饰类型—DNA-6mA甲基化已经成为表观遗传学领域的研究热点。 云序生物率先开发了DNA-6mA测序技术—6mA-IP-seq。其原理类似于MeDIP的免疫共沉淀测序技术,利用特异性抗体富集6mA的片段,扩增后进行高通量测序及甲基化分析,以较小的数据量,快速地绘制全基因组DNA甲基化水平的图谱。客户需提供血浆,血清或体液样本,云序生物为您完成从ctDNA提取。

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均一的双核苷酸分布 由于“GC 覆盖度偏误”的存在,在连续双核苷酸的检出效率方面,WGBS 对于不同的双核苷酸存在较严重的偏误,而 EM-seq 则能展示出均一的覆盖情况。更强的匹配率和更低的重复率 相比于 WGBS,EM-seq 测序结果与参考基因组的匹配率更高,同时重复率更低。用更少的测序检出更多的 CpG 岛 同等测序覆盖深度的情形下,EM-seq 所发现的 CpG 数目要远多于 WGBS,在这其中有很大比例的 CpG 位点是只能能用 EM-seq 法才能检测到的。云序生物提供的MeDIP测序服务,将甲基化DNA免疫共沉淀技术(MeDIP)和高通量测序相结合,能够帮助客户快速地获取全基因组范围内的DNA甲基化图谱,并比较不同样品中的甲基化分布差异。而将相对较小的环状DNA称为eccDNA。陕西表观遗传组测序分析

该团队基于转座酶和m5C位点酶学转化方法开发出了环状DNA甲基化测序技术。浙江服务表观遗传组测序价格

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上海云序生物科技有限公司总部位于上海市松江区新桥镇莘砖公路518号20幢302室-2,是一家上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。的公司。云序生物作为上海云序生物科技有限公司于2015年3月成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的****。的企业之一,为客户提供良好的RNA甲基化,表观遗传学,转录组测序,外泌体。云序生物致力于把技术上的创新展现成对用户产品上的贴心,为用户带来良好体验。云序生物始终关注商务服务行业。满足市场需求,提高产品价值,是我们前行的力量。

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